2,2-diamino-4-[(2-deoxy-β-D-erythro-pentafuranosyl)amino]-5-(2H)-oxazolone | 137608-88-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 2,2-diamino-4-[(2-deoxy-β-D-erythro-pentafuranosyl)amino]-5-(2H)-oxazolone
• 英文别名: 2,2-diamino-4-[(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)amino]-2,5-dihydrooxazol-5-one；2,2-diamino-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-4-amino-5(2H)-oxazolone；2,2-diamino-5-[(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)amino]oxazol-5(2H)-one；2,2-diamino-4-[(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)amino]-5-(2H)-oxazolone；2,2,4-triamino-2H-oxazol-5-one-2'-deoxy；2,2-diamino-4-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]imino-1,3-oxazolidin-5-one
• CAS: 137608-88-9
• 化学式: C₈H₁₄N₄O₅
• 分子量: 246.223
• InChiKey: JUIZNKLBUQGNHU-VPENINKCSA-N

物化性质

• 沸点：
  485.5±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  2.09±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.6
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  152
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-amino-5-[(2'-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)amino]-4H-imidazol-4-one 在 phosphate buffer 、 水 作用下， 生成 2,2-diamino-4-[(2-deoxy-β-D-erythro-pentafuranosyl)amino]-5-(2H)-oxazolone
  参考文献：
  名称：

  由亚甲基蓝光氧化产生的单重态氧由2'-脱氧鸟苷形成二亚氨基-咪唑核苷。

  摘要：

  单线态氧（（1）O（2））能够诱导遗传毒性，致癌和诱变作用。以前有报道说（1）O（2）与2'-脱氧鸟苷的反应是DNA成分中（1）O（2）的主要靶标，导致形成多种氧化产物，包括8- oxo-7,8-dihydro-2'-deoxyguanosine和spiroiminodihydantoin，氨基咪唑酮和二氨基恶唑酮核苷。除了这些产品之外，我们还报告了一种新型的二亚氨基咪唑核苷，2,5-二亚氨基-4-[（2-脱氧-β-D-赤型戊呋喃糖基）氨基] -2H，5H-咪唑（dD）， 2'-脱氧鸟苷与（1）O（2）的反应是通过在有氧条件下在亚甲基蓝存在下用可见光照射而产生的。它的鉴定是基于与真实化合物相同的色谱和光谱数据，我们最近从2'-脱氧鸟苷与试剂HOCl和髓过氧化物酶-H（2）O（2）-Cl（-）的反应混合物中进行了分离和表征系统。dD的产率由D（2）O增加，而叠氮化物则降低。dD不是由8-oxo-7

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(03)00124-x

文献信息

• Hydroxyl radical-induced degradation of 2′-deoxyguanosine under reducing conditions
  作者：Thierry Douki、Sandrine Spinelli、Jean-Luc Ravanat、Jean Cadet

  DOI：10.1039/a903690c

  日期：——

  Addition of hydroxyl radical to the base moiety of 2′-deoxyguanosine (dGuo) leads to the formation of two main radicals exhibiting oxidising and reducing properties, respectively. The oxidising radical reacts with oxygen to yield 2,2-diamino-5-[2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)amino]oxazol-5(2H)-one (oxazolone) as the final product. The reducing radical is either preferentially oxidised into 8-oxo-7

