(2S,3R)-3-azido-2-(fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)butyric acid | 146306-79-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: (2S,3R)-3-azido-2-(fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)butyric acid
• 英文别名: (2R,3S)-2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-azidobutanoic acid；(2S,3R)-2-(9-fluorenylmethyloxycarbonylamino)-3-azidobutanoic acid；(2S,3R)-Fmoc-3-azido-2-aminobutyric acid；Fmoc-Dab(N3)-OH；(2S,3R)-2-(Fmoc-amino)-3-azidobutyric acid；(2S,3R)-2-(Fmoc-amino)-3-azidobutanoic acid；(2S,3R)-3-azido-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)butanoic acid
• CAS: 146306-79-8
• 化学式: C₁₉H₁₈N₄O₄
• 分子量: 366.376
• InChiKey: LLJMYBCJYQGZOS-DIFFPNOSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  90
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

制备方法与用途

(2S,3R)-Fmoc-Abu(3-N3)-OH是一种含有叠氮基团的点击化学试剂，常用于各种生化研究。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S,3R)-3-azido-2-(fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)butyric acid 在 Lindlar's catalyst 氢气 、 碳酸氢钠 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 水 为溶剂， 25.0 ℃ 、399.99 kPa 条件下， 生成 (2S,3R)-3-(tert-butoxycarbonylamino)-2-(fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)butyric acid
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Enantiomerically Pure and Compatibly Protected (2S,3R)- and (2S,3S)-Diaminobutyric Acids

  摘要：

  (2S,3R)-和(2S,3S)-2, 3-二氨基丁酸具有 Fmoc 保护的 δ-氨基基团和兼容保护的 ²-氨基基团[(2S,3R)-和 (2S、(2S,3R)-和(2S,3S)-3-(叔丁氧羰基氨基)-2-(芴-9-甲氧羰基氨基)丁酸]可以从 L-苏氨酸和 L-异苏氨酸通过相应的酰肼经 Mitsunobu 反应制备成十克量。

  DOI：

  10.1055/s-1992-26332
• 作为产物：
  描述：

  N-Fmoc-allo-threonine 在 盐酸 、 N,N-bis[2-oxo-3-oxazolidinyl]phosphorodiamidic chloride 、 三(2-氯乙基)胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三苯基膦 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 生成 (2S,3R)-3-azido-2-(fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)butyric acid
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Enantiomerically Pure and Compatibly Protected (2S,3R)- and (2S,3S)-Diaminobutyric Acids

  摘要：

  (2S,3R)-和(2S,3S)-2, 3-二氨基丁酸具有 Fmoc 保护的 δ-氨基基团和兼容保护的 ²-氨基基团[(2S,3R)-和 (2S、(2S,3R)-和(2S,3S)-3-(叔丁氧羰基氨基)-2-(芴-9-甲氧羰基氨基)丁酸]可以从 L-苏氨酸和 L-异苏氨酸通过相应的酰肼经 Mitsunobu 反应制备成十克量。

  DOI：

  10.1055/s-1992-26332

文献信息

• The effect of replacing the ester bond with an amide bond and of overall stereochemistry on the activity of daptomycin
  作者：Ryan Moreira、Ghufran Barnawi、David Beriashvili、Michael Palmer、Scott D. Taylor

  DOI：10.1016/j.bmc.2018.12.004

  日期：2019.1

  daptomycin’s activity. ent-Dap-K6-E12-W13 was found to be at least 133-fold less active than Dap-K6-E12-W13, indicating that a chiral interaction with a chiral target is essential to daptomycin’s activity. Studies examining the binding of Dap-K6-E12-W13 and ent-Dap-K6-E12-W13 to model liposomes consisting of phosphatidylglycerol (PG) and phosphatidylcholine suggest that the stereochemistry of PG plays

