(3R)-3-<<(3'R)-3'-(benzyloxy)butanoyl>oxy>butanoic acid | 152996-90-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (3R)-3-<<(3'R)-3'-(benzyloxy)butanoyl>oxy>butanoic acid
• 英文别名: (3R)-3-[(3R)-3-(benzyloxy)butanoyloxy]butanoic acid；(3R)-3-[(3R)-3-phenylmethoxybutanoyl]oxybutanoic acid
• CAS: 152996-90-2
• 化学式: C₁₅H₂₀O₅
• 分子量: 280.321
• InChiKey: QTLRLIRHRVAWIX-VXGBXAGGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.8
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  72.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3R)-3-<<(3'R)-3'-(benzyloxy)butanoyl>oxy>butanoic acid 在 吡啶 、 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 溶剂黄146 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 58.0h， 生成 (S)-2-[(R)-3-((R)-3-{(R)-3-[(R)-3-((S)-2-Amino-4-methyl-pentanoyloxy)-butyryloxy]-butyryloxy}-butyryloxy)-butyrylamino]-6-tert-butoxycarbonylamino-hexanoic acid tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  具有对I类MHC蛋白的高结合亲和力的含寡聚（3-羟基丁酸酯）（OHB）的肽的合成

  摘要：

  在免疫系统的中心，有主要的组织相容性（MHC）蛋白/九肽复合物，可被T细胞识别。九肽由三个区域组成：一个N末端的区域包含三个氨基酸残基，在第2位具有一个精氨酸;一个C末端的区域具有9个赖氨酸或精氨酸;一个中心可变的五个残基之一（参见图1）。现在，我们已经合成的第一缀合物（1 - 4）寡肽用寡[（[R）-3- hydroxybutanoates]（OHB）作为MHC结合肽的类似物。在选择的方法中（方案1），是羟基丁酸酰氨基酯的片段偶联（17和19）用[（氨基烷酰基）氧基]丁酰氯（27；方案3），然后进行两个肽偶联步骤（方案4），被证明是最有效的。H-Gln-Arg-Leu-（HB）3,4 -Lys-OH（1和2）和H-Ala-Arg-Leu-（HB）3,4 -Lys-OH（3和4）的共轭物是由此获得纯净的形式。具有N端谷氨酰胺的共轭物1和2具有形成焦谷氨酸残基的趋势（见图2）。）。在不同温度

  DOI：

  10.1002/hlca.19980810529
• 作为产物：
  描述：

  (R)-3-(benzyloxy)butanoyl chloride 在 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 氯仿 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 (3R)-3-<<(3'R)-3'-(benzyloxy)butanoyl>oxy>butanoic acid
  参考文献：
  名称：

  溶液中(R)-3-羟基丁酸低聚物的1H NMR光谱构象分析

  摘要：

  已制备具有不同端基和链长的 (R)-3-羟基丁酸 (3-HB) 低聚物作为细菌聚 [(R)-3-羟基丁酸酯] [P(3-HB)] 的模型化合物。根据溶液中 3-HB 单元的 CH2-CH 键旋转产生的构象行为对它们进行了研究。通过分析 500-MHz 1H NMR 光谱中的邻位耦合，研究了 3-HB 低聚物在各种溶剂中的构象行为。对于本工作中研究的所有 3-HB 低聚物，在每种溶剂中都发现没有羟基的 3-HB 单元采用与溶液中 P(3-HB) 聚合物骨架相似的构象分布，其中反式和斜切构象异构体是优选的，而其他 gauche 构象异构体是强烈不受欢迎的。另一方面，3-HB 低聚物中与羟基端基相邻的 3-HB 单元相对于其他 3-HB 单元显示出不同的构象行为。在非极性有机溶剂中，只有 gauche 构象异构体占主导地位，由于形式...

  DOI：

  10.1246/bcsj.71.1683

文献信息

• Cyclische Oligomere von (<i>R</i>)-3-Hydroxybuttersäure: Herstellung und strukturelle Aspekte
  作者：Diemar A. Plattner、Andreas Brunner、Max Dobler、Hans-Martin Müller、Walter Petter、Peter Zbinden、Dieter Seebach

  DOI：10.1002/hlca.19930760518

  日期：1993.8.11

  Cyclic Oligomers of (R)-3-Hydroxybutanoic Acid: Preparation and Structural Aspects

  （R）-3-羟基丁酸的环状低聚物：制备和结构方面。
• Synthesis and Structure of Linear and Cyclic Oligomers of 3-Hydroxybutanoic Acid with Specific Sequences of (R)- and (S)-Configurations
  作者：Beat M. Bachmann、Dieter Seebach

  DOI：10.1002/(sici)1522-2675(19981216)81:12<2430::aid-hlca2430>3.0.co;2-w

  日期：1998.12.16

  To study the stereoselectivity of enzymatic cleavage of poly(3-hydroxybutyrates) (PHB) in a well-defined system (purified depolymerase and monodisperse substrate of specific relative configuration), linear and cyclic oligomers of HE (OHBs) containing (R)- and (S)-3-hydroxybutanoate residues were synthesized. The starting material (R)-HB was prepared from natural sPHB, and (S)-HB by enantioselective reduction of 3-oxobutanoate: with yeast or with H-2/Noyori-Taber catalyst (Scheme 2). The HE building blocks were then protected (O-benzyl/tert-butyl ester; Scheme 3) and coupled to give dimers 3, 4 tetramers 5-9, and octamers 10-18; for analytical comparison, a 3mer, 5mer, 6mer, and 7mer (19-22) were also prepared. Two of the tetramers were subjected to macrolactonization conditions (Yamaguchi) to give the cyclic tetramers 23 and 25 and octamers 24 and 26. All new compounds were fully characterized (m.p., [alpha](D), CD, IR, H-1- and C-13-NMR, MS, elemental analysis). Single-crystal X-ray structure analyses were performed with oligolides 24 and 25 ( Figs. 2 and 4), and the structures, as well as the crystal packing, were compared with those of analogs containing only (R)-HB units or consisting of 3-amino- instead of 3-hydroxybutanoic-acid moieties.
• Trapping of Intermediates with Substrate Analog HBOCoA in the Polymerizations Catalyzed by Class III Polyhydroxybutyrate (PHB) Synthase from <i>Allochromatium Vinosum</i>
  作者：Chao Chen、Ruikai Cao、Ruben Shrestha、Christina Ward、Benjamin B. Katz、Christopher J. Fischer、John M. Tomich、Ping Li

