6-hydroxy-3-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5,6,7,8-tetrahydropyrimido[1,2-a]purin-10(3H)-one-1,3,4,5,9-15N5 | 1193686-93-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: 6-hydroxy-3-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5,6,7,8-tetrahydropyrimido[1,2-a]purin-10(3H)-one-1,3,4,5,9-15N5
• CAS: 1193686-93-9
• 化学式: C₁₃H₁₇N₅O₅
• 分子量: 328.275
• InChiKey: MYOOJAZCZCELNT-HDYMSZLASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.63
• 重原子数：
  23.0
• 可旋转键数：
  2.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  134.66
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  丙烯醛 、 ¹⁵N₅-2′-deoxyguanosine 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 6-hydroxy-3-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5,6,7,8-tetrahydropyrimido[1,2-a]purin-10(3H)-one-1,3,4,5,9-15N5 、 8-hydroxy-3-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5,6,7,8-tetrahydropyrimido[1,2-a]purin-10(3H)-one-1,3,4,5,9-15N5
  参考文献：
  名称：

  An Ammonium Bicarbonate-Enhanced Stable Isotope Dilution UHPLC-MS/MS Method for Sensitive and Accurate Quantification of Acrolein–DNA Adducts in Human Leukocytes

  摘要：

  丙烯醛（Acrolein，Acr）是一种无处不在的环境污染物，可直接与基因组 DNA 发生反应，形成致突变加合物，而无需经过代谢活化。碳酸氢铵（NH4HCO3）热不稳定，在加热气相中很容易降解为二氧化碳和氨，为了灵敏、准确地定量检测人体白细胞中的 Acr-DNA 加合物（包括结构异构体和立体异构体），我们开发了一种增强型稳定同位素稀释超高效液相色谱（UHPLC）-串联质谱（MS/MS）方法。有趣的是，碳酸氢铵（作为流动相的添加剂）不仅能改善 AcrdG 加合物的质子化，还能抑制电喷雾离子化过程中形成会降低 MS 信号的金属-AcrdG 复合物，从而使其 MS 检测能力提高 2.3-8.7 倍。相比之下，常规使用的铵盐（醋酸铵和甲酸铵）和甲酸则没有类似的增强效果。所开发的方法可用于提高其他修饰的 2′-脱氧核苷酸的 ESI-MS 检测能力，因为这些核苷酸难以质子化，在电喷雾离子化过程中可能会形成过量的金属复合物。检测限（LODs，S/N = 3）估计约为 40-80 amol。通过使用所开发的方法，我们发现可以在人类白细胞中检测到三种核苷酸（dG、dA 和 dC）的 Acr 加合物。除了已知的γ-AcrdG外，α-AcrdA也被鉴定为高丰度的Acr加合物（每108 nts有2.5-20个加合物）。

  DOI：

  10.1021/ac3034695