2,6-bis[N-(3-Fmoc-amino)propionamide]anthracene-9,10-dione | 1007890-01-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: 2,6-bis[N-(3-Fmoc-amino)propionamide]anthracene-9,10-dione
• 英文别名: 2,6-bis-[N-(3-Fmoc-amino)-propionamide]anthracene-9,10-dione；2,6-Fmoc-β-Ala-anthraquinone
• CAS: 1007890-01-8
• 化学式: C₅₀H₄₀N₄O₈
• 分子量: 824.89
• InChiKey: ZRCHOHWECAEVSI-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.2
• 重原子数：
  62.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.16
• 拓扑面积：
  169.0
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2,6-bis[N-(3-Fmoc-amino)propionamide]anthracene-9,10-dione 在 二乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 2,6-bis-(3-amino-propionamide)-anthracene-9,10-dione
  参考文献：
  名称：

  设计，合成和生物学评估作为HIV-1核衣壳抑制剂的TAR和cTAR结合物†

  摘要：

  我们设计，合成和测试了能够结合核酸的动态二级结构（例如TAR RNA及其逆转录cTAR）的新型2,6-二取代蒽醌，从而抑制了高度保守的病毒核衣壳NCp7的伴侣活性。蛋白暗示HIV-1复制的关键步骤。

  DOI：

  10.1039/c3md00212h
• 作为产物：
  描述：

  FMOC-beta-丙氨酸 在 氯化亚砜 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 2,6-bis[N-(3-Fmoc-amino)propionamide]anthracene-9,10-dione
  参考文献：
  名称：

  在区域异构的赖氨酰-肽基-蒽醌缀合物中调节G-四链体与双链DNA的识别。

  摘要：

  蒽醌是一种多功能支架，可提供有效的DNA结合剂。这种平面系统可以轻松地与质子化侧链结合：侧基的性质及其在三环部分周围的位置在结合亲和力和模式以及靶核酸的序列和结构方面极大地影响了DNA识别过程。从对称地被N末端赖氨酰基残基官能化的蒽二酮系统开始，我们通过引入Gly，Ala或Phe间隔基来增加侧链的长度，该间隔基具有不同的柔韧性，亲脂性和蓬松性。此外，检查了2,6、2,7、1,8和1,5区域异构体，生成了一个小的双（赖氨酰-肽基）蒽二酮文库。通过合并光谱，酶和细胞结果，我们表明，碱性氨基酸（Lys）与疏水性更高的残基（Phe）的正确组合可以提供选择性的G-四链体识别，特别是当侧链位于2,6或2,7位时。实际上，尽管这些衍生物有效地结合了G-四链体结构，但它们同时表现为相当差的双链DNA嵌入剂。结果，Lys-Phe取代的蒽醌具有弱的细胞毒性，但仍然能够促进癌细胞的衰老机制。化学和生物学性质的这

  DOI：

  10.1021/bc200389w

文献信息

• Aminoacyl−Anthraquinone Conjugates as Telomerase Inhibitors: Synthesis, Biophysical and Biological Evaluation
  作者：Giuseppe Zagotto、Claudia Sissi、Lorena Lucatello、Claudia Pivetta、Sergio A. Cadamuro、Keith R. Fox、Stephen Neidle、Manlio Palumbo

  DOI：10.1021/jm800160v

  日期：2008.9.25

  anticancer target. To inhibit enzyme activity by induction of G-quadruplex in human telomeres, we have synthesized a small library of 2,6- and 2,7-amino-acyl/ peptidyl anthraquinones with diverse connecting linkers, charge, lipophilicity and bulk. The test compounds modulated G-quadruplex stability to different extents and showed clear preference for quadruplex over duplex DNA. Telomerase inhibition correlated

  端粒酶-端粒复合物是潜在的抗癌靶标。为了通过在人端粒中诱导G-四链体来抑制酶的活性，我们合成了一个2,6-和2,7-氨基-酰基/肽基蒽醌的小文库，具有不同的连接接头，电荷，亲脂性和体积。测试化合物在不同程度上调节了G-四链体的稳定性，并且显示出对四链体的明显偏好高于双链体DNA。端粒酶抑制与G四联体稳定相关。SAR分析表明，连接子和蒽醌之间的连接类型，以及侧链的位置和氨基酸成分的性质在稳定G-四链体和产生端粒酶抑制作用中均起着重要作用。短期细胞毒活性差。然而，长时间暴露于有效的G-四链体结合剂后，细胞会衰老。这些结果有助于合理设计更有效的G-四链体稳定剂，可能具有癌细胞选择性的抗增殖作用。
• Amide bond direction modulates G-quadruplex recognition and telomerase inhibition by 2,6 and 2,7 bis-substituted anthracenedione derivatives
  作者：Giuseppe Zagotto、Claudia Sissi、Stefano Moro、Diego Dal Ben、Gary N. Parkinson、Keith R. Fox、Stephen Neidle、Manlio Palumbo

  DOI：10.1016/j.bmc.2007.09.040

  日期：2008.1

  G-quadruplex structures of DNA represent a potentially useful target for anticancer drugs. Stabilisation of this arrangement at the ends of chromosomes may inhibit the action of telomerase, an enzyme involved in immortalization of cancer cells. Appropriately substituted amido anthracenediones are effective G-quadruplex stabilizers, but no information is available as yet on the possible modulation of G-quadruplex recognition and telomerase inhibition produced by the direction of the amide bond. To understand the basis of amido anthracenedione selectivity, we have synthesized a number of derivatives bearing the -CO-NH- or -NH-CO- group linked to the planar anthraquinone (AQ) moiety at 2,6 and 2,7 positions. The various isomers were tested in terms of telomerase inhibition, determined by the TRAP assay, G-quadruplex stabilisation measured by the increase in melting temperature of the appropriately folded oligonucleotide using FRET, and conformational and G4 binding properties examined by molecular modelling techniques. In all cases, enzymatic inhibition and G-quadruplex stabilization were directly related, which strongly supports the proposed molecular mechanism of telomerase interference. Interestingly, the AQ-NH-CO- arrangement performs invariantly better than the AQ-CO-NH- arrangement, showing a clear preference among isomeric derivatives. Theoretical calculations suggest that the former amide arrangement is co-planar with the aromatic system, whereas the latter is tilted by about 30 degrees when considering the most stable conformation. A more extended planar surface would allow more efficient stacking interactions with the quadruplex structure, hence more effective telomerase inhibition. (c) 2007 Elsevier Ltd. All rights reserved.