novobiocic acid | 485-23-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 香豆素及其衍生物
• 英文名称: novobiocic acid
• 英文别名: N-(4,7-dihydroxy-8-methyl-2-oxo-2H-chromen-3-yl)-4-hydroxy-3-(3-methylbut-2-en-1-yl)benzamide；N-(4,7-dihydroxy-8-methyl-2-oxochromen-3-yl)-4-hydroxy-3-(3-methylbut-2-enyl)benzamide
• CAS: 485-23-4
• 化学式: C₂₂H₂₁NO₆
• 分子量: 395.412
• InChiKey: NMCFFEJWADWZTI-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 溶解度：
  DMF：可溶； DMSO：可溶；乙醇：可溶；甲醇：可溶

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  novobiocic acid 、 tdp-4-酮-6-脱氧-D-葡萄糖 在 苯磺酰胺 、 NovM-His₆ 、 magnesium chloride 作用下， 以 various solvent(s) 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 N-[7-((2S,3R,4R,6R)-3,4-Dihydroxy-6-methyl-5-oxo-tetrahydro-pyran-2-yloxy)-4-hydroxy-8-methyl-2-oxo-2H-chromen-3-yl]-4-hydroxy-3-(3-methyl-but-2-enyl)-benzamide
  参考文献：
  名称：

  Substrate Specificity of NovM:  Implications for Novobiocin Biosynthesis and Glycorandomization

  摘要：

  In an effort to expand the scope of natural product in vitro glycorandomization (IVG), the substrate specificity of NovM was investigated. A test of four aglycon analogues and over 40 nucleotide sugars revealed NovM has a surprisingly stringent substrate specificity and provided only three new "unnatural" natural products. On the basis of the determined substrate specificity, an alternative to the sugar nucleotide biosynthetic dogma and a cautionary note for the general applicability of IVG are introduced.

  DOI：

  10.1021/ol0341086
• 作为产物：
  描述：

  新生霉素 在 乙酰氯 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 2.0h， 以51.5%的产率得到novobiocic acid
  参考文献：
  名称：

  AUTOPHAGY INHIBITORS

  摘要：

  一种化合物，其为 a) 公式（I）的四氢三唑衍生物， 其互变体，药学上可接受的盐，溶剂合物或水合物，其中符号的含义如描述中所给， 或者 b) 公式（II）的香豆素衍生物， 其互变体，药学上可接受的盐，溶剂合物或水合物，其中符号的含义如描述中所给， 在细胞中抑制自噬并用于癌症治疗的治疗方法中是有用的。

  公开号：

  EP3184514A1

文献信息

• Homodimeric Tobramycin Adjuvant Repurposes Novobiocin as an Effective Antibacterial Agent against Gram-Negative Bacteria
  作者：Temilolu Idowu、Derek Ammeter、Heather Rossong、George G. Zhanel、Frank Schweizer

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b00876

  日期：2019.10.24

  is a major reason why most antibiotics are ineffective against Gram-negative bacteria. Agents that permeabilize the outer membrane are typically toxic at their effective concentrations. Here, we report the development of a broad-spectrum homodimeric tobramycin adjuvant that is nontoxic and more potent than the gold standard permeabilizing agent, polymyxin B nonapeptide. In pilot studies, the adjuvant

  跨膜的低渗透性是大多数抗生素对革兰氏阴性细菌无效的主要原因。渗透外膜的试剂通常在其有效浓度下是有毒的。在这里，我们报道了一种广谱同二聚妥布霉素佐剂的开发，该佐剂无毒且比金标准通透剂多粘菌素B九肽更有效。在先导研究中，佐剂可赋予新霉素抗革兰氏阴性细菌的有效杀菌活性，这些革兰氏阴性细菌包括带有质粒传播的mcr-的耐碳青霉烯和耐大肠菌素的菌株。1个基因。相对于单独的新霉素，对该组合的耐药性显着降低，并且没有诱导对其他抗生素（包括促旋酶作用的氟喹诺酮类药物）产生交叉耐药性。妥布霉素同型二聚体可允许使用较低剂量的新霉素，从而克服其双重功效和毒性问题。
• [EN] HOMODIMERIC TOBRAMYCIN ADJUVANT REPURPOSES NOVOBIOCIN AS AN EFFECTIVE ANTIBACTERIAL AGENT AGAINST GRAM-NEGATIVE BACTERIA<br/>[FR] NOVOBIOCINE ADAPTÉE D'ADJUVANT DE TOBRAMYCINE HOMODIMÈRE SERVANT D'AGENT ANTIBACTÉRIEN EFFICACE CONTRE DES BACTÉRIES À GRAM NÉGATIF
  申请人：UNIV MANITOBA

  公开号：WO2020232534A1

  公开（公告）日：2020-11-26

  Low permeability across the outer membrane is a major reason why most antibiotics are ineffective against Gram-negative bacteria. Agents that permeabilize the outer membrane are typically toxic at their effective concentrations. Here, we report the development of a broad-spectrum homodimeric tobramycin adjuvant that is non-toxic and more potent than the gold standard permeabilizing agent, polymyxin B nonapeptide. In pilot studies, the adjuvant confers potent bactericidal activity on novobiocin against Gram-negative bacteria, including carbapenem-resistant and colistin-resistant strains bearing plasmid-borne mcr-1 genes. Resistance development to the combination was significantly reduced, relative to novobiocin alone, and there was no induction of cross-resistance to other antibiotics, including the gyrase-acting fluoroquinolones. Tobramycin homodimer may allow the use of lower doses of novobiocin, overcoming its twin-problem of efficacy and toxicity.

