YKELGFQG | 557064-50-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: YKELGFQG
• CAS: 557064-50-3
• 化学式: C₄₄H₆₄N₁₀O₁₃
• 分子量: 941.051
• InChiKey: JWTBWMAZVHBLTR-CVUOCSEZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.45
• 重原子数：
  67.0
• 可旋转键数：
  31.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  393.66
• 氢给体数：
  13.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  YKELGFQG 、 二乙烯基砜 在 potassium phosphate buffer 作用下， 生成
  参考文献：
  名称：

  Divinyl Sulfone as a Postdigestion Modifier for Enhancing the a₁ Ion in MS/MS and Postsource Decay:  Potential Applications in Proteomics

  摘要：

  在一项反应中，双乙烯砜在pH 8-9环境下与肽段N端残基、脯氨酸的α-氨基，赖氨酸的ε-氨基和组氨酸侧链发生作用。这种反应大大增强了原本在MS/MS分析中较弱或缺失的“a1”碎片离子的丰度，从而定义了一个蛋白质消化产物中肽链的N端残基。这提供了一种一步法类同于埃德曼降解的序列信息，再加上非常准确的分子量测定，往往能够正确识别一种蛋白质或一组蛋白质。在利用QTOF和MALDI-PSD进行的LC-MS/MS实验中，蛋白质混合物的多种肽链和胰蛋白酶消化产物证明了这一程序在蛋白质组学中的应用性。这一方法的优势在于其简单的化学反应，保留了电荷多样性，并可能缩短了数据库搜索时间。与其他MS/MS数据结合使用，它在肽质量指纹图谱中发现的蛋白质的评分和鉴定方面提供了更高的置信度。此外，由于该方法能够解码通常在MS/MS光谱中无法获得的肽链的第一个氨基酸信息，因此在从头测序方面具有优势。

  DOI：

  10.1021/ac049774e