6-ethylphenyl-2-thioxo-2,3-dihydro-1H-pyrimidin-4-one | 656822-33-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 6-ethylphenyl-2-thioxo-2,3-dihydro-1H-pyrimidin-4-one
• 英文别名: 6-phenethyl-2-thioxo-2,3-dihydro-1H-pyrimidin-4-one；6-Phenaethyl-2-thioxo-2,3-dihydro-1H-pyrimidin-4-on；2-Mercapto-6-phenethylpyrimidin-4-ol；6-(2-phenylethyl)-2-sulfanylidene-1H-pyrimidin-4-one
• CAS: 656822-33-2
• 化学式: C₁₂H₁₂N₂OS
• 分子量: 232.306
• InChiKey: OVJRYRSIWUSVPL-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  223.5-225.5 °C(Solv: water (7732-18-5))
• 密度：
  1.28±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  73.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-ethylphenyl-2-thioxo-2,3-dihydro-1H-pyrimidin-4-one 在 氯乙酸 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 2,4-dichloro-6-ethylphenylpyrimidine
  参考文献：
  名称：

  设计，合成和体外生物学评估雌激素受体α共激活因子结合的小分子抑制剂。

  摘要：

  与激动剂配体复合的核受体（NRs）通过募集共激活蛋白复合物来激活转录。原则上，应该使用适当设计的共激活因子结合抑制剂（CBI）直接阻止这种转录关键受体-共激活因子的相互作用，从而抑制NRs的转录活性。为了指导我们各种CBI的设计，我们使用了激动剂结合的雌激素受体（ER）配体结合结构域（LBD）的晶体结构，该结构与含有LXXLL签名基元并结合到表面疏水槽的助活化剂肽复合的LBD。一组基于从外而内的设计方法的CBI，具有各种杂环核心（三氮烯，嘧啶，三硫杂环己烷，环己烷），它们模仿肽螺旋上三个亮氨酸的系链位点，在其上连接有亮氨酸残基样取代基。另一组基于“由内而外”的方法，具有一个萘核，该萘核模拟两个最深埋的亮氨酸，其取代基向外延伸，以模拟共活化剂螺旋肽的其他特征。开发了一种基于荧光各向异性的共激活剂竞争测定法，以测量这些CBI与ER激动剂复合物与共激活剂相互作用的凹槽位点的特异性结合。对照配体结

  DOI：

  10.1021/jm030404c
• 作为产物：
  描述：

  3-苯丙酰氯 在 乙醚 、 sodium ethanolate 作用下， 生成 6-ethylphenyl-2-thioxo-2,3-dihydro-1H-pyrimidin-4-one
  参考文献：
  名称：

  化疗研究；抗甲状腺化合物；由β-氧酸酯和硫脲合成5-和6​​-取代的2-硫尿嘧啶。

  摘要：

  DOI：

  10.1021/ja01228a042

文献信息

• Dihydro(alkylthio)(naphthylmethyl)oxopyrimidines:  Novel Non-Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors of the <i>S</i>-DABO Series
  作者：Antonello Mai、Marino Artico、Gianluca Sbardella、Silvana Quartarone、Silvio Massa、Anna G. Loi、Antonella De Montis、Franca Scintu、Monica Putzolu、Paolo La Colla

  DOI：10.1021/jm960802y

  日期：1997.5.1

  (S-DABOs). Chemical modifications at N-3, C-4, and C-6 of the pyrimidine ring were attempted with the aim of improving antiretroviral activity. In particular, replacement of the benzyl group with the 1-naphthylmethyl moiety enhanced the activity of S-DABOs, whereas N-3 alkylation and C=O transformation into C=S at position 4 of the pyrimidine ring led to compounds devoid of anti-HIV-1 activity. Lower

  已经合成了与2-（环己基硫基）-3,4-二氢-5-甲基-6-（3-甲基苄基）-4-氧嘧啶（3c，MC 639）相关的新型化合物，并已作为人免疫缺陷病毒类型的抑制剂进行了测试-1（HIV-1）。硫脲与芳基甲基乙酰乙酸乙酯反应，得到5-烷基-6-（芳基甲基）-3,4-二氢-2-巯基-4-氧嘧啶，然后在硫原子上烷基化，得到所需的2-烷硫基或2-环烷硫基衍生物（S-DABO）。为了改善抗逆转录病毒活性，尝试了在嘧啶环的N-3，C-4和C-6处进行化学修饰。特别是，用1-萘甲基甲基部分取代苄基可增强S-DABO的活性，而在嘧啶环的4位上N-3烷基化和C = O转化为C = S则导致化合物缺乏抗HIV-1活性。当1-萘甲基被异构体2-萘甲基取代时，通常观察到较低的活性。最具活性的化合物在低微摩尔范围内显示活性，其EC50值可与奈韦拉平相当。
• Synthesis and Biological Properties of Novel, Uracil-Containing Histone Deacetylase Inhibitors
  作者：Antonello Mai、Silvio Massa、Dante Rotili、Silvia Simeoni、Rino Ragno、Giorgia Botta、Angela Nebbioso、Marco Miceli、Lucia Altucci、Gerald Brosch

