(9H-fluoren-9-yl)methyl (S)-(1-amino-3-(tert-butoxy)-1-oxopropan-2-yl)carbamate | 518012-43-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: (9H-fluoren-9-yl)methyl (S)-(1-amino-3-(tert-butoxy)-1-oxopropan-2-yl)carbamate
• 英文别名: 9H-fluoren-9-ylmethyl N-[(2S)-1-amino-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-1-oxopropan-2-yl]carbamate
• CAS: 518012-43-6
• 化学式: C₂₂H₂₆N₂O₄
• 分子量: 382.459
• InChiKey: PAVPFWJXUVOUMJ-IBGZPJMESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.9
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  90.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (9H-fluoren-9-yl)methyl (S)-(1-amino-3-(tert-butoxy)-1-oxopropan-2-yl)carbamate 在 劳森试剂 、 potassium hydrogencarbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙二醇二甲醚 为溶剂， 反应 41.0h， 生成 methyl (S)-2-(1-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-2-(tert-butoxy)ethyl)thiazole-4-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  用于从头发现蛋白水解稳定硫肽的紧凑重编程遗传密码

  摘要：

  硫肽是一组结构复杂的肽类天然产物，在生物工程应用中具有广阔的前景。先前建立的硫肽/mRNA展示平台能够从头发现具有设计生物活性的类似天然产物的硫肽。然而，与天然硫肽相比，所发现的结构主要由蛋白氨基酸组成，这在许多情况下导致代谢稳定性较低。在这里，我们重新开发了该平台，并证明在 mRNA 展示库中利用紧凑的重编程遗传密码可以发现主要由非蛋白结构元件组成的硫肽。我们通过针对 Traf2 和 NCK 相互作用激酶 (TNIK) 进行亲和力选择来证明我们设计的可行性。实验鉴定出一系列与目标蛋白具有高亲和力（最佳K D = 2.1 nM）和激酶抑制活性（最佳IC 50 = 0.15 μM）的硫肽。这些发现的化合物在 18 个残基大环中含有多达 15 个非蛋白氨基酸，在人血清中表现出高代谢稳定性，半衰期长达 99 小时。 TNIK 与发现的硫肽复合物的 X 射线共晶结构揭示了非蛋白结构单元如何促进靶标

  DOI：

  10.1021/jacs.3c12037
• 作为产物：
  描述：

  在 ammonium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 生成 (9H-fluoren-9-yl)methyl (S)-(1-amino-3-(tert-butoxy)-1-oxopropan-2-yl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  用于从头发现蛋白水解稳定硫肽的紧凑重编程遗传密码

  摘要：

  硫肽是一组结构复杂的肽类天然产物，在生物工程应用中具有广阔的前景。先前建立的硫肽/mRNA展示平台能够从头发现具有设计生物活性的类似天然产物的硫肽。然而，与天然硫肽相比，所发现的结构主要由蛋白氨基酸组成，这在许多情况下导致代谢稳定性较低。在这里，我们重新开发了该平台，并证明在 mRNA 展示库中利用紧凑的重编程遗传密码可以发现主要由非蛋白结构元件组成的硫肽。我们通过针对 Traf2 和 NCK 相互作用激酶 (TNIK) 进行亲和力选择来证明我们设计的可行性。实验鉴定出一系列与目标蛋白具有高亲和力（最佳K D = 2.1 nM）和激酶抑制活性（最佳IC 50 = 0.15 μM）的硫肽。这些发现的化合物在 18 个残基大环中含有多达 15 个非蛋白氨基酸，在人血清中表现出高代谢稳定性，半衰期长达 99 小时。 TNIK 与发现的硫肽复合物的 X 射线共晶结构揭示了非蛋白结构单元如何促进靶标

