5-phenylcytosine | 21325-49-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 5-phenylcytosine
• 英文别名: 2(1H)-Pyrimidinone, 6-amino-5-phenyl-；6-amino-5-phenyl-1H-pyrimidin-2-one
• CAS: 21325-49-5
• 化学式: C₁₀H₉N₃O
• mdl: MFCD00223709
• 分子量: 187.201
• InChiKey: OXNMCOVZKMZLHE-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  >310 °C (decomp)
• 密度：
  1.33±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.5
• 重原子数：
  14
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  67.5
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-phenylcytosine 在 ammonium sulfate 、 氨 、 四氯化锡 作用下， 以 甲醇 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 141.0h， 生成 5-苯基胞苷
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 5-Phenylcytosine Nucleoside Derivatives

  摘要：

  使用锡四氯化物催化，将硅化5-苯基胞嘧啶与1-O-乙酰基-2,3,5-三-O-苯甲酰-D-核糖反应，随后进行甲醇解，得到5-苯基胞苷（2）。该化合物与乙腈中的亚磺酰氯反应，生成环状亚磺酸（3），在二甲基甲酰胺中加热后转化为2,2'-脱水-1-(β-D-阿拉伯呋喃核苷基)-5-苯基胞嘧啶（4）。将化合物2与亚磺酰氯在回流下反应，得到5'-氯-5'-脱氧-2',3'-环状亚磺酸（5）。在二甲基甲酰胺中加热，得到5'-氯-2,2'-脱水衍生物（6），温和的碱性水解导致5'-氯-5'-脱氧-5-苯基胞苷（7）。5-苯基-2,2'-脱水胞苷（4）的碱性水解得到5-苯基胞苷阿拉伯苷（8），而2,2'-脱水衍生物（6）则生成1-(5-氯-5-脱氧-β-D-阿拉伯呋喃核苷基)-5-苯基胞嘧啶（11）。在较高温度下，最终反应产物为2,5'-脱水-5-苯基胞苷（12）。5'-氯-5'-脱氧核苷（7）和（11）与三正丁基锡反应，得到5'-脱氧核糖和5'-脱氧阿拉伯核糖衍生物（15）和（16）。将5-苯基胞苷（2）转化为N4-醋酸酯（17），使用乙酸酐和氢溴酸在乙酸中进一步反应，得到2'-溴和3'-溴的过乙酰化混合物（18）和（19）。与锌/铜偶对反应，得到5'-O-乙酰基-5-苯基-2',3'-双去氢衍生物（20）和2',3',5'-三-O-乙酰基-5-苯基胞嘧啶（21）。化合物（20）去保护后得到1-(2,3-二脱氧-β-D-glycero-pent-2-enofuranosyl)-5-苯基胞嘧啶（22）。化合物（20）在钯催化下进行催化氢化，随后去保护2',3'-二脱氧衍生物（23）得到1-(2,3-二脱氧-β-D-glycero-pentofuranosyl)-5-苯基胞嘧啶（24）。

  DOI：

  10.1135/cccc19960645
• 作为产物：
  描述：

  Alpha-甲酰基苯乙酸乙酯 在 sodium hydroxide 、 乙醇 、 氨 、 水 、 氢溴酸 、 三氯氧磷 作用下， 生成 5-phenylcytosine
  参考文献：
  名称：

  Researches on Pyrimidines. The Molecular Rearrangement of 2-Ethylmercapto-5-phenyl-6-thiocyanopyrimidine^1,2

  摘要：

  DOI：

  10.1021/ja01337a049

文献信息

• [EN] MODIFIED NUCLEIC ACID MOLECULES AND USES THEREOF<br/>[FR] MOLÉCULES D'ACIDE NUCLÉIQUE MODIFIÉES ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：MODERNA THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2014093924A1

  公开（公告）日：2014-06-19

  The present disclosure provides modified nucleosides, nucleotides, and nucleic acids, and methods of using them.

  本公开提供了经修改的核苷、核苷酸和核酸，以及它们的使用方法。
• Synthesis of various 5-arylsubstituted cytosines
  作者：Dan Peters、Anna-Britta Hörnfeldt、Salo Gronowitz

  DOI：10.1002/jhet.5570280626

  日期：1991.10

  Some Pd-catalyzed coupling reactions have been evaluated for the synthesis of 5-substituted cytosines. A large number of 5-arylcytosines were prepared in good yields by using 2,4-O,N-bis-trimethylsilyl-5-iodocytosine with various aryl tin compounds. The use of trimethylsilyl groups proved to be essential for the reaction, attempted coupling of 5-iodocytosine and 2-trimethylstannylthiazole was not successful

