Substrate Activity Screening: A Fragment-Based Method for the Rapid Identification of Nonpeptidic Protease Inhibitors
作者:Warren J. L. Wood、Andrew W. Patterson、Hiroyuki Tsuruoka、Rishi K. Jain、Jonathan A. Ellman
DOI:10.1021/ja0547230
日期:2005.11.1
A new fragment-based method for the rapid development of novel and distinct classes of nonpeptidic protease inhibitors, Substrate Activity Screening (SAS), is described. This method consists of three steps: (1) a library of N-acyl aminocoumarins with diverse, low molecular weight N-acyl groups is screened to identify protease substrates using a simple fluorescence-based assay, (2) the identified N-acyl
描述了一种新的基于片段的方法,用于快速开发新型和不同类别的非肽蛋白酶抑制剂,即底物活性筛选 (SAS)。该方法由三个步骤组成:(1) 筛选具有多种低分子量 N-酰基的 N-酰基氨基香豆素库,以使用简单的基于荧光的测定来鉴定蛋白酶底物,(2) 已鉴定的 N-酰基氨基香豆素底物通过快速类似物合成和评估进行优化,并且 (3) 优化的底物通过用已知机制的药效团直接替换氨基香豆素而转化为抑制剂。SAS 方法已成功应用于与自身免疫性疾病有关的半胱氨酸蛋白酶组织蛋白酶 S。在筛选 N-酰基氨基香豆素文库时鉴定出多种不同类别的非肽底物。两种非肽底物类别针对底物进行了优化,每个类别的切割效率提高了 8000 倍以上。然后将选择的非肽底物直接转化为对组织蛋白酶 S 具有纳摩尔亲和力的低分子量新型醛抑制剂。本研究证明了这种基于底物的快速鉴定和优化弱片段方法的独特特征和优点,并提供了框架用于开发针对许多不同蛋白酶的完全非肽抑制剂。