1-(hex-5-ynyl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione | 264611-40-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-(hex-5-ynyl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• 英文别名: 1-(hex-5-yn-1-yl)-5-methyluracil；1-Hex-5-ynyl-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 264611-40-7
• 化学式: C₁₁H₁₄N₂O₂
• 分子量: 206.244
• InChiKey: HLXPFWZKHRKJBD-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.9
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  49.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(hex-5-ynyl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 在 sodium methylate 、 copper(II) sulfate 、 sodium ascorbate 作用下， 以 甲醇 、 水 、 叔丁醇 为溶剂， 生成 5-methyl-1-{[1-(β-D-ribofuranosyl)-1H-1,2,3-triazol-4-yl]butyl}-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione
  参考文献：
  名称：

  胸腺嘧啶和6-甲基尿嘧啶5'-磷酸化1,2,3-三唑基核苷类似物的合成、抗病毒评价、分子对接研究和细胞毒性

  摘要：

  大系列母体1,2,3-三唑基核苷对流感病毒A/PR/8/34 (H1N1)的体外抗病毒活性（以半最大抑制浓度IC 50 计）的比较分析类似物（以尿嘧啶、胸腺嘧啶、6-甲基尿嘧啶、喹唑啉-2,4-二酮部分作为核碱基）及其带有掩蔽的 5′-磷酸基团（磷酸二乙酯、磷酸二苯酯、氨基磷酸酯）和带负电荷的 H 的前药形式进行了-膦酸酯和单磷酸基团。所获得的结构-活性关系是基于以下假设进行解释的：合成的母体 1,2,3-三唑基核苷类似物及其前药形式，通过与文献数据类比，被细胞激酶代谢为其活性 5′-三磷酸形式，从而抑制病毒RNA依赖性RNA聚合酶（RdRp）的活性。发现IC 50的实验值与母体1,2,3-三唑基核苷类似物的5′-三磷酸衍生物在RdRp活性位点的结合能的理论值之间存在相关性。 图形概要

  DOI：

  10.1007/s00044-023-03112-z
• 作为产物：
  描述：

  N-(3-methoxy-2-methacryloyl)-N'-(hex-5-ynyl)urea 在 氢氧化钾 、 18-冠醚-6 作用下， 反应 0.17h， 以25%的产率得到1-(hex-5-ynyl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  嘌呤，嘧啶，1,3,5-三嗪和A啶系列中1,3-二炔的合成

  摘要：

  一系列共轭的1,3-二炔的，R 1 CCCCR 2，已准备了包含以下的杂芳族单元作为取代基的头部基团R 1和/或R 2：嘧啶基，嘌呤基，2,4-二氨基-1,3,5-三嗪基和a啶基。在R 1和R 2中均含有前三个基团作为末端杂环取代基的化合物通过亚甲基接头{（CH 2）n，n = 1、4或9}键合至1,3-二炔；还报道了R 2 = n -C 10 H 21的两亲物种和在链R 1中的单个杂芳族头基。cr啶系列中的化合物也是两亲性的，并包含季铵化的1'-（9-ac啶基氨基）-和1'-（6-氯-2-甲氧基ac啶基氨基）-通过PEG和亚甲基单元连接至二炔功能的末端取代基。新的二炔是通过相应的ω-杂芳族官能化的1-炔的氧化偶合或通过预先形成的二炔上末端基团的转化而合成的。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(00)00016-8

文献信息

• Synthesis of 1,2,3-triazolyl nucleoside analogues and their antiviral activity
  作者：Olga V. Andreeva、Bulat F. Garifullin、Vladimir V. Zarubaev、Alexander V. Slita、Iana L. Yesaulkova、Liliya F. Saifina、Marina M. Shulaeva、Maya G. Belenok、Vyacheslav E. Semenov、Vladimir E. Kataev

  DOI：10.1007/s11030-020-10141-y

  日期：2021.2

  Abstract Based on the fact that a search for influenza antivirals among nucleoside analogues has drawn very little attention of chemists, the present study reports the synthesis of a series of 1,2,3-triazolyl nucleoside analogues in which a pyrimidine fragment is attached to the ribofuranosyl-1,2,3-triazol-4-yl moiety by a polymethylene linker of variable length. Target compounds were prepared by the

  摘要 基于在核苷类似物中寻找流感抗病毒药物很少引起化学家关注的事实，本研究报告了一系列 1,2,3-三唑基核苷类似物的合成，其中嘧啶片段与呋喃核糖基相连。 -1,2,3-triazol-4-yl 部分由可变长度的聚亚甲基接头组成。通过 Cu 炔烃-叠氮化物环加成 (CuAAC) 反应制备目标化合物。尿嘧啶、6-甲基尿嘧啶、3,6-二甲基尿嘧啶、胸腺嘧啶和喹唑啉-2,4-二酮的衍生物，在N 1 (或N 5) 原子上具有 ω-炔烃取代基和叠氮基 2,3,5-三-O-乙酰基-D-β-呋喃核糖苷用作CuAAC反应的组分。评估了所有合成的化合物对流感病毒 A/PR/8/34/(H1N1) 和柯萨奇病毒 B3 的抗病毒活性。IC 50（抑制浓度）和 SI（选择性指数）的最佳值由先导化合物4i证明，其中 1,2,3-三唑基呋喃核糖基片段连接到quinazoline-2,4-dione的N 1 原子通过丁烯接头
• Synthesis of novel 1,2,3-triazolyl nucleoside analogues bearing uracil, 6-methyluracil, 3,6-dimethyluracil, thymine, and quinazoline-2,4-dione moieties
  作者：Olga V. Andreeva、Maya G. Belenok、Liliya F. Saifina、Marina M. Shulaeva、Alexey B. Dobrynin、Radmila R. Sharipova、Alexandra D. Voloshina、Alina F. Saifina、Aidar T. Gubaidullin、Bulat I. Khairutdinov、Yuriy F. Zuev、Vyacheslav E. Semenov、Vladimir E. Kataev

