5-O-methyl 1-O-(2-trimethylsilylethyl) (2R)-2-(1,3-dioxoisoindol-2-yl)pentanedioate | 214151-17-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 5-O-methyl 1-O-(2-trimethylsilylethyl) (2R)-2-(1,3-dioxoisoindol-2-yl)pentanedioate
• CAS: 214151-17-4
• 化学式: C₁₉H₂₅NO₆Si
• 分子量: 391.496
• InChiKey: RKEFRRHYAVTVDW-OAHLLOKOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.49
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  90
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-O-methyl 1-O-(2-trimethylsilylethyl) (2R)-2-(1,3-dioxoisoindol-2-yl)pentanedioate 在 二异丁基氢化铝 作用下， 以 乙醚 、 二氯甲烷 、 甲苯 为溶剂， 以48%的产率得到2-trimethylsilylethyl (2R)-2-(1,3-dioxoisoindol-2-yl)-5-oxopentanoate
  参考文献：
  名称：

  选择性非共价凝血酶抑制剂的合理设计，合成和X射线结构。

  摘要：

  我们已经设计，合成和体外测试了一类新型的非共价凝血酶抑制剂。这些抑制剂的主要特征是6,5-稠合的双环核心结构，该结构充满了凝血酶活性位点的S2口袋。自行车将构象约束引入配体中，并将​​Xaa-Pro酰胺键锁定为所需的反式构型。在已知的环系统中，我们通过分子建模选择了7-噻吩并吲哚并酮（BTD）作为我们的基本模板。分析了几个结构特征的影响：精氨酸侧链的长度，C6处的立体化学以及优化利用S3袋的重要性。最后，以2.3 A的分辨率获得了与凝血酶结合的抑制剂15的X射线晶体结构。这些设计的凝血酶抑制剂，通过高效合成制备的蛋白质显示出比胰蛋白酶和其他丝氨酸蛋白酶高的选择性。基于通过X射线晶体学获得的信息的进一步推导当然应该允许提高效力。

  DOI：

  10.1021/jm981013e
• 作为产物：
  描述：

  D-谷氨酸-5-甲酯 在 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 31.0h， 生成 5-O-methyl 1-O-(2-trimethylsilylethyl) (2R)-2-(1,3-dioxoisoindol-2-yl)pentanedioate
  参考文献：
  名称：

  选择性非共价凝血酶抑制剂的合理设计，合成和X射线结构。

  摘要：

  我们已经设计，合成和体外测试了一类新型的非共价凝血酶抑制剂。这些抑制剂的主要特征是6,5-稠合的双环核心结构，该结构充满了凝血酶活性位点的S2口袋。自行车将构象约束引入配体中，并将​​Xaa-Pro酰胺键锁定为所需的反式构型。在已知的环系统中，我们通过分子建模选择了7-噻吩并吲哚并酮（BTD）作为我们的基本模板。分析了几个结构特征的影响：精氨酸侧链的长度，C6处的立体化学以及优化利用S3袋的重要性。最后，以2.3 A的分辨率获得了与凝血酶结合的抑制剂15的X射线晶体结构。这些设计的凝血酶抑制剂，通过高效合成制备的蛋白质显示出比胰蛋白酶和其他丝氨酸蛋白酶高的选择性。基于通过X射线晶体学获得的信息的进一步推导当然应该允许提高效力。

  DOI：

  10.1021/jm981013e

文献信息

• Rational Design, Synthesis, and X-ray Structure of Selective Noncovalent Thrombin Inhibitors
  作者：Jürgen Wagner、Jörg Kallen、Claus Ehrhardt、Jean-Pierre Evenou、Dieter Wagner

  DOI：10.1021/jm981013e

  日期：1998.9.1

  We have designed, synthesized, and tested in vitro a novel class of noncovalent thrombin inhibitors. The main feature of these inhibitors is a 6,5-fused bicyclic core structure that fills the S2 pocket of the active site of thrombin. The bicycle introduces conformational constraint into the ligand and locks the Xaa-Pro amide bond into the desired trans configuration. Among the known ring systems, we

  我们已经设计，合成和体外测试了一类新型的非共价凝血酶抑制剂。这些抑制剂的主要特征是6,5-稠合的双环核心结构，该结构充满了凝血酶活性位点的S2口袋。自行车将构象约束引入配体中，并将​​Xaa-Pro酰胺键锁定为所需的反式构型。在已知的环系统中，我们通过分子建模选择了7-噻吩并吲哚并酮（BTD）作为我们的基本模板。分析了几个结构特征的影响：精氨酸侧链的长度，C6处的立体化学以及优化利用S3袋的重要性。最后，以2.3 A的分辨率获得了与凝血酶结合的抑制剂15的X射线晶体结构。这些设计的凝血酶抑制剂，通过高效合成制备的蛋白质显示出比胰蛋白酶和其他丝氨酸蛋白酶高的选择性。基于通过X射线晶体学获得的信息的进一步推导当然应该允许提高效力。