  DOI：

  10.1021/jacs.3c12037

文献信息

• Development and Evaluation of Novel Phosphotyrosine Mimetic Inhibitors Targeting the Src Homology 2 Domain of Signaling Lymphocytic Activation Molecule (SLAM) Associated Protein
  作者：Chi-Yuan Chu、Chun-Ping Chang、Yun-Ting Chou、Handoko、Yi-Ling Hu、Lee-Chiang Lo、Jing-Jer Lin

  DOI：10.1021/jm301610q

  日期：2013.4.11

  Specific interactions between Src homology 2 (SH2) domain-containing proteins and the phosphotyrosine-containing counterparts play significant role in cellular protein tyrosine kinase (PTK) signaling pathways. The SH2 domain inhibitors could potentially serve as drug candidates in treating human diseases. Here we have incorporated a novel phosphotyrosine mimetic, which is an unusual amino acid carrying

  含Src同源2（SH2）域的蛋白质与含磷酸酪氨酸的对应物之间的特异性相互作用在细胞蛋白质酪氨酸激酶（PTK）信号传导途径中起着重要作用。SH2域抑制剂可以潜在地作为治疗人类疾病的候选药物。在这里，我们将新型磷酸酪氨酸模拟物（一种带有环saligenyl（cycloSal）磷酸二酯部分的不寻常氨基酸）掺入二肽中，以研究其对含SH2结构域蛋白的抑制作用。还建立了基于板的测定法，以筛选破坏SLAM磷酸肽（信号淋巴细胞活化分子）与其相互作用蛋白SAP（SLAM相关蛋白）之间相互作用的抑制剂。我们用IC 50鉴定了许多抑制剂值在17–35μM的范围内，这意味着带有cycloSal磷酸二酯的氨基酸可以模拟磷酸酪氨酰残基。我们的结果也提高了将新开发的磷酸酪氨酸模拟部分整合到为其他含SH2结构域蛋白设计的抑制剂中的可能性。
• Capturing Intermediates in the Reaction Catalyzed by NosN, a Class C Radical <i>S</i>-Adenosylmethionine Methylase Involved in the Biosynthesis of the Nosiheptide Side-Ring System
  作者：Bo Wang、Joseph W. LaMattina、Savannah L. Marshall、Squire J. Booker

  DOI：10.1021/jacs.8b13157

  日期：2019.4.10

  of Glu6 of the core peptide and the nascent C1 unit. However, exactly when NosN performs its function during the biosynthesis of nosiheptide is unknown. Herein, we report the syntheses and use of three peptide mimics as potential substrates designed to address the timing of NosN's function. Our results show that NosN clearly closes the side ring before NosO forms the pyridine ring and most likely before

  那西肽是一种核糖体合成和翻译后修饰的硫肽天然产物，具有抗菌、抗癌和免疫抑制特性。它包含一个双环结构，由一个大环和一个独特的侧环系统组成，该系统包含一个 3,4-二甲基吲哚酸桥，分别通过酯键和硫酯键连接到核心肽的 Glu6 和 Cys8 的侧链。除了由 nosM 基因编码的结构肽外，侧环结构的生物合成还需要 NosI、-J、-K、-L 和 -N 的作用。NosN 被注释为 C 类自由基 S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 甲基化酶，但它的真正功能是将 C1 单元从 SAM 转移到 3-甲基-2-吲哚酸 (MIA) 的 C4 上，同时在核心肽的 Glu6 羧酸盐和新生的 C1 单元之间形成键。然而，在那西肽的生物合成过程中，NosN 究竟何时发挥其功能尚不清楚。在此，我们报告了三种肽模拟物作为潜在底物的合成和使用，旨在解决 NosN 功能的时间问题。我们的结果表明，NosN 在 NosO 形成吡啶环之前清楚地关闭了侧环，最有可能在
• Thiopeptide Pyridine Synthase TbtD Catalyzes an Intermolecular Formal Aza-Diels–Alder Reaction
  作者：Jonathan W. Bogart、Albert A. Bowers

