dimethyl 4-decyloxy-2,6-pyridinedicarboxylate | 362620-02-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡啶及其衍生物
• 英文名称: dimethyl 4-decyloxy-2,6-pyridinedicarboxylate
• 英文别名: 4-Decyloxypyridine-2,6-dicarboxylic acid dimethyl ester；Dimethyl 4-decoxypyridine-2,6-dicarboxylate
• CAS: 362620-02-8
• 化学式: C₁₉H₂₉NO₅
• 分子量: 351.443
• InChiKey: SPXKYUIRMOKKII-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.7
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.63
• 拓扑面积：
  74.7
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  dimethyl 4-decyloxy-2,6-pyridinedicarboxylate 在 palladium on activated charcoal sodium hydroxide 、 氯化亚砜 、 氢气 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 6-(6-Amino-4-decyloxy-pyridin-2-ylcarbamoyl)-4-decyloxy-pyridine-2-carboxylic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  寡吡啶-二甲酰胺链的双螺旋结构和单螺旋结构。第1部分：低聚物长度的影响

  摘要：

  先前显示2，6-二氨基吡啶和2，6-吡啶二甲酸的低聚酰胺折叠成单螺旋单体并杂交成双螺旋二聚体。使用新的收敛方案合成了一系列新的包含5至15个吡啶单元，4-癸氧基残基和氨基甲酸苄酯端基的低聚物，该方案涉及二胺和二酸的早期不对称化。这些化合物杂交成双螺旋的方法为1在各种温度下于氯仿溶液中的1 H NMR光谱。出乎意料的是，这些研究表明，二聚化随着寡聚体长度的增加而增加，直到某个点，然后降低到最长链的不可检测水平。NMR研究表明，当链长增加时，双螺旋和单螺旋都变得更稳定。各种长度的寡聚物的焓和杂交熵的测量值表明，焓增益随着链长的增加而不断减小。这可以解释为由于链长随着杂交而经历的弹簧状延伸的焓价增加的结果。另一方面，杂交的熵损失也随着链长的增加而不断减少。想必，单体的螺旋预组织随着链长度的增加而增加，这允许较长的链以最小的运动自由度杂交，即以较低的熵价杂交。这两个因素之间的竞争导致具有中等长度的链的杂交达到最大。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2004.07.078
• 作为产物：
  描述：

  4-Decyloxypyridine-2,6-dicarboxylic acid 在 氯化亚砜 作用下， 以 甲苯 为溶剂， 反应 2.5h， 生成 dimethyl 4-decyloxy-2,6-pyridinedicarboxylate
  参考文献：
  名称：

  螺旋分子编程：将寡吡啶-二甲酰胺折叠成分子单个螺旋。

  摘要：

  由交替的2，6-二氨基吡啶和2，6-吡啶二羰基单元组成的分子链已被设计成在形成分子内氢键时自组织成单链螺旋结构。五聚体链11、12和14，七聚体链1和20以及非十聚体链15已经使用逐步收敛策略合成。通过对这些化合物中的四种进行单晶X射线衍射分析，已表征了固态的单螺旋构象。来自五聚体链12和14的螺旋延伸一圈，来自七聚体20和非十聚体15种的螺旋分别延伸一圈半和二圈半。分子内氢键负责股线的强烈弯曲。极性和非极性有机溶剂中的1 H NMR位移均表明外围芳族基团之间存在分子内重叠。因此，螺旋构象在溶液中也占主导地位。从高能延伸线性构象异构体开始的链折叠的分子随机动力学模拟显示，快速（在300 K时为600 ps）转变为稳定的螺旋构象。

  DOI：

  10.1002/1521-3765(20010702)7:13<2798::aid-chem2798>3.0.co;2-l

文献信息

• Helical Molecular Programming: Supramolecular Double Helices by Dimerization of Helical Oligopyridine-dicarboxamide Strands
  作者：Volker Berl、Ivan Huc、Richard G. Khoury、Jean-Marie Lehn

