(4Z)-9-(5-carboxypentyl)-2,3,7,8-tetramethyl-(10H)-dipyrrin-1-one | 303732-40-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: (4Z)-9-(5-carboxypentyl)-2,3,7,8-tetramethyl-(10H)-dipyrrin-1-one
• 英文别名: semirubin；[6]-semirubin；6-[5-[(Z)-(3,4-dimethyl-5-oxopyrrol-2-ylidene)methyl]-3,4-dimethyl-1H-pyrrol-2-yl]hexanoic acid
• CAS: 303732-40-3
• 化学式: C₁₉H₂₆N₂O₃
• 分子量: 330.427
• InChiKey: YNALTUMDRNIELD-YVLHZVERSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.7
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  82.2
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  甲醇 、 (4Z)-9-(5-carboxypentyl)-2,3,7,8-tetramethyl-(10H)-dipyrrin-1-one 在 硫酸 作用下， 反应 1.0h， 以92%的产率得到(4Z)-9-(5-carbomethoxypentyl)-2,3,7,8-tetramethyl-(10H)-dipyrrin-1-one
  参考文献：
  名称：

  Semirubin。新型双吡啶酮被分子内氢键束缚。

  摘要：

  （4Z）-9-（5-羧基戊基）-2,3,7,8-四甲基-（10H）-联吡啶-1-酮（1，半红蛋白），一种新的双嘧啶酮模型，用于胆红素的一半，黄色在用己二酸半酯酰氯将2,3,7,8-四甲基-（10H）-二吡喃-1-酮（5）进行Friedel-Crafts酰化后，合成了黄疸的橙色神经毒性颜料。不像其他胆红素的二吡啶环酮模型，例如仅参与分子间氢键结合的黄嘌呤黄酸，1在设计和发现参与羧酸与二吡啶酮内酰胺和吡咯之间的分子内氢键化方面是独特的。1和胆红素共有的这一重要的构象决定结构特征，使其极性不如其甲酯，并使其在非极性溶剂（其酯为二聚体）中保持单体状态。相应的10-氧代类似物（3）为1，可作为10-氧代胆红素的模型，这是在胆红素排泄的其他途径中推测的胆红素代谢产物。发现像1、3参与分子内氢键。与1的甲酯不同，3的乙酯在非极性溶剂中不是分子间氢键合的。

  DOI：

  10.1021/jo000393k
• 作为产物：
  描述：

  (4Z)-9-(5-carbethoxypentanoyl)-2,3,7,8-tetramethyl-(10H)-dipyrrin-1-one 在 sodium tetrahydroborate 作用下， 以 异丙醇 为溶剂， 反应 2.0h， 以88%的产率得到(4Z)-9-(5-carboxypentyl)-2,3,7,8-tetramethyl-(10H)-dipyrrin-1-one
  参考文献：
  名称：

  Semirubin。新型双吡啶酮被分子内氢键束缚。

  摘要：

  （4Z）-9-（5-羧基戊基）-2,3,7,8-四甲基-（10H）-联吡啶-1-酮（1，半红蛋白），一种新的双嘧啶酮模型，用于胆红素的一半，黄色在用己二酸半酯酰氯将2,3,7,8-四甲基-（10H）-二吡喃-1-酮（5）进行Friedel-Crafts酰化后，合成了黄疸的橙色神经毒性颜料。不像其他胆红素的二吡啶环酮模型，例如仅参与分子间氢键结合的黄嘌呤黄酸，1在设计和发现参与羧酸与二吡啶酮内酰胺和吡咯之间的分子内氢键化方面是独特的。1和胆红素共有的这一重要的构象决定结构特征，使其极性不如其甲酯，并使其在非极性溶剂（其酯为二聚体）中保持单体状态。相应的10-氧代类似物（3）为1，可作为10-氧代胆红素的模型，这是在胆红素排泄的其他途径中推测的胆红素代谢产物。发现像1、3参与分子内氢键。与1的甲酯不同，3的乙酯在非极性溶剂中不是分子间氢键合的。

  DOI：

  10.1021/jo000393k

文献信息

• Carboxylic acid to thioamide hydrogen bonding
  作者：Suchitra Datta、David A. Lightner

  DOI：10.1016/j.tet.2008.09.082

  日期：2009.1

  the dipyrrinone, as in the hexanoic acid of [6]-semirubin, tight intramolecular hydrogen bonding between the carboxylic acid group and the lactam moiety (intramolecular Kassoc ≫25,000) is found in CHCl3 with no evidence of dimers. In contrast, the analogous dipyrrinthione, [6]-thiosemirubin, eschews intramolecular hydrogen bonds, as determined using NMR spectroscopy and vapor pressure osmometry, preferring

  双吡咯酮的内酰胺基团积极参与酰胺-酰胺氢键，在非极性溶剂（在 CHCl 3 中，K D ∼25,000 M -1在 22 °C 中）形成二聚体缔合复合物。相应的硫代酰胺（dipyrrinthones），由 dipyrrinones 通过与 Lawesson's 试剂反应制备，也在非极性溶剂中形成分子间氢键二聚体，尽管缔合常数要弱得多（在 CHCl 3 中，K D ∼200 M -1 at 22 ° C）。当羧酸基团连接到双吡喃酮的 C(9) 时，如在 [6]-半红素的己酸中，羧酸基团和内酰胺部分之​​间的紧密分子内氢键（分子内K assoc ≫25,000) 存在于 CHCl 3 中，没有二聚体的证据。相比之下，类似的双吡喃硫酮，[6]-硫代蜜红素，避开了分子内氢键，如使用 NMR 光谱和蒸汽压渗透法测定的那样，更喜欢形成硫代酰胺 - 硫代酰胺类型的分子间氢键二聚体。