  已评估了某些Pd催化的偶联反应可合成5取代的胞嘧啶。通过将2，4 - O，N-双-三甲基甲硅烷基-5-碘胞嘧啶与各种芳基锡化合物一起使用，以高收率制备了大量5-芳基胞嘧啶。已证明使用三甲基甲硅烷基对于该反应是必不可少的，尝试将5-碘胞嘧啶和2-三甲基苯乙烯基噻唑偶联是不成功的。不幸的是未成功的一种方便的替代方案是将偶联官能团反转并使商用的芳基卤化物与5-三甲基锡烷基-或5-三丁基锡烷基衍生物或相应的2,4 - O，N-双-三烷基甲硅烷基胞嘧啶偶联。
• Pyrimidine Acyclic Nucleotide Analogues with Aromatic Substituents in C-5 Position
  作者：Marcela Krečmerová、Antonín Holý、Milena Masojídková

  DOI：10.1135/cccc20070927

  日期：——

  NH₂-protected 5-phenylcytosine and its derivatives 2a-2d were treated with (2S)-2-[(trityloxy)methyl]oxirane (3) followed by etherification with diisopropyl [(tosyloxy)methyl]phosphonate (5) in the presence of sodium hydride. The intermediary phosphonate esters 6 were debenzoylated and subsequently transformed to free phosphonic acids, i.e. (S)-1-[3-hydroxy-2-(phosphonomethoxy)propyl]-5-phenylcytosine (5-phenyl-HPMPC) derivatives (8a-8d) by the action of bromotrimethylsilane and subsequent hydrolysis. Deamination of these compounds with 3-methylbutyl nitrite afforded corresponding (S)-1-[3-hydroxy-2-(phosphonomethoxy)propyl]-5-phenyluracil (5-phenyl-HPMPU) derivatives (9a-9d). R-Enantiomers 14 and 15 were prepared analogously starting from (2R)-2-[(trityloxy)methyl]oxirane. 5-Benzyl-, 5-[(1-naphthyl)methyl]- and 5-[(2-naphthyl)methyl]HPMPU (24a-24c) and -HPMPC (25a-25c) were synthesized from appropriate 5-arylmethyl-4-methoxypyrimidin-2(1H)-ones similarly as described for 5-phenyl derivatives. Antiviral activity was found for (S)-1-[3-hydroxy-2-(phosphonomethoxy)propyl]-5-phenyluracil (9a) (HSV-1 and HSV-2) and (R)-1-[3-hydroxy2-(phosphonomethoxy)propyl]-5-phenylcytosine (14) (cytomegalovirus and varicella-zoster virus), both tested in cell cultures. Some of the 5-phenyluracil derivatives possessed inhibitory activity against thymidine phosphorylase from SD-lymphoma.

  NH₂保护的5-苯基胞嘧啶及其衍生物2a-2d与(2S)-2-[(三苄氧基)甲基]环氧乙烷(3)反应，随后在钠氢化物存在下与二异丙基[(对甲苯磺酰氧基)甲基]膦酸酯(5)醚化。中间体膦酸酯6被去苄酰化，随后转化为自由膦酸，即(5-苯基-HPMPC)衍生物8a-8d，通过溴三甲基硅烷的作用和随后的水解。这些化合物经过3-甲基丁基亚硝酸酯的去氨基化处理，得到相应的(5-苯基-HPMPU)衍生物9a-9d。类似地，从(2R)-2-[(三苄氧基)甲基]环氧乙烷开始，制备了R-对映体14和15。通过适当的5-芳基甲基-4-甲氧基嘧啶-2(1H)-酮合成了5-苄基、5-[(1-萘基)甲基]和5-[(2-萘基)甲基]HPMPU(24a-24c)和-HPMPC(25a-25c)，类似于5-苯基衍生物的合成方法。在细胞培养中测试后，发现(S)-1-[3-羟基-2-(膦甲氧基)丙基]-5-苯基尿嘧啶(9a) (HSV-1和HSV-2)和(R)-1-[3-羟基2-(膦甲氧基)丙基]-5-苯基胞嘧啶(14) (巨细胞病毒和水痘-带状疱疹病毒)具有抗病毒活性。一些5-苯基尿嘧啶衍生物对SD-淋巴瘤的胸苷磷酸酶具有抑制活性。
• ALTERNATIVE NUCLEIC ACID MOLECULES AND USES THEREOF
  申请人：Moderna Therapeutics, Inc.

  公开号：US20150167017A1

  公开（公告）日：2015-06-18

  The present disclosure provides alternative nucleosides, nucleotides, and nucleic acids, and methods of using them.

  本公开提供了替代核苷、核苷酸和核酸以及它们的使用方法。
• MODIFIED NUCLEIC ACID MOLECULES AND USES THEREOF
  申请人：MODERNA THERAPEUTICS, INC.

  公开号：US20150307542A1

  公开（公告）日：2015-10-29

  The present disclosure provides modified nucleosides, nucleotides, and nucleic acids, and methods of using them.

  本公开提供了修改的核苷酸，核苷酸和核酸，以及使用它们的方法。