  DOI：10.1016/j.tetlet.2019.151276

  日期：2019.11

  A series of novel 1,2,3-triazolyl nucleoside analogues was synthesized via the CuAAC reaction of N1-alkynyl uracil, 6-methyluracil, 3,6-dimethyl uracil, thymine and quinazolin-2,4-dione with protected azido β-D-ribofuranose. The obtained compounds differ in both the nature of the pyrimidine-2,4-dione fragment and the length of the polymethylene linker connecting it with the β-D-ribofuranosyl-1,2,3-triazol-4-yl

  通过N 1-炔基尿嘧啶，6-甲基尿嘧啶，3,6-二甲基尿嘧啶，胸腺嘧啶和喹唑啉-2,4-二酮与受保护的叠氮基β的CuAAC反应合成了一系列新颖的1,2,3-三唑基核苷类似物- d -ribofuranose。所获得的化合物在嘧啶-2，4-二酮片段的性质和将其与β- D-呋喃呋喃糖基-1,2,3-三唑-4-基部分连接的多亚甲基接头的长度上都不同。1,2,3-triazolyl核苷类似物的体外细胞毒性进行了评估。
• Synthesis and antiviral activity of 1,2,3-triazolyl nucleoside analogues with <i>N</i>-acetyl-<scp>d</scp>-glucosamine residue
  作者：Bulat F. Garifullin、Leysan R. Khabibulina、Maya G. Belenok、Liliya F. Saifina、Vladimir V. Zarubaev、Alexander V. Slita、Alexandrina S. Volobueva、Vyacheslav E. Semenov、Vladimir E. Kataev

  DOI：10.1080/15257770.2023.2189914

  日期：——

  virus A H1N1 (IC50=70.7 µM) as the antiviral drug Rimantadine in control (IC50=77 µM) and good activity against Coxsackievirus B3 (IC50=13.9 µM) which was one and a half times higher than the activity of the antiviral drug Pleconaril in control (IC50=21.6 µM). According to molecular docking simulations, the antiviral activity of the lead compound 3f against Coxsackie B3 virus can be explained by its binding

  摘要 通过尿嘧啶、6-甲基尿嘧啶的N 1-ω-炔基衍生物的铜催化炔烃叠氮环加成(CuAAC)反应合成了一系列带有N-乙酰基-D-葡萄糖胺残基的1,2,3-三唑核苷类似物，胸腺嘧啶和3,4,6-三-O-乙酰基-2-脱氧-2-乙酰氨基-β-D-吡喃葡萄糖基叠氮化物。抗病毒测定显示，先导化合物3f与对照抗病毒药物金刚乙胺(IC 50 = 77 µM)具有相同的抗甲型 H1N1 流感病毒活性(IC 50 = 70.7 µM)，并且具有良好的抗柯萨奇病毒 B3 活性 (IC 50 = 13.9 µM），比对照抗病毒药物 Pleconaril 的活性高一倍半（IC 50 = 21.6 µM）。根据分子对接模拟，先导化合物3f对柯萨奇B3病毒的抗病毒活性可以通过其与该病毒衣壳表面关键片段的结合来解释。
• Synthesis and Antiviral Activity of New Dimeric 1,2,3-Triazolyl Pyrimidine Nucleoside Analogues
  作者：O. V. Andreeva、L. F. Saifina、M. M. Shulaeva、M. G. Belenok、V. V. Zarubaev、A. V. Slita、A. S. Volobueva、V. E. Semenov、V. E. Kataev

  DOI：10.1134/s1070428024040031

  日期：2024.4

  Abstract A series of new dimers of pyrimidine nucleoside analogues have been synthesized. The dimers are composed of two uracil or thymine fragments linked at N3 through a polymethylene bridge and bearing a β-D-ribofuranose residue linked to N1 of the nucleobase through a 1,2,3-triazolylalkyl spacer. Biological screening revealed that some of the synthesized dimers are active against influenza A (H1N1)

  抽象的 合成了一系列新的嘧啶核苷类似物二聚体。二聚体由两个尿嘧啶或胸腺嘧啶片段组成，通过多亚甲基桥在 N 3 处连接，并带有 β-D-呋喃核糖残基，通过 1、 2,3-三唑基烷基间隔基。生物学筛选表明，部分合成的二聚体对甲型H1N1流感病毒和柯萨奇B3病毒具有活性，IC 50 值分别为13和4.5 μM。
• Intramolecular hydrogen bonding of nucleobases
  作者：Geoffrey T. Crisp、Yu-Lin Jiang

  DOI：10.1016/s0040-4039(02)00483-5

  日期：2002.4

  The intramolecular hydrogen bonding of a series of linked uracil, thymine and adenine derivatives is described. The nucleoside bases have been linked by semi-flexible spacers and the chemical shifts and DeltadeltaNH/DeltaT values for the nucleoside NH protons confirm the strong intramolecular hydrogen bonding motif. (C) 2002 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.