  外膜的低渗透性是导致大多数抗生素对革兰氏阴性细菌无效的主要原因。渗透外膜的药物通常在有效浓度下具有毒性。在这里，我们报告了一种广谱同源二聚体托布拉霉素辅助剂的开发，该辅助剂无毒且比金标准的渗透剂多粘菌素B非肽更有效。在试点研究中，该辅助剂使新诺比信对革兰氏阴性细菌具有强效的杀菌活性，包括携带质粒编码mcr-1基因的碳青霉烯耐药和科利霉素耐药菌株。相对于单独使用新诺比信，对该组合的耐药发展显著减少，并且没有诱导对其他抗生素的交叉耐药，包括对DNA酶作用的氟喹诺酮类抗生素。托布拉霉素同源二聚体可能允许使用较低剂量的新诺比信，克服其疗效和毒性的双重问题。
• New Novobiocin Analogues as Antiproliferative Agents in Breast Cancer Cells and Potential Inhibitors of Heat Shock Protein 90
  作者：Gaëlle Le Bras、Christine Radanyi、Jean-François Peyrat、Jean-Daniel Brion、Mouâd Alami、Véronique Marsaud、Barbara Stella、Jack-Michel Renoir

  DOI：10.1021/jm0707774

  日期：2007.11.1

  positions of coumarin which appeared to be essential for degradation of hsp90 client proteins. Removal of the noviose moiety in novobiocin together with introduction of a tosyl substituent at C-4 or C-7 coumarins provides 6e and 6f as lead structures which compared favorably with novobiocin as demonstrated by enhanced rates of cell death. The processing and activation of caspases 7 and 8 and the subsequent

  选择性hsp90抑制剂可同时破坏和消耗参与细胞增殖和存活，血管生成和转移的关键信号蛋白。作为hsp90的新型抑制剂，缺少诺维糖部分的新霉素类似物已进行了研究。已经产生了一系列新的3-氨基香豆素类似物，并在细胞增殖中进行了筛选，并且通过在人乳腺癌细胞中消耗雌激素受体，HER2，Raf-1和cdk4来评估hsp90抑制的分子标记。这项结构-活性关系研究强调了香豆素的C-4和/或C-7位置的关键作用，这对hsp90客户蛋白的降解至关重要。除去新霉素中的新葡糖部分，并在C-4或C-7香豆素上引入甲苯磺酰基取代基，可提供6e和6f作为前导结构，与新霉素相比，有利于细胞死亡率的提高。半胱氨酸蛋白酶7和8的加工和激活以及随后的6e对PARP的切割表明刺激了外在凋亡途径。
• [EN] METHODS OF TREATMENT FOR BACTERIAL INFECTIONS<br/>[FR] MÉTHODES DE TRAITEMENT D'INFECTIONS BACTÉRIENNES
  申请人：HARVARD COLLEGE

  公开号：WO2019018286A1

  公开（公告）日：2019-01-24

  This invention features new compositions and methods that are useful in treating a host with a Gram-negative bacterial infection. Combination therapies comprising an aminocoumarin compound and a polymyxin compound are disclosed, including certain combinations that exhibit synergistic effects. Furthermore, aminocoumarin compounds are described having altered inhibition of DNA gyrase in Gram- negative bacteria and/or the ability to target the transport proteins responsible for assembling lipopolysaccharide in the outer membrane of Gram-negative bacteria.

  这项发明涉及新的组合物和方法，可用于治疗患有革兰氏阴性细菌感染的宿主。公开了包含氨基香豆素化合物和多粘菌素化合物的联合疗法，包括某些表现出协同作用的组合物。此外，描述了氨基香豆素化合物，其具有改变对革兰氏阴性细菌中DNA酶旋转酶的抑制作用和/或靶向负责在革兰氏阴性细菌外膜中组装脂多糖的转运蛋白的能力。
• Novobiocin Enhances Polymyxin Activity by Stimulating Lipopolysaccharide Transport
  作者：Michael D. Mandler、Vadim Baidin、James Lee、Karanbir S. Pahil、Tristan W. Owens、Daniel Kahne

  DOI：10.1021/jacs.8b02283

  日期：2018.6.6

  Gram-negative bacteria are challenging to kill with antibiotics due to their impenetrable outer membrane containing lipopolysaccharide (LPS). The polymyxins, including colistin, are the drugs of last resort for treating Gram-negative infections. These drugs bind LPS and disrupt the outer membrane; however, their toxicity limits their usefulness. Polymyxin has been shown to synergize with many antibiotics

  革兰氏阴性细菌很难用抗生素杀死，因为它们的外膜含有脂多糖 (LPS)，难以穿透。多粘菌素，包括粘菌素，是治疗革兰氏阴性菌感染的最后手段。这些药物结合 LPS 并破坏外膜；然而，它们的毒性限制了它们的用途。多粘菌素已被证明可以与许多抗生素产生协同作用，包括新生霉素，它可以抑制 DNA 旋转酶，促进这些抗生素穿过外膜的转运。最近，我们发现新生霉素不仅能抑制 DNA 旋转酶，还能结合并刺激 LptB（一种为 LPS 运输提供动力的 ATP 酶）。在这里，我们报道了分离这两种活性的新生霉素衍生物的合成。一种类似物保留了 LptB 刺激活性，但无法抑制 DNA 旋转酶。这种类似物本身无毒，但通过结合 LptB 并刺激 LPS 转运来增强多粘菌素的杀伤力。因此，LPS 转运激动作用对新生霉素-多粘菌素协同作用有很大贡献。我们还报道了其他新生霉素类似物，它们对 DNA 旋转酶的抑制效果优于或等于新生霉素，但与