3'-amino-2',3'-dideoxycytidine-5'-monophosphate | 1241883-71-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 3'-amino-2',3'-dideoxycytidine-5'-monophosphate
• 英文别名: 3'-Amino-2'-deoxy-cytidine-5'-monophosphate；[(2S,3S,5R)-3-amino-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
• CAS: 1241883-71-5
• 化学式: C₉H₁₅N₄O₆P
• 分子量: 306.215
• InChiKey: DLMWQJIDSZFHEV-SHYZEUOFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.6
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  161
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 3'-amino-2',3'-dideoxycytidine-5'-monophosphate 、 3-[4,4-difluoro-5-(4-methoxyphenyl)-4-bora-3a,4a-diaza-s-indacene-3-yl]propionic acid 在 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 水 为溶剂， 反应 2.08h， 以30%的产率得到[(2S,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3-[3-[2,2-difluoro-12-(4-methoxyphenyl)-3-aza-1-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-1(12),4,6,8,10-pentaen-4-yl]propanoylamino]oxolan-2-yl]methyl triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl hydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  3'-BODIPY 标记的核苷酸活性酯的合成和珠子上的化学引物延伸试验

  摘要：

  通过使用两种不同的 BODIPY 染料，针对胸腺嘧啶和胞嘧啶作为核碱基开发了 3'-荧光团标记的脱氧核苷 5'-单磷酸活性酯的液相合成。从各自的 2'-amino-2',3'-dideoxynucleoside-5'-monophosphate 开始，荧光 oxyazabenzotriazolides 可以在涉及标记和活化的一锅程序中制备。对一系列支持物的筛选导致对珠子进行化学引物延伸测定，通过光学读出原位检测目标 DNA 中的核碱基。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201000210