sodium ((2R,3S,5R)-5-(4-amino-5-(5-formylthiophen-2-yl)-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl hydrogen phosphate | 1379798-19-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: sodium ((2R,3S,5R)-5-(4-amino-5-(5-formylthiophen-2-yl)-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl hydrogen phosphate
• CAS: 1379798-19-2
• 化学式: C₁₄H₁₅N₃O₈PS*Na
• 分子量: 439.318
• InChiKey: CNNITSROIBVCET-HXINOFRHSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.5
• 重原子数：
  28.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  177.03
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S)-2-(乙酰氨基)-6-氨基-己酰胺盐酸盐(1:1) 、 sodium ((2R,3S,5R)-5-(4-amino-5-(5-formylthiophen-2-yl)-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl hydrogen phosphate 在 sodium cyanoborohydride 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 49.0h， 以55%的产率得到sodium ((2R,3S,5R)-5-(5-(5-((((S)-5-acetamido-6-amino-6-oxohexyl)amino)methyl)thiophen-2-yl)-4-amino-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl hydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  醛键连接的核苷酸和DNA的合成以及它们通过还原胺化与赖氨酸和肽的生物缀合

  摘要：

  制备了5-（5-甲酰基噻吩基），5-（4-甲酰基苯基）和5-（2-氟-5-甲酰基苯基）胞嘧啶2'-脱氧核糖核苷单（dC R MP）和三磷酸（dC R TP）通过将5碘胞嘧啶核苷酸与相应的甲酰基芳基硼酸的Suzuki-Miyaura水溶液交叉偶联。的直流- [R TP小号分别为DNA聚合酶优良底物，并通过引物延伸或PCR被并入DNA中。研究并优化了dC R MP s型模型的赖氨酸或含赖氨酸的三肽的还原胺化作用。在磷酸盐水溶液（pH 6.7）中，三肽III的还原胺化反应的收率 高达25％。含醛的DNA与含赖氨酸的三肽的生物缀合是通过在水性磷酸盐缓冲液中还原胺化实现的，收率高达90％。

  DOI：

  10.1002/chem.201103270
• 作为产物：
  描述：

  5-碘-2'-脱氧胞苷 在 磷酸三甲酯 、 trisodium tris(3-sulfophenyl)phosphine 、 palladium diacetate 、 caesium carbonate 、 三氯氧磷 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 sodium ((2R,3S,5R)-5-(4-amino-5-(5-formylthiophen-2-yl)-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl hydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  醛键连接的核苷酸和DNA的合成以及它们通过还原胺化与赖氨酸和肽的生物缀合

  摘要：

  制备了5-（5-甲酰基噻吩基），5-（4-甲酰基苯基）和5-（2-氟-5-甲酰基苯基）胞嘧啶2'-脱氧核糖核苷单（dC R MP）和三磷酸（dC R TP）通过将5碘胞嘧啶核苷酸与相应的甲酰基芳基硼酸的Suzuki-Miyaura水溶液交叉偶联。的直流- [R TP小号分别为DNA聚合酶优良底物，并通过引物延伸或PCR被并入DNA中。研究并优化了dC R MP s型模型的赖氨酸或含赖氨酸的三肽的还原胺化作用。在磷酸盐水溶液（pH 6.7）中，三肽III的还原胺化反应的收率 高达25％。含醛的DNA与含赖氨酸的三肽的生物缀合是通过在水性磷酸盐缓冲液中还原胺化实现的，收率高达90％。

  DOI：

  10.1002/chem.201103270

文献信息

• Direct Polymerase Synthesis of Reactive Aldehyde-Functionalized DNA and Its Conjugation and Staining with Hydrazines
  作者：Veronika Raindlová、Radek Pohl、Miloslav Šanda、Michal Hocek

  DOI：10.1002/anie.200905556

  日期：2010.2.1

  Reactive aldehyde‐modified DNA was prepared in two steps by Suzuki cross‐coupling of halogenated nucleoside triphosphates (dNTPs) with 4‐formylthiophene‐2‐boronic acid and subsequent polymerase incorporation of the modified nucleotides into DNA (see scheme; PEX=primer extension, PCR=polymerase chain reaction). Formation of hydrazones with arylhydrazines under aqueous conditions was used for DNA staining

  反应性醛修饰的DNA分两步制备，方法是将卤代三磷酸核苷（dNTP）与4-甲酰基噻吩-2-硼酸进行Suzuki交叉偶联，然后将修饰的核苷酸掺入DNA中进行聚合酶掺入（参见方案； PEX =引物延伸， PCR =聚合酶链反应）。在水性条件下与芳基肼形成用于DNA染色。