  自2003年以来，达托霉素（一种环状脂肽肽抗生素）已在临床上用于治疗由革兰氏阳性细菌引起的严重感染。尽管达托霉素的发现已经过去了37年，但其作用机理仍存在争议。在本报告中，研究了用酰胺键取代酯键的效果以及总体立体化学对达托霉素生物活性的影响。制备了两种肽，其中活性达托霉素类似物Dap-K6-E12-W13中的苏氨酸4残基被（2 S，3 R）-二氨基丁酸（（2 S，3 R）-DABA）或其差向异构体取代（2秒，3秒-DABA）将闭环酯键转变成酰胺键。发现这两种肽的活性均显着低于Dap-K6-E12-W13。这些结果，加上我们先前对其他达托霉素类似物的研究，使我们得出结论，酯键对达托霉素的活性至关重要。发现ent -Dap-K6-E12-W13的活性至少比Dap-K6-E12-W13低133倍，这表明与手性靶的手性相互作用对于达托霉素的活性是必不可少的。研究检查Dap-K6-E12-W13和ent
• Total Synthesis of Malacidin A by β‐Hydroxyaspartic Acid Ligation‐Mediated Cyclization and Absolute Structure Establishment
  作者：Zhenquan Sun、Zhuo Shang、Nicholas Forelli、Kathy Hiu Laam Po、Sheng Chen、Sean F. Brady、Xuechen Li

  DOI：10.1002/anie.202009092

  日期：2020.11.2

  action is distinct from classical CDAs. However, the absolute structure of malacidin A has not been established. Herein, the total syntheses of malacidin A and its analogues are reported by a combination of Fmoc‐based solid‐phase peptide synthesis (SPPS) and β‐hydroxyaspartic acid ligation‐mediated peptide cyclization. The total synthesis enabled us to establish the absolute configuration of malacidin

  新型抗生素的开发对于对抗日益增多的耐药病原体至关重要。Malacidin A 是钙依赖性抗生素 (CDA) 家族的新成员，具有抗抗生素耐药性病原体的活性。它的作用方式不同于经典的 CDA。然而，尚未确定马拉西丁 A 的绝对结构。在此，通过基于 Fmoc 的固相肽合成 (SPPS) 和 β-羟基天冬氨酸连接介导的肽环化的组合报道了 Malacidin A 及其类似物的全合成。全合成使我们能够建立马拉西丁 A 的绝对构型，这与我们研究中高级 Marfey 分析证实的天然马拉西丁 A 的构型一致。
• Rational Design of a Highly Potent and Selective Peptide Inhibitor of PACE4 by Salt Bridge Interaction with D160 at Position P3
  作者：Vahid Dianati、Azar Shamloo、Anna Kwiatkowska、Roxane Desjardins、Armand Soldera、Robert Day、Yves L. Dory

  DOI：10.1002/cmdc.201700300

  日期：2017.8.8

  PACE4, a member of the proprotein convertases (PCs) family of serine proteases, is a validated target for prostate cancer. Our group has developed a potent and selective PACE4 inhibitor: Ac-LLLLRVKR-NH2 . In seeking for modifications to increase the selectivity of this ligand toward PACE4, we replaced one of its P3 Val methyl groups with a basic group capable of forming a salt bridge with D160 of PACE4

  PACE4是丝氨酸蛋白酶的前蛋白转化酶（PCs）家族的成员，是前列腺癌的有效靶标。我们小组开发了一种有效且选择性的PACE4抑制剂：Ac-LLLLRVKR-NH2。在寻求修饰以增加该配体对PACE4的选择性时，我们用能够与PACE4的D160形成盐桥的碱性基团取代了其P3 Val甲基之一。所得抑制剂的效力是P3 Val母体抑制剂的八倍，选择性是弗林蛋白酶的两倍，因为与弗林蛋白酶E257的等效盐桥不是最佳的。而且，新的P3残基的β-分支性质有利于通常与蛋白酶底物有关的扩展的β-折叠构象。
• [EN] ANTIBIOTIC NATURAL PRODUCT ANALOGUES<br/>[FR] ANALOGUES DE PRODUITS NATURELS ANTIBIOTIQUES
  申请人：UNIV BELFAST