  将羟基自由基加到2'-脱氧鸟苷（dGuo）的碱基部分上导致形成分别表现出氧化和还原性质的两个主要自由基。氧化性自由基与氧反应生成2,2-二氨基-5- [2-脱氧-β - D-赤型-戊呋喃糖基）氨基]恶唑-5（2 H）-（恶唑酮）为最终产物。还原基团可以优先氧化成8-oxo-7,8-dihydro-2'-deoxyguanosine（8-oxodGuo）或还原成2,6-二氨基-4-羟基-5-甲酰胺基嘧啶衍生物（FapydGuo），具体取决于情况。我们在这里报告说，还原化合物（抗坏血酸或半胱氨酸）的存在强烈地修饰了dGuo充气水溶液的γ辐射后修饰核苷的分布。恶唑酮的收率下降，而8-oxodGuo和FapydGuo的收率上升。这可以通过氧化自由基的还原来解释，该氧化自由基通过氧化和还原嘌呤自由基之间的反应阻止了dGuo的还原。该研究扩展到了N光化学释放˙OH时dGuo的分解-羟基嘧啶-2-硫酮（
• Are Pyridinethiones Reliable Photochemical Oxyl-Radical Sources for Photobiological Studies? The Importance of Secondary Photolysis Products in the Guanine Oxidation of 2‘-Deoxyguanosine and Cell-Free DNA
  作者：Waldemar Adam、Günther N. Grimm、Stefan Marquardt、Chantu R. Saha-Möller

  DOI：10.1021/ja9811849

  日期：1999.2.1

  process through the novel betain intermediate 8, which is formed in small amounts (ca. 5%) during the photolysis of these thiones from the intermediary photoproduct disulfide 3. This photosensitized guanine oxidation is effectively inhibited by the N,N‘-dioxide 7, which is produced only in the photolysis of the N-hydroxypyridine-2-thione (1a) and not from the N-alkoxy and N-benzoyloxy derivatives...

  吡啶硫酮 1a-d 的光解释放氧基（羟基、异丙氧基、叔丁氧基和苯甲酰氧基）自由基，通过链断裂和鸟嘌呤氧化损伤 DNA。出乎意料的是，与烷氧基和苯甲酰氧基衍生物 1b-d 相比，N-羟基衍生物 1a 在氧化无细胞 DNA 方面的效果明显较差。这些吡啶硫酮对 2'-脱氧鸟苷 (dG) 的光氧化消耗观察到类似的趋势。详细的机理研究表明，吡啶硫酮 1b-d 的鸟嘌呤氧化不是由氧自由基引起的，而是由通过新型甜菜碱中间体 8 的 I 型光氧化过程引起的，该中间体 8 在此过程中少量（约 5%）形成。这些硫酮从中间光产物二硫化物 3 中光解。
• Synthesis of Oligonucleotides Containing the (4R) and (4S) Diastereoisomers of 4,8-Dihydro-4-hydroxy-8-oxo-2′-deoxyguanosine
  作者：Anthony Romieu、Didier Gasparutto、Didier Molko、Jean-Luc Ravanat、Jean Cadet

  DOI：10.1002/(sici)1099-0690(199901)1999:1<49::aid-ejoc49>3.0.co;2-i

  日期：1999.1

  8-dihydro-4-hydroxy-8-oxo-2′-deoxyguanosine, the two main singlet oxygen oxidation products of 2′-deoxyguanosine, (4R)-4-OH-8-oxodGuo (3a) and (4S)-4-OH-8-oxodGuo (3b), into oligonucleotides has been achieved by means of phosphoramidite chemistry using the solid-phase synthesis approach. The synthesis of the phosphoramidite synthons 8a and 8b required 6 steps from 2′-deoxyguanosine and involved the simultaneous

  2，-脱氧鸟苷的两个主要单线态氧氧化产物4,4-8-二氢-4-羟基-8-氧代2'-脱氧鸟苷的（4 R）和（4 S）非对映异构体的插入（4 R）-4-OH-8-oxodGuo（3a）和（4 S）-4-OH-8-oxodGuo（3b），已通过亚磷酰胺化学方法使用固相合成方法实现了寡核苷酸合成。亚磷酰胺合成子8a和8b的合成需要从2'-脱氧鸟苷开始进行6个步骤，并且需要同时保护附加的叔羟基（4-OH）和N 2-通过乙酰化修饰的碱基的氨基。将修饰的亚磷酰胺8a，b有效地掺入几种寡核苷酸（3聚体，9聚体，14聚体和22聚体）中。合成低聚物中3a和3b的存在和完整性通过电喷雾电离质谱以及酶消化的HPLC和MALDI-TOF质谱分析进行了确认。使用各种酶，包括核酸内切酶（核酸酶P 1）和外切核酸酶（蛇毒磷酸二酯酶和小牛脾脏磷酸二酯酶）清楚地表明，3a，b与正常2'-脱氧核糖核苷之间的磷酸二酯键的酶促水解受到抑制。
• Reaction of Singlet Oxygen with 2'-Deoxyguanosine and DNA. Isolation and Characterization of the Main Oxidation Products
  作者：Jean-Luc Ravanat、Jean Cadet