  DOI：10.1002/1521-3765(20010702)7:13<2810::aid-chem2810>3.0.co;2-5

  日期：2001.7.2

  Helically preorganized oligopyridine-dicarboxamide strands are found to undergo dimerization into double helical supramolecular architectures. Dimerization of single helical strands with five or seven pyridine rings has been characterized by NMR and mass spectrometry in various solvent/ temperature conditions. Solution studies and stochastic dynamic simulations consistently show an increasing duplex stability with increasing strand length. The double helical structures of three different dimers was characterized in the solid phase by X-ray diffraction analysis. Both aromatic stacking and hydrogen bonding contribute the double helical arrangement of the oligopyridine-dicarboxamide strand. Inter-strand interactions involve extensive face-to-face overlap between aromatic rings, which is not possible in the single helical monomers. Most hydrogen bonds occur within each strand of the duplex and stabilize its helical shape. Some inter-strand hydrogen bonds are found in the crystal structures. Dynamic studies by NMR as well as by molecular modeling computations yield structural and kinetic information on the double helices and on monomer-dimer interconversion. In addition, they reveal the presence of a spring-like extension/compression as well as rotational displacement motions.
• Helical Molecular Programming: Folding of Oligopyridine-dicarboxamides into Molecular Single Helices
  作者：Volker Berl、Ivan Huc、Richard G. Khoury、Jean-Marie Lehn

  DOI：10.1002/1521-3765(20010702)7:13<2798::aid-chem2798>3.0.co;2-l

  日期：2001.7.2

  self-organize into single stranded helical structures upon forming intramolecular hydrogen bonds. Pentameric strands 11, 12, and 14, heptameric strands 1 and 20, and undecameric strand 15 have been synthesized using stepwise convergent strategies. Single helical conformations have been characterized in the solid state by single crystal X-ray diffraction analysis for four of these compounds. Helices from

  由交替的2，6-二氨基吡啶和2，6-吡啶二羰基单元组成的分子链已被设计成在形成分子内氢键时自组织成单链螺旋结构。五聚体链11、12和14，七聚体链1和20以及非十聚体链15已经使用逐步收敛策略合成。通过对这些化合物中的四种进行单晶X射线衍射分析，已表征了固态的单螺旋构象。来自五聚体链12和14的螺旋延伸一圈，来自七聚体20和非十聚体15种的螺旋分别延伸一圈半和二圈半。分子内氢键负责股线的强烈弯曲。极性和非极性有机溶剂中的1 H NMR位移均表明外围芳族基团之间存在分子内重叠。因此，螺旋构象在溶液中也占主导地位。从高能延伸线性构象异构体开始的链折叠的分子随机动力学模拟显示，快速（在300 K时为600 ps）转变为稳定的螺旋构象。
• Double versus single helical structures of oligopyridine-dicarboxamide strands. Part 1: Effect of oligomer length
  作者：Hua Jiang、Victor Maurizot、Ivan Huc

  DOI：10.1016/j.tet.2004.07.078

  日期：2004.10

  strands. NMR studies show that both double helices and single helices become more stable when strand length increases. The measured values of enthalpy and entropy of hybridization for oligomers of various length show that the enthalpic gain constantly decreases with strand length. This can be interpreted as being the result of an increasing enthalpic price of the spring-like extension that the strand undergoes

  先前显示2，6-二氨基吡啶和2，6-吡啶二甲酸的低聚酰胺折叠成单螺旋单体并杂交成双螺旋二聚体。使用新的收敛方案合成了一系列新的包含5至15个吡啶单元，4-癸氧基残基和氨基甲酸苄酯端基的低聚物，该方案涉及二胺和二酸的早期不对称化。这些化合物杂交成双螺旋的方法为1在各种温度下于氯仿溶液中的1 H NMR光谱。出乎意料的是，这些研究表明，二聚化随着寡聚体长度的增加而增加，直到某个点，然后降低到最长链的不可检测水平。NMR研究表明，当链长增加时，双螺旋和单螺旋都变得更稳定。各种长度的寡聚物的焓和杂交熵的测量值表明，焓增益随着链长的增加而不断减小。这可以解释为由于链长随着杂交而经历的弹簧状延伸的焓价增加的结果。另一方面，杂交的熵损失也随着链长的增加而不断减少。想必，单体的螺旋预组织随着链长度的增加而增加，这允许较长的链以最小的运动自由度杂交，即以较低的熵价杂交。这两个因素之间的竞争导致具有中等长度的链的杂交达到最大。