5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxycytidine-3'-O-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylphosphoramidite] | 140613-57-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxycytidine-3'-O-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylphosphoramidite]
• 英文别名: (2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)tetrahydrofuran-3-yl (2-cyanoethyl) diisopropylphosphoramidite；3-[[(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
• CAS: 140613-57-6
• 化学式: C₃₉H₄₈N₅O₇P
• 分子量: 729.813
• InChiKey: AJYUUMFZCDSELL-MVFNBKNKSA-N

物化性质

• 沸点：
  771.7±70.0 °C(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5
• 重原子数：
  52
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  141
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxycytidine-3'-O-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylphosphoramidite] 在 四氮唑 、 水 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 以90%的产率得到5'-O-(p,p'-dimethoxytrityl)-2'-deoxycytidine 3'-(2-cyanoethyl) H-phosphonate
  参考文献：
  名称：

  通过H-膦酸烷基酯方法大规模合成液相寡核苷酸。

  摘要：

  描述了一种液相合成寡核苷酸的新方法，该方法基于使用烷基H-膦酸酯合成子和聚乙二醇（PEG5000）作为可溶性载体的氧化偶联。HBS的核苷烷基在NBS存在下进行氧化偶联。聚乙二醇作为可溶性聚合物载体的使用保留了固相合成的一些便利特征，并具有新的令人感兴趣的优点。该液相方法在速度和偶联收率方面看来是有效的，并且可以评估大量寡核苷酸（100 microM）的产生。

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(99)00287-4
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧胞苷盐酸盐 在 吡啶 、 二氯乙酸 、