5-三氟甲基-2’-脱氧胞苷 | 66384-66-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 中文名称: 5-三氟甲基-2’-脱氧胞苷
• 中文别名: 5-三氟甲基-2'-脱氧胞苷；5-三氟甲基-2`-脱氧胞苷
• 英文名称: 5-Trifluoromethyl-2'-deoxycytidine
• 英文别名: 2'-deoxy-5-trifluoromethylcytidine；triflucytidine；5-trifluoromethyl-2'-deoxy-cytidine；5-trifluoromethyl deoxycytidine；5-Trifluormethyl-2'-deoxycytidin；4-amino-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-one
• CAS: 66384-66-5
• 化学式: C₁₀H₁₂F₃N₃O₄
• mdl: MFCD00077446
• 分子量: 295.218
• InChiKey: XNSPCSMIPDACTB-RRKCRQDMSA-N

物化性质

• 熔点：
  121°C

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.9
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

安全信息

• 危险品标志：
  Xi
• 海关编码：
  2934999090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-三氟甲基-2’-脱氧胞苷 在 吡啶 、 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 32.0h， 生成 N-acetyl-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-trifluoromethylcytidine
  参考文献：
  名称：

  包含2'-脱氧-5-三氟甲基尿苷和2'-脱氧-5-三氟甲基胞苷的寡核苷酸的三链和双链形成能力。

  摘要：

  分别由市售的2'-脱氧尿苷和2'-脱氧胞苷容易地合成了2'-脱氧-5-三氟甲基尿苷和2'-脱氧-5-三氟甲基胞苷亚磷酰胺。将获得的亚磷酰胺掺入寡核苷酸中，并通过紫外熔融实验评估它们对双链DNA（dsDNA）和单链RNA（ssRNA）的结合亲和力。包括5-三氟甲基嘧啶核碱基和dsDNA的寡核苷酸的三链体形成能力降低。尤其是，包含三氟甲基胞嘧啶（CF3C）-GC碱三重态的三链体的稳定性很低，这可能是由于吸电子三氟甲基导致质子化CF3C的pKa低所致。

  DOI：

  10.1248/cpb.c17-00530
• 作为产物：
  描述：

  5-三氟甲基尿嘧啶 在 吡啶 、 甲醇 、 三氟甲磺酸酐 、 sodium methylate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 39.5h， 生成 5-三氟甲基-2’-脱氧胞苷
  参考文献：
  名称：

  一种高纯度抗肿瘤药曲氟胞苷的制备方法

  摘要：

  本发明公开了一种高纯度抗肿瘤药曲氟胞苷的制备方法，包括步骤：1）5‑三氟甲基尿嘧啶与六甲基二硅胺在三甲基氯硅烷作用下得到2，6‑二三甲硅基‑5‑三氟甲基嘧啶；2）2，6‑二三甲硅基‑5‑三氟甲基嘧啶与3’，5’‑对氯苯甲酰基‑2’‑脱氧‑1‑氯‑D‑呋喃核糖缩合，重结晶得到3’，5’‑对氯苯甲酰基‑2’‑脱氧‑5‑三氟甲基尿苷；3）将3’，5’‑对氯苯甲酰基‑2’‑脱氧‑5‑三氟甲基尿苷与三氟甲磺酸酐反应，再由氨亲核取代得到3’，5’‑对氯苯甲酰基‑2’‑脱氧‑5‑三氟甲基胞苷；4）3’，5’‑对氯苯甲酰基‑2’‑脱氧‑5‑三氟甲基胞苷在甲醇钠的作用下脱保护，过滤洗涤得曲氟胞苷。本发明一种高纯度抗肿瘤药曲氟胞苷的制备方法，便于工业化制备。

  公开号：

  CN112979721A

文献信息

• 2,4-Pyrimidinediamine Compounds and Their Uses
  申请人：Singh Rajinder

  公开号：US20150266828A1

  公开（公告）日：2015-09-24

  The present invention provides 2,4-pyrimidinediamine compounds that inhibit the IgE and/or IgG receptor signaling cascades that lead to the release of chemical mediators, intermediates and methods of synthesizing the compounds and methods of using the compounds in a variety of contexts, including in the treatment and prevention of diseases characterized by, caused by or associated with the release of chemical mediators via degranulation and other processes effected by activation of the IgE and/or IgG receptor signaling cascades.