  DOI：10.1021/tx00045a009

  日期：1995.4

  The reaction of singlet molecular oxygen with 2'-deoxyguanosine and DNA was studied. Emphasis was placed on the identification and characterization of the main methylene blue mediated type II (singlet oxygen) oxidation products of 2'-deoxyguanosine and its corresponding 3',5'-di-O-acetylated derivative. Two major oxidation products of 2'-deoxyguanosine were isolated and characterized by mass spectrometry

  研究了单线态分子氧与2'-脱氧鸟苷和DNA的反应。重点放在鉴定和表征2'-脱氧鸟苷及其相应的3'，5'-di-O-乙酰化衍生物的主要亚甲基蓝介导的II型（单氧）氧化产物上。分离并通过质谱分析和广泛的1H和13C NMR测量分离了2'-脱氧鸟苷的两个主要氧化产物，将其作为4,8-二氢-4-羟基-8-氧代-2'的两个4R *和4S *非对映异构体。 -脱氧鸟苷。还发现在相应的3'，5'-二-O-乙酰化衍生物的碱基部分上出现了1O2的添加。亚甲基蓝介导的2'-脱氧鸟苷的光敏作用还导致产生7,8-二氢-8-oxo-2'-脱氧鸟苷，但相对于上述两种非对映异构体而言，产率相对较低。证实了单线态氧参与这些氧化产物的形成机理。提出了一个合理的机制，该机制涉及通过单线态氧与嘌呤环的Diels-Alder 1,4-环加成反应生成的不稳定内过氧化物的瞬时形成。定量分析使我们能够证明4,8-二氢-4-羟基-8-氧
• DNA Damage by <i>tert</i>-Butoxyl Radicals Generated in the Photolysis of a Water-Soluble, DNA-Binding Peroxyester Acting as a Radical Source
  作者：Waldemar Adam、Günther N. Grimm、Chantu R. Saha-Möller、Francesco Dall'Acqua、Gorgia Miolo、Daniela Vedaldi

  DOI：10.1021/tx980089a

  日期：1998.9.1

  The photolysis of the water-soluble perester 1 leads to tert-butoxyl radicals as confirmed by EPR studies with the spin trap 5, 5-dimethylpyrroline N-oxide (DMPO). In the presence of DNA, oxidative cleavage of the latter was demonstrated by the formation of strand breaks in supercoiled pBR 322 DNA and by a substantial decrease of the melting temperature of salmon testes DNA. Guanidine, released from

  如使用自旋阱5、5-二甲基吡咯啉N-氧化物（DMPO）的EPR研究所证实的，水溶性过酸酯1的光解导致叔丁氧基自由基。在DNA存在下，后者的氧化裂解通过超螺旋pBR 322 DNA中链断裂的形成以及鲑鱼睾丸DNA的解链温度的显着降低来证明。用小牛胸腺DNA和2'-脱氧鸟苷观察到在碱处理下从例如恶唑酮和氧代咪唑烷释放的胍。这些DNA修饰被自由基清除剂二叔丁基甲酚或氢原子供体谷胱甘肽有效地抑制。芳烃生色团的光敏性被排除在外，因为相应的酯2不会引起DNA损伤，而过酯1的光产物也不具有活性。过氧化物1的氧化DNA的功效源于以下事实：通过阳离子过氧化物与DNA的静电结合，叔丁氧基在DNA的紧邻区域中被光解产生，如荧光测量所证实的。这些结果表明，perester 1的光解提供了水性介质中叔丁氧基自由基的合适来源，这是生化研究的必要前提。