5'-UGA-3'

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: 5'-UGA-3'
• 英文别名: rUrd-P-rGuo-P-rAdo；[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-4-hydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate
• 化学式: C₂₉H₃₆N₁₂O₁₉P₂
• 分子量: 918.621
• InChiKey: LUROPZGZZXBVTQ-POYLIAOGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -8.8
• 重原子数：
  62
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  445
• 氢给体数：
  11
• 氢受体数：
  24

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5'-[32P]-pCGCUGA-3' 在 bimetallic Cu(II) complex of [12]aneN₃ macrocycle 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 5'-[32P]-pCGC-cyclophosphate 、 5'-UGA-3'
  参考文献：
  名称：

  基于杯[4]芳烃的合成金属核酸酶对RNA寡核苷酸的高效选择性切割

  摘要：

  [12]aneN3 大环的双核和三核铜 (II) 配合物锚定在锥形杯 [4] 芳烃上缘的 1,2-、1,3-和 1,2,3-位被研究为裂解6-、7-和17-聚寡核糖核苷酸试剂。使用凝胶电泳进行裂解反应的动力学研究以分离和分析在末端 5'-位置具有放射性磷酸盐标记的反应物和产物。在与单核对照的切割率比较的基础上评估合作程度。对于所有金属配合物，观察到 CpA 磷酸二酯键裂解的显着选择性，与先前在相同金属配合物裂解二核糖核苷单磷酸酯中观察到的 UpU 和 UpG 选择性形成鲜明对比。最高速率加速度，由 50 μM 三核复合物 5-Cu3（水溶液，pH 7.4，50 摄氏度）在六核苷酸 9 中裂解 5'-pCpA 键时产生，根据估计的背景反应性，达到 5 x 105 倍CpA 二聚体。铜 (II) 复合物切割寡核糖核苷酸的选择性与核糖核酸酶 A 和许多不依赖金属的 RNase A 模拟物所经历的选择性非常相似。讨论了

  DOI：

  10.1021/ja0737366