  公开号：WO2022162332A1

  公开（公告）日：2022-08-04

  A compound of formula (I) or formula (II) including tautomeric or stereochemically isomeric forms thereof, wherein: R1represents C1-20 alkyl, C2-20 alkenyl, C6-20 aryl, or C4-20 heterocyclyl, each optionally substituted with one or more Y groups, R2ato R21each independently represents H, C1-10 alkyl, C2-10 alkenyl, C6-12 aryl, or C4-12 heterocyclyl, each optionally substituted with one or more Y groups, R3represents H, C1-10 alkyl, C2-10 alkenyl, C6-12 aryl, or C4-12 heterocyclyl, each optionally substituted with one or more Y groups, X represents NH, S or O, each Y independently represents cyano, halogen, N3, -C(O)RZ, -C(0)0Rz, -0C(0)Rz, -C(0)NHRZ, -NHC(O) Rz, -NHC(0)NHRZ, - NHC(NH)NHRZ, -NHC(0)0Rz, -0C(0)NHRz, -0S(0)2RZ, -S(0)2NHRZ, -NHS(0)2RZ, -SRZ, -NRZZ or -ORz, and each Rzindependently represents H, C1-10 alkyl, C2-10 alkenyl, C6-10 aryl, or C4-10 heterocyclyl; or an N-oxide thereof or a pharmaceutically acceptable salt thereof or a pharmaceutically acceptable solvate thereof; and wherein formula (I) excludes laterocidine, wherein formula (I) excludes relacidine A, and wherein formula (I) excludes relacidine B. A pharmaceutical composition comprising the compound. The compounds and pharmaceutical compositions are useful as antibiotics.

  化合物的化学式为(I)或(II)，包括其互变异构体或立体化学异构体，其中：R1代表C1-20烷基，C2-20烯基，C6-20芳基或C4-20杂环基，每个都可以选择地用一个或多个Y基取代，R2至R21各自独立地代表H，C1-10烷基，C2-10烯基，C6-12芳基或C4-12杂环基，每个都可以选择地用一个或多个Y基取代，R3代表H，C1-10烷基，C2-10烯基，C6-12芳基或C4-12杂环基，每个都可以选择地用一个或多个Y基取代，X代表NH，S或O，每个Y独立地代表氰基，卤素，N3，-C（O）RZ，-C（0）0Rz，-0C（0）Rz，-C（0）NHRZ，-NHC（O）Rz，-NHC（0）NHRZ，-NHC（NH）NHRZ，-NHC（0）0Rz，-0C（0）NHRz，-0S（0）2RZ，-S（0）2NHRZ，-NHS（0）2RZ，-SRZ，-NRZZ或-ORz，每个Rz独立地代表H，C1-10烷基，C2-10烯基，C6-10芳基或C4-10杂环基；或其N-氧化物或药学上可接受的盐或药学上可接受的溶剂；其中化学式(I)不包括laterocidine，化学式(I)不包括relacidine A，化学式(I)不包括relacidine B。包括该化合物的制药组合物。该化合物和制药组合物可用作抗生素。
• Synthesis of Enantiomerically Pure and Compatibly Protected (2<i>S</i>,3<i>R</i>)- and (2<i>S</i>,3<i>S</i>)-Diaminobutyric Acids
  作者：U. Schmidt、K. Mundinger、B. Riedl、G. Haas、R. Lau

  DOI：10.1055/s-1992-26332

  日期：——

  Enantiomerically pure (2S,3R)- and (2S,3S)-2, 3-diaminobutyric acids with Fmoc protected α-amino groups and compatibly protected β-amino groups [(2S,3R)- and (2S,3S)-3-(tert-butoxycarbonyl-amino)-2-(fluoren-9- ylmethoxycarbonylamino)butyric acid] can be prepared in decagram amounts starting from L-threonine and L-allothreonine via the corresponding hydrazides by the Mitsunobu reaction.

  (2S,3R)-和(2S,3S)-2, 3-二氨基丁酸具有 Fmoc 保护的 δ-氨基基团和兼容保护的 ²-氨基基团[(2S,3R)-和 (2S、(2S,3R)-和(2S,3S)-3-(叔丁氧羰基氨基)-2-(芴-9-甲氧羰基氨基)丁酸]可以从 L-苏氨酸和 L-异苏氨酸通过相应的酰肼经 Mitsunobu 反应制备成十克量。