  本发明提供了抑制IgE和/或IgG受体信号级联反应的2,4-嘧啶二胺化合物，该级联反应导致化学介质的释放，以及合成这些化合物的中介体和方法，以及在多种情况下使用这些化合物的方法，包括在治疗和预防由脱粒和其他由IgE和/或IgG受体信号级联反应激活引起的化学介质释放所表征、引起或相关的疾病。
• Trifluoromethyl derivatives of canonical nucleosides: synthesis and bioactivity studies
  作者：Domenica Musumeci、Carlo Irace、Rita Santamaria、Daniela Montesarchio

  DOI：10.1039/c3md00159h

  日期：——

  The use of the system CF3SO2Na/tert-butyl-hydroperoxide (tert-ButOOH), recently reported for the efficient trifluoromethylation of a variety of heterocyclic aromatic compounds, has been here profitably exploited for the synthesis of 5-CF3-2′-deoxycytidine, 8-CF3-2′-deoxyadenosine, 8-CF3-2′-deoxyguanosine and 8-CF3-inosine, regioselectively obtained in good to acceptable yields following a very simple protocol. The bioactivity of these modified nucleosides, and particularly of the novel 8-CF3-2′-deoxyguanosine and 8-CF3-inosine, has been evaluated on a panel of tumour and non-tumour cell lines in preliminary in vitro cytotoxicity assays.

  最近报道的系统 SO2Na/叔丁基过氧化氢（tert-ButOOH）用于高效率三氟甲基化多种杂环芳香化合物的应用，在此已被有效利用于合成5-CF3-2′-脱氧胞苷、8- -2′-脱氧腺苷、8- -2′-脱氧鸟苷和8- -肌苷，这些产物均通过非常简单的步骤在良好至可接受的产率下区域选择性地获得。这些修饰核苷的生物活性，特别是新型8- -2′-脱氧鸟苷和8- -肌苷，已在初步体外细胞毒性测试中对一系列肿瘤及非肿瘤细胞株进行了评估。
• Studies on organic fluorine compounds. Part 35. Trifluoromethylation of pyrimidine- and purine-nucleosides with trifluoromethyl–copper complex
  作者：Yoshiro Kobayashi、Kenjiro Yamamoto、Toyohira Asai、Masanori Nakano、Itsumaro Kumadaki

  DOI：10.1039/p19800002755

  日期：——

  Halogenated nucleoside derivatives were trifluoromethylated using a solution of a trifluoromethyl–copper complex, which was prepared by shaking trifluoromethyl iodide and copper powder in hexamethylphosphoric triamide and filtering off the excess of copper powder. The following trifluoromethylated nucleosides were obtained in moderate to good yields: 5-trifluoromethyl-uridine, -deoxyuridine, -cytidine

  使用三氟甲基-铜络合物的溶液将卤代的核苷衍生物进行三氟甲基化，该溶液是通过将三氟甲基碘和铜粉在六甲基磷酸三酰胺中振摇并滤出过量的铜粉而制得的。以中等至良好的产率获得以下三氟甲基化的核苷：5-三氟甲基-尿苷，-脱氧尿苷，-胞苷，-脱氧胞苷和-阿拉伯糖基胞嘧啶；8-三氟甲基-腺苷，-脱氧腺苷和-肌苷；和6-三氟甲基核呋喃呋喃糖基嘌呤。该程序提供了许多三氟甲基化合物的简单合成方法。
• Post-synthetic modification of oligonucleotides containing 5-trifluoromethylpyrimidine bases
  作者：Yuta Ito、Misaki Matsuo、Kazuki Yamamoto、Wakana Yamashita、Takashi Osawa、Yoshiyuki Hari

