Bavarostat (EKZ-001) 是一种选择性组蛋白
脱乙酰酶 6 (H
DAC6)
抑制剂,含有间
氟苯异羟
肟酸 Zn 2+结合基团。最近确定的其与来自斑马鱼的 H
DAC6 的复合物的晶体结构表明,间
氟取代基仅结合在由 F583 和 F643 定义的芳香缝隙中,而不是面向溶剂。为了探索
抑制剂 C-F 基团在这种亲
氟缝隙中的结合,我们现在报道了一系列 10 种简单的
氟苯异羟
肟酸
酯,它们带有一个或多个具有不同取代模式的
氟原子。对人类和斑马鱼 H
DAC6 的抑制效力范围广泛,从 121 到 >30,000 nM。测得间二
氟苯异
肟酸 ( 5 )的最佳抑制效力,对人 H
DAC6 的IC 50 = 121 nM;尽管对人类和斑马鱼 H
DAC6 的活性趋势存在一些差异,但邻
氟苯异羟
肟酸 ( 1 ) 以及
氟苯异羟
肟酸4、7、9和10的抑制效力最差。这些研究表明,相对于非
氟化母体化合物异羟
肟酸
苯酯 (IC