(2R,3S,5R)-5-(4-amino-5-fluoro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol | 652965-07-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯并嘧啶类
• 英文名称: (2R,3S,5R)-5-(4-amino-5-fluoro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol
• 英文别名: 4-amino-7-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-5-fluoro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine；7-deaza-7-fluoro-2'-deoxyadenosine；2'-deoxy-5-fluorotubercidin；7-fluoro-2'-deoxytubercidin；4-amino-5-fluoro-7-(2'-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidine；(2R,3S,5R)-5-(4-amino-5-fluoropyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• CAS: 652965-07-6
• 化学式: C₁₁H₁₃FN₄O₃
• 分子量: 268.248
• InChiKey: JAUILBSAMNYPFI-XLPZGREQSA-N

物化性质

• 熔点：
  165 °C(Solv: dichloromethane (75-09-2); methanol (67-56-1))
• 沸点：
  603.1±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.84±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.3
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  106
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

制备方法与用途

7-(2-脱氧-β-D-红-内呋喃基)-5-氟-7H-吡咯并[2,3-D]嘧啶-4-胺是一种嘧啶核苷类似物。这类化合物具有广泛的生物化学和抗癌活性，包括抑制DNA合成、RNA合成、抗病毒作用以及免疫调节作用等。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3S,5R)-5-(4-amino-5-fluoro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol 在 咪唑 、 水 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.17h， 生成 ((2R,3S,5R)-5-(4-amino-5-fluoro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-3-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)tetrahydrofuran-2-yl)methanol
  参考文献：
  名称：

  [EN] 4'-SUBSTITUTED NUCLEOSIDE REVERSE TRANSCRIPTASE INHIBITORS
  [FR] INHIBITEURS NUCLÉOSIDIQUES SUBSTITUÉS EN 4' DE LA TRANSCRIPTASE INVERSE

  摘要：

  提供了Formula I的4'-取代核苷衍生物及其在抑制HIV逆转录酶、预防HIV感染、治疗HIV感染以及预防、治疗和延迟AIDS和/或ARC的发病或进展中的用途。

  公开号：

  WO2015143712A1
• 作为产物：
  描述：

  4-氯-5-氟-7H-吡咯并[2,3-D]-嘧啶 在 氢氧化钾 、 ammonium hydroxide 、 三(3,6-二氧杂庚基)胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 24.41h， 生成 (2R,3S,5R)-5-(4-amino-5-fluoro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol
  参考文献：
  名称：

  氟化吡咯并[2,3-d]嘧啶核苷：7- Fluoro-7-deazapurine 2'-Deoxyribofuranosides 和 2'-Deoxy-2'-fluoroarabinofuranosyl 衍生物

  摘要：

  7-deaza-7-fluoro-2¢-deoxyadenosine (1a)、7-deaza-7-fluoro-2¢-deoxyinosine (3a) 和 7-deaza-7-fluoro-2¢-deoxyguanosine (3c) 的合成以及 2¢-deoxy-2¢-fluoroarabino-furanosyl 衍生物 1b、3b 的描述。起始原料是 6-chloro-7-fluoro-7-deazapurine (4-chloro-5-fluoropyrrolo(2,3-d)pyrimidine, 4b) 和 2-pivaloylamino-6-chloro-7-fluoro-7-deaza-嘌呤 (2-pivaloylamino-4-chloro-5-fluoropyrrolo(2,3-d)pyrimidine, 6)。4b 或 6 与卤代糖 7 或 9 的核碱基阴离子糖基化提供受保护的

  DOI：

  10.1055/s-2006-942400

文献信息

• 6-AZAPYRIMIDINE AND 7-DEAZAPURINE 2′-DEOXY-2′-FLUOROARABINONUCLEOSIDES: SYNTHESIS, CONFORMATION AND PROPERTIES OF OLIGONUCLEOTIDES
  作者：Frank Seela、Padmaja Chittepu、Yang He、Junlin He、Kuiying Xu

  DOI：10.1081/ncn-200059181

  日期：2005.4.1

  The synthesis of 2′-deoxy-2′-fluoro-β-d-arabinofuranosyl nucleosides (1b, 2b, and 3b) were described and their conformation in solution as well as in the solid state was determined. In addition to this, building blocks 10a,b and 13a,b were prepared and employed in solid-phase oligonucleotide synthesis. For compounds 1a and 1b the lactime proton is protected to avoid unresolved degradation of its phosphoramidites