  DOI：10.1021/jm0605536

  日期：2006.10.1

  A novel series of compounds containing a uracil moiety as the connection unit between a phenyl/phenylalkyl portion and a N-hydroxy-polymethylenealkanamide or -methylenecinnamylamide group (uracil-based hydroxamic acids, UBHAs) was tested against maize histone deacetylases (HDACs) and mouse HDAC1. Compounds with a phenyl/benzyl ring at the uracil-C6 position and bearing 4-5 carbon units as well as a

  测试了一系列新的化合物，其中包含尿嘧啶部分作为苯基/苯基烷基部分与N-羟基-聚亚甲基铝酰胺或-亚甲基肉桂酰胺基之间的连接单元（基于尿嘧啶的异羟肟酸，UBHA）对玉米组蛋白脱乙酰基酶（HDACs）和小鼠的抑制作用HDAC1。最有效的抑制剂是在尿嘧啶-C6位置具有苯基/苄基环且带有4-5个碳单元以及间-或对-亚甲基肉桂基部分作为间隔基的化合物。在基于细胞的人类HDAC1和HDAC4分析中，测试的两个UBHA抑制了HDAC1，但没有抑制HDAC4的免疫沉淀活性。在人白血病U937细胞中进行测试时，一些UBHA会导致细胞周期的G1期停滞。此外，1j显示出高抗增殖和剂量依赖性的粒细胞分化特性。
• Specific Inhibitors of Mitochondrial Deacylase Sirtuin 4 Endowed with Cellular Activity
  作者：Martin Pannek、Zayan Alhalabi、Daniela Tomaselli、Martina Menna、Francesco Fiorentino、Dina Robaa、Michael Weyand、Maximilian Puhlmann、Stefano Tomassi、Federica Barreca、Marco Tafani、Elma Zaganjor、Marcia C. Haigis、Wolfgang Sippl、Dante Rotili、Antonello Mai、Clemens Steegborn

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.3c01496

  日期：2024.2.8

  virtual screen revealed 12 active compounds. A focused screen based on two top compounds, followed by structure-assisted design of derivatives, yielded four first-in-class potent Sirt4 inhibitors. Kinetic analyses indicate compound competition with the acyl peptide substrate, consistent with the docking models and implicating Sirt4’s unique acyl binding site. The compounds indeed show preference for Sirt4

  Sirtuins 是 NAD +依赖性蛋白质赖氨酸脱酰酶，与衰老相关疾病有关。哺乳动物 Sirtuin 4 (Sirt4) 位于线粒体中，是癌症和代谢疾病的潜在治疗靶点，但尚未报道有效且选择性的 Sirt4 抑制剂。在这里，我们描述了有效的 Sirt4 特异性小分子抑制剂的鉴定。通过基于目标的虚拟屏幕测试命中结果，发现了 12 种活性化合物。基于两种顶级化合物的重点筛选，随后进行衍生物的结构辅助设计，产生了四种一流的强效 Sirt4 抑制剂。动力学分析表明化合物与酰基肽底物竞争，与对接模型一致并暗示 Sirt4 独特的酰基结合位点。这些化合物确实比其他亚型更偏好 Sirt4，其中一种 ( 69 ) 具有高度亚型选择性，并且它们在细胞中具有活性。我们的结果为优化 Sirt4 特异性抑制剂提供了第一个先导化合物和机制见解，可用作实验工具和潜在的治疗方法。
• Synthesis of β-Keto Esters In-Flow and Rapid Access to Substituted Pyrimidines
  作者：Hannah E. Bartrum、David C. Blakemore、Christopher J. Moody、Christopher J. Hayes

  DOI：10.1021/jo101783m

  日期：2010.12.17

  We have developed an in-flow process for the synthesis of beta-keto esters via the BF3 center dot OEt2-catalyzed formal C-H insertion of ethyl diazoacetate into aldehydes. The beta-keto esters were then condensed with a range of amidines to give a variety of 2,6-substituted pyrimidin-4-ols.
• Exploring the connection unit in the HDAC inhibitor pharmacophore model: Novel uracil-based hydroxamates
  作者：Antonello Mai、Silvio Massa、Dante Rotili、Riccardo Pezzi、Patrizia Bottoni、Roberto Scatena、Joachim Meraner、Gerald Brosch

  DOI：10.1016/j.bmcl.2005.07.081

  日期：2005.11

  Starting from the pharmacophore model for HDAC inhibitor design, a novel series of hydroxamates bearing a uracil moiety as connecting unit (CU) has been prepared and tested. Almost all compounds exhibited HDAC inhibiting activity at low nanomolar concentrations, the N-hydroxy-6-(3,4-dihydro-4-oxo-6-benzyl- and -6-phenyl-2-pyrimidinylthio)hexanamides 1d and 11 being more potent than SAHA in enzymatic assays. Such compounds also caused hyperacetylation in NIH3T3 cell core histones and were endowed with interesting antiproliferative and cytodifferentiating effects in human leukemia (HL-60) cells. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.