  DOI：10.1016/j.tet.2018.10.006

  日期：2018.11

  containing 5-trifluoromethylpyrimidine bases is described. Trifluoromethyl group was used as a post-synthetic precursor and 5-trifluoromethylpyrimidine bases within oligonucleotides were converted into the corresponding 5-carboxy-, 5-cyano-, 5-amidinyl-, and 5-carbamoyl derivatives by treatment with an alkaline solution and amines. Moreover, post-synthetic treatment of fully protected and controlled pore

  描述了含有5-三氟甲基嘧啶碱基的寡核苷酸的实用且操作简单的合成后修饰。三氟甲基用作合成后的前体，并且寡核苷酸内的5-三氟甲基嘧啶碱基通过用碱性溶液和胺处理而被转化为相应的5-羧基-，5-氰基-，5-ami基-和5-氨基甲酰基衍生物。 。而且，在完全去除并保护有孔玻璃（CPG）的寡核苷酸的合成后处理中，成功地进行了同时去除所有保护基，从CPG上裂解，以及三氟甲基的转化以提供相应的修饰的寡核苷酸的后处理。
• Studies on antitumor agents. VI. Syntheses and antitumor activities of acyl derivatives of 2'-deoxy-5-trifluoromethyluridine.
  作者：JUN-ICHI YAMASHITA、SETSUO TAKEDA、HIROSHI MATSUMOTO、TADAFUMI TERADA、NORIO UNEMI、MITSUGI YASUMOTO

  DOI：10.1248/cpb.35.2090

  日期：——

  Various O-acyl and N-acyl derivatives of 2'-deoxy-5-trifluoromethyluridine (F3Thd) were synthesized; namely 5'-O-acyl, 3', 5'-di-O-acyl, N3-acyl, 3', 5'-di-O-acetyl-N3-acyl, 3', 5'-di-O-carbamoyl and 3', 5'-di-O-ethoxycarbonyl compounds. 5'-O-Acyl derivatives of 2'-deoxy-5-trifluoromethylcytidine were also synthesized. The antitumor activities of these compounds against sarcoma 180 were examined by oral administration to mice. Among the 5'-and 3', 5'-diester compounds with aliphatic acids, the 5'-O-hexanoyl compound showed the highest activity. Full protection of the sugar moiety with aroyl or carbamoyl groups considerably decreased the activities, and those of the 3', 5'-di-O-m-fluorobenzoyl and 3, 5'-di-O-butylcarbamoyl compounds were the smallest. N3-Benzoyl compounds were slightly more effective than F3Thd but none of them showed higher activity than the effective O-acyl compounds. In the case of 5'-O-acylates of 2'-deoxy-5-trifluoromethylcytidine, the 5'-O-benzoyl compound showed the highest activity.

  合成了2'-脱氧-5-三氟甲基尿苷(F3Thd)的各种O-酰基和N-酰基衍生物,即5'-O-酰基、3', 5'-二-O-酰基、N3-酰基、3',5'-二-O-乙酰基-N3-酰基、3', 5'-二-O-氨甲酰基和3',5'-二-O-乙氧羰基化合物。还合成了2'-脱氧-5-三氟甲基胞苷的5'-O-酰基衍生物。通过给小鼠口服给药,考察了这些化合物对肉瘤180的抗癌活性。在具有脂肪族酸的5'-和3'5'-二酯化合物中,5'-O-己酰基化合物显示出最高的活性。用芳酰基或氨甲酰基保护糖部分的完全保护大大降低了活性,而3',5'-二-O-间氟苯甲酰基和3',5'-二-O-丁基氨甲酰基化合物的活性最小。N3-苯甲酰基化合物的效力略高于F3Thd,但它们中没有任何一种显示出比有效的O-酰基化合物更高的活性。在2'-脱氧-5-三氟甲基胞苷的5'-O-酰基化合物中,5'-O-苯甲酰基化合物显示出最高的活性。