  DOI：10.1021/cb5009958

  日期：2015.5.15

  Polyhydroxybutyrate (PHB) synthases (PhaCs) catalyze the formation of biodegradable PHB polymers that are considered as an ideal alternative to petroleum-based plastics. To provide strong evidence for the preferred mechanistic model involving covalent and noncovalent intermediates, a substrate analog HBOCoA was synthesized chemoenzymatically. Substitution of sulfur in the native substrate HBCoA with an oxygen in HBOCoA enabled detection of (HB)nOCoA (n = 2-6) intermediates when the polymerization was catalyzed by wild-type (wt-)PhaEC(Av) at 5.84 h(-1). This extremely slow rate is due to thermodynamically unfavorable steps that involve the formation of enzyme-bound PHB species (thioesters) from corresponding CoA oxoesters. Synthesized standards (HB)(n)OCoA (n = 2-3) were found to undergo both reacylation and hydrolysis catalyzed by the synthase. Distribution of the hydrolysis products highlights the importance of the penultimate ester group as previously suggested. Importantly, the reaction between primed synthase [H-3]-sT-PhaEC(Av) and HBOCoA yielded [H-3]-sTet-O-CoA at a rate constant faster than 17.4 s(-1), which represents the first example that a substrate analog undergoes PHB chain elongation at a rate close to that of the native substrate (65.0 s(-1)). Therefore, for the first time with a wt-synthase, strong evidence was obtained to support our favored PHB chain elongation model.
• Synthesis of Oligo(3-hydroxybutanoate)(OHB)-Containing Peptides with High Binding Affinity to a Class-I-MHC Protein
  作者：Dieter Seebach、Sorana Poenaru、Gerd Folkers、Didier Rognan

  DOI：10.1002/hlca.19980810529

  日期：——

  have now synthesized the first conjugates (1–4) of oligopeptides with oligo[(R)-3-hydroxybutanoates] (OHB) as analogs of MHC-binding peptides. Of the approaches chosen (Scheme 1), a fragment coupling of a hydroxy-butanoyl-amido ester (17 and 19) with an [(aminoalkanoyl)oxy]butanoyl chloride (27; Scheme 3), followed by two peptide-coupling steps (Scheme 4), turned out to be most efficient. The conjugates

  在免疫系统的中心，有主要的组织相容性（MHC）蛋白/九肽复合物，可被T细胞识别。九肽由三个区域组成：一个N末端的区域包含三个氨基酸残基，在第2位具有一个精氨酸;一个C末端的区域具有9个赖氨酸或精氨酸;一个中心可变的五个残基之一（参见图1）。现在，我们已经合成的第一缀合物（1 - 4）寡肽用寡[（[R）-3- hydroxybutanoates]（OHB）作为MHC结合肽的类似物。在选择的方法中（方案1），是羟基丁酸酰氨基酯的片段偶联（17和19）用[（氨基烷酰基）氧基]丁酰氯（27；方案3），然后进行两个肽偶联步骤（方案4），被证明是最有效的。H-Gln-Arg-Leu-（HB）3,4 -Lys-OH（1和2）和H-Ala-Arg-Leu-（HB）3,4 -Lys-OH（3和4）的共轭物是由此获得纯净的形式。具有N端谷氨酰胺的共轭物1和2具有形成焦谷氨酸残基的趋势（见图2）。）。在不同温度
• Conformational Analysis of Oligomers of (<i>R</i>)-3-Hydroxybutanoic Acid in Solutions by¹H NMR Spectroscopy
  作者：Jun Li、Jun Uzawa、Yoshiharu Doi

  DOI：10.1246/bcsj.71.1683

  日期：1998.7

  (R)-3-hydroxybutanoic acid (3-HB) with different end groups and chain lengths have been prepared as model compounds of bacterial poly[(R)-3-hydroxybutanoate] [P(3-HB)]. They were studied in terms of their conformational behavior generated by rotation about CH2–CH bond of 3-HB units in solutions. The conformational behaviors of 3-HB oligomers were investigated in various solvents by analysis of vicinal coupling

  已制备具有不同端基和链长的 (R)-3-羟基丁酸 (3-HB) 低聚物作为细菌聚 [(R)-3-羟基丁酸酯] [P(3-HB)] 的模型化合物。根据溶液中 3-HB 单元的 CH2-CH 键旋转产生的构象行为对它们进行了研究。通过分析 500-MHz 1H NMR 光谱中的邻位耦合，研究了 3-HB 低聚物在各种溶剂中的构象行为。对于本工作中研究的所有 3-HB 低聚物，在每种溶剂中都发现没有羟基的 3-HB 单元采用与溶液中 P(3-HB) 聚合物骨架相似的构象分布，其中反式和斜切构象异构体是优选的，而其他 gauche 构象异构体是强烈不受欢迎的。另一方面，3-HB 低聚物中与羟基端基相邻的 3-HB 单元相对于其他 3-HB 单元显示出不同的构象行为。在非极性有机溶剂中，只有 gauche 构象异构体占主导地位，由于形式...