  DOI：10.1021/jacs.8b11852

  日期：2019.2.6

  Thiopeptide pyridine synthases catalyze a multistep reaction involving a unique and nonspontaneous intramolecular aza-[4 + 2] cycloaddition between two dehydroalanines to forge a trisubstituted pyridine core. We discovered that the in vitro activity of pyridine synthases from the thiocillin and thiomuracin pathways are significantly enhanced by general base catalysis and that this broadly expands the

  硫肽吡啶合酶催化多步反应，包括两个脱氢丙氨酸之间独特且非自发的分子内氮杂-[4 + 2] 环加成，以形成三取代的吡啶核心。我们发现来自硫西林和硫胞嘧啶途径的吡啶合酶的体外活性通过一般碱催化显着增强，并且这广泛地扩展了酶的底物耐受性。值得注意的是，除了其同源的分子内反应之外，TbtD 还能够进行分子间环化，这突显了其作为生物催化剂的多功能性。这些数据提供了吡啶合酶使用双位点底物识别模型来接合和处理其底物的证据。
• Dehydration of Chiral α-Amides to Chiral α-Nitriles Under the Appel Reaction Conditions
  作者：Shekharappa、L. Roopesh Kumar、C. Srinivasulu、Vommina V. Sureshbabu

  DOI：10.1007/s10989-020-10101-y

  日期：2021.3

  Nα-protected amino acid amides to corresponding nitriles with neither harsh condition nor catalyst. Graphic Abstract Nα-protected amino acid amides were efficiently transformed to Nα-protected amino acid nitriles employing I2, PPh3, and NMM under mild reaction conditions. Fmoc, Boc and Cbz-protected amino acid amides were converted into their corresponding nitriles groups. Side chain protected amino acid amides

  N的有效的合成α -保护的氨基腈选自N α -保护的使用pH值氨基酰胺3 P，I 2和NMM被描述。受Fmoc，Z和Boc保护的各种氨基酸酰胺可方便地以高收率转化为腈。侧链保护的氨基酸酰胺具有良好的耐受性，并获得了良好的产物收率。该协议用作温和的一个，对于N的自由外消旋转换几个可用的，方法中α -保护的氨基酸酰胺与既不苛刻的条件，也没有催化剂相应的腈。 图形摘要 Ñ α -保护的氨基酸酰胺被有效转化成N α采用我-保护氨基酸腈2，PPH 3，和NMM温和的反应条件下进行。Fmoc，Boc和Cbz保护的氨基酸酰胺被转化为相应的腈基。侧链保护的氨基酸酰胺也容易以良好的产率转化为其相应的腈。
• Cysteine-Free Intramolecular Ligation of N-Sulfanylethylanilide Peptide Using 4-Mercaptobenzylphosphonic Acid: Synthesis of Cyclic Peptide Trichamide
  作者：Akira Otaka、Keisuke Aihara、Tsubasa Inokuma、Takahisa Jichu、Zhenjian Lin、Feixue Fu、Kosuke Yamaoka、Akira Shigenaga、David Hutchins、Eric Schmidt

  DOI：10.1055/s-0036-1589055

  日期：2017.9

  thiazole-containing cyclic peptide isolated from bloom-forming cyanobacterium Trichodesmium erythraeum. In this cysteine-free ligation, 4-mercaptobenzylphosphonic acid (MBPA) functions as a dual promoter both for the N–S acyl-transfer-mediated activation of the SEAlide unit and for subsequent ligation. Furthermore, we established a high-yielding route to enantiomerically pure thiazole amino acids using a one-pot

  开发了基于 N-硫基乙基苯胺 (SEAlide) 的连接，用于制备三甲酰胺，这是一种从形成开花的蓝细菌 Trichodesmium erythraeum 中分离出的含噻唑环肽。在这种不含半胱氨酸的连接中，4-巯基苄基膦酸 (MBPA) 作为双启动子，用于 N-S 酰基转移介导的 SEAlide 单元的激活和随后的连接。此外，我们使用一锅 Hantzsch 工艺建立了对映异构纯噻唑氨基酸的高产路线。