来自人类微
生物群的
天然产物可能介导宿主的健康和疾病。但是,发现产生这些代谢产物的
生物合成
基因簇的发现远远超过了分子本身的鉴定。在这里,我们使用了一种独立于分离的方法来访问来自丰富的肠道共生细菌布鲁米球菌的非
核糖体肽合成酶编码
基因簇的可能产物。通过将
生物信息学与
生物合成酶的体外生化特征相结合,我们预测该途径可能会产生N-酰化的二肽醛(瘤胃肽素)。然后,我们使用
化学合成方法来获得公认的反刍肽素支架。这些化合物中的几种抑制
金黄色葡萄球菌内
蛋白酶GluC(SspA / V8
蛋白酶)。这种
蛋白酶的同系物存在于肠道共生和机会病原体以及人类肠道的
基因组中。总的来说,这项工作揭示了不依赖分离的方法可快速获取
生物活性化合物的实用性,并突出了肠道微
生物天然产物在靶向肠道微
生物蛋白酶方面的潜在作用。