N-[4-[bis(1H-benzimidazol-2-ylmethyl)amino]-4-oxobutyl]-1-methyl-4-[[1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carbonyl)amino]pyrrole-2-carbonyl]amino]pyrrole-2-carboxamide | 1023280-71-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-[4-[bis(1H-benzimidazol-2-ylmethyl)amino]-4-oxobutyl]-1-methyl-4-[[1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carbonyl)amino]pyrrole-2-carbonyl]amino]pyrrole-2-carboxamide
• CAS: 1023280-71-8
• 化学式: C₃₈H₃₈N₁₂O₆
• 分子量: 758.797
• InChiKey: QXPQLMAUEUFAIK-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  56
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  226
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  4-[[1-Methyl-4-[[1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carbonyl)amino]pyrrole-2-carbonyl]amino]pyrrole-2-carbonyl]amino]butanoic acid 、 bis(benzimidazol-2-ylmethyl)amine 在 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.0h， 以60%的产率得到N-[4-[bis(1H-benzimidazol-2-ylmethyl)amino]-4-oxobutyl]-1-methyl-4-[[1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carbonyl)amino]pyrrole-2-carbonyl]amino]pyrrole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Zn（II）-IDB复合物的合成及生物学评估，该复合物附加有低聚聚酰胺作为有效的人工核酸酶。

  摘要：

  已经成功合成，表征和评估了锌（II）配合物，该配合物包含通过柔性接头缀合的低聚聚酰胺和双（2-苯并咪唑基甲基）胺（IDB），并被评估为DNA裂解剂。通过电泳研究了这些复合物对DNA的切割活性。结果表明，与不使用低聚聚酰胺的复合物相比，锌（II）配合物的切割活性增强。特别是，在高反应浓度（1.2mM）下，Zn（II）复合物可以切割具有一定选择性的质粒DNA。此外，光谱数据表明具有寡聚酰胺主链的Zn（II）复合物具有富含AT（腺嘌呤和胸腺嘧啶）的序列偏好。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2008.09.074

文献信息

• Synthesis and biological evaluation of the Zn (II)–IDB complexes appended with oligopolyamide as potent artificial nuclease
  作者：Chao Li、Ren-Zhong Qiao、Ya-Qin Wang、Yu-Fen Zhao、Rong Zeng

  DOI：10.1016/j.bmcl.2008.09.074

  日期：2008.11

  The zinc (II) complexes, which contain oligopolyamide and bis(2-benzimidazolylmethyl)amine (IDB) conjugated by flexible linker, have been successfully synthesized, characterized, and evaluated as DNA cleavage agents. The cleavage activity of these complexes on DNA was studied by electrophoresis. The results showed that the cleavage activity of zinc (II) complexes was enhanced comparing with those without

  已经成功合成，表征和评估了锌（II）配合物，该配合物包含通过柔性接头缀合的低聚聚酰胺和双（2-苯并咪唑基甲基）胺（IDB），并被评估为DNA裂解剂。通过电泳研究了这些复合物对DNA的切割活性。结果表明，与不使用低聚聚酰胺的复合物相比，锌（II）配合物的切割活性增强。特别是，在高反应浓度（1.2mM）下，Zn（II）复合物可以切割具有一定选择性的质粒DNA。此外，光谱数据表明具有寡聚酰胺主链的Zn（II）复合物具有富含AT（腺嘌呤和胸腺嘧啶）的序列偏好。