在本研究中,我们试图通过探索药物上广泛使用的酶靶标来开发一类新型的对
铜绿假单胞菌(Pausudoer aeruginosa)有活性的化合物。由于缺乏Pa促旋酶B晶体结构,因此将与新霉素(1KIJ)配合使用的Thermus thermophilus促旋酶B作为模板,通过进行同源性建模来生成模型结构。进一步验证了最佳模型,并使用内部数据库鉴定Pa DNA促旋酶B
抑制剂,可用于高通量虚拟筛选,对接和动力学模拟。这项研究导致鉴定了针对Pa促旋酶超螺旋测定法的三个
铅分子,IC50值在6.25-15.6 µM之间。Lead-1的优化和扩展产生了15种化合物。在合成的化合物中,六个化合物显示出比Lead-1(IC50 6.25 µM)更好的酶抑制作用。化合物13以最有潜力的化合物出现,表现出Pa促旋酶超螺旋的抑制作用,IC50为2.2 µM。在外排泵
抑制剂存在下,MIC为8 µg / mL的体外Pa活性