  描述了 2'-脱氧-2'-氟-β-d-阿拉伯呋喃糖基核苷（1b、2b 和 3b）的合成，并确定了它们在溶液和固态中的构象。除此之外，还制备了结构单元 10a、b 和 13a、b 并将其用于固相寡核苷酸合成。对于化合物 1a 和 1b，内酰胺质子被保护以避免其亚磷酰胺 10a、b 未解决的降解。已进行紫外线熔化研究以评估含有化合物 1a、b 和 3a、b 的寡核苷酸的热稳定性。
• DNA with stable fluorinated dA and dG substitutes: syntheses, base pairing and 19F-NMR spectra of 7-fluoro-7-deaza-2′-deoxyadenosine and 7-fluoro-7-deaza-2′-deoxyguanosine
  作者：Frank Seela、Kuiying Xu

  DOI：10.1039/b806145a

  日期：——

  in the "purine" base were synthesized for the first time. For this, the phosphoramidites of 7-fluoro-7-deaza-2'-deoxyadenosine and 7-fluoro-7-deaza-2'-deoxyguanosine were prepared and oligonucleotides were synthesized. The 7-fluoro substitution leads to increased duplex stability and more selective base pairing compared to the non-functionalized 7-deazapurine oligonucleotides. (19)F NMR spectra of fluorinated

  首次合成了在“嘌呤”碱基中包含稳定的氟取代基的氟化DNA。为此，制备了7-氟-7-脱氮-2'-脱氧腺苷和7-氟-7-脱氮-2'-脱氧鸟苷的亚磷酰胺，并合成了寡核苷酸。与未官能化的7-脱氮嘌呤寡核苷酸相比，7-氟取代导致双链体稳定性提高，碱基配对更具选择性。氟化核苷，单链寡核苷酸和DNA双链体的（19）F NMR谱仅显示一个氟修饰的单个信号。NMR敏感的（19）F自旋或发射正电子的（18）F同位素使这些化合物适用于体外和体内DNA检测或成像。
• 4'-SUBSTITUTED NUCLEOSIDE REVERSE TRANSCRIPTASE INHIBITORS
  申请人：Merck Sharp & Dohme Corp.

  公开号：US20150274767A1

  公开（公告）日：2015-10-01

  The present invention is directed to 4′-substituted nucleoside derivatives of Formula I and their use in the inhibition of HIV reverse transcriptase, the prophylaxis of infection by HIV, the treatment of infection by HIV, and the prophylaxis, treatment, and delay in the onset or progression of AIDS and/or ARC.

  本发明涉及式I的4'-取代核苷衍生物及其在抑制HIV逆转录酶、预防HIV感染、治疗HIV感染以及预防、治疗和延缓AIDS和/或ARC的发病或进展中的应用。
• Cyclic di-nucleotide compounds as sting agonists
  申请人：Merck Sharp & Dohme Corp.

  公开号：US10106574B2

  公开（公告）日：2018-10-23

  A class of polycyclic compounds of general formula (I), of general formula (I′), or of general formula (I″), wherein Base1, Base2, Y, Ya, Xa, Xa1, Xb, Xb1, Xc, Xc1, Xd, Xd1, R1, R1a, R2, R2a, R3, R4, R4a, R5, R6, R6a, R7, R7a, R8, and R8a are defined herein, that may be useful as inductors of type I interferon production, specifically as STING active agents, are provided. Also provided are processes for the synthesis and use of compounds.

  一类通式(I)、通式(I′)或通式(I″)的多环化合物，其中Base1、Base2、Y、Ya、Xa、Xa1、Xb、Xb1、Xc、Xc1、Xd、Xd1、R1、R1a、R2、本文定义的 R2a、R3、R4、R4a、R5、R6、R6a、R7、R7a、R8 和 R8a 可用作 I 型干扰素产生的诱导剂，特别是 STING 活性剂。还提供了合成和使用这些化合物的工艺。
• Cyclic di-nucleotide compounds as STING agonists
  申请人：Merck Sharp & Dohme Corp.

  公开号：US10759825B2

  公开（公告）日：2020-09-01

  A class of polycyclic compounds of general formula (I), of general formula (I′), or of general formula (I″), wherein Base1, Base2, Y, Ya, Xa, Xa1, Xb, Xb1, Xc, Xc1, Xd, Xd1, R1, R1a, R2, R2a, R3, R4, R4a, R5, R6, R6a, R7, R7a, R8, and R8a are defined herein, that may be useful as inductors of type I interferon production, specifically as STING active agents, are provided. Also provided are processes for the synthesis and use of compounds.

  一类通式(I)、通式(I′)或通式(I″)的多环化合物，其中Base1、Base2、Y、Ya、Xa、Xa1、Xb、Xb1、Xc、Xc1、Xd、Xd1、R1、R1a、R2、本文定义的 R2a、R3、R4、R4a、R5、R6、R6a、R7、R7a、R8 和 R8a 可用作 I 型干扰素产生的诱导剂，特别是 STING 活性剂。还提供了合成和使用这些化合物的工艺。