1-amino-N-(2-(2-((6-chlorohexyl)oxy)ethoxy)ethyl)-3,6,9,12-tetraoxapentadecan-15-amide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 1-amino-N-(2-(2-((6-chlorohexyl)oxy)ethoxy)ethyl)-3,6,9,12-tetraoxapentadecan-15-amide
• 英文别名: 3-[2-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]-N-[2-[2-(6-chlorohexoxy)ethoxy]ethyl]propanamide
• 化学式: C₂₁H₄₃ClN₂O₇
• 分子量: 471.035
• InChiKey: BSOUQGKMWSYHLL-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.3
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  26
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.95
• 拓扑面积：
  111
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-amino-N-(2-(2-((6-chlorohexyl)oxy)ethoxy)ethyl)-3,6,9,12-tetraoxapentadecan-15-amide 、 4-(3,7-bis(dimethylamino)-5,5-diisopropyldibenzo[b,e]silin-10(5H)-ylidene)butanoic acid 在 O-(N-succinimidyl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 0.5h， 以0.48 mg的产率得到1-(4-(3,7-bis(dimethylamino)-5,5-diisopropyldibenzo[b,e]silin-10(5H)-ylidene)butanamido)-N-(2-(2-((6-chlorohexyl)oxy)ethoxy)ethyl)-3,6,9,12-tetraoxapentadecan-15-amide
  参考文献：
  名称：

  [EN] NOVEL TUNABLE PHOTOACTIVATABLE SILICON RHODAMINE FLUOROPHORES
  [FR] NOUVEAUX FLUOROPHORES RHODAMINES AU SILICIUM PHOTOACTIVABLES ACCORDABLES

  摘要：

  这项发明涉及一种具有通式（100）特征的化合物，其中R1和R6为H或F，R2、R3、R4和R5可以是任何取代基，R7、R8、RN1、RN2、RN3和RN4为一个碳氢基团，R9和R10中的一个是氢，另一个是氢或与任何取代基连接的饱和碳原子，并且其在染色和活细胞荧光成像中的用途。

  公开号：

  WO2019122269A1
• 作为产物：
  描述：

  2-(2-((6-chlorohexyl)oxy)ethoxy)ethan-1-amine 在 哌啶 、 O-(N-succinimidyl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二甲基亚砜 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.75h， 生成 1-amino-N-(2-(2-((6-chlorohexyl)oxy)ethoxy)ethyl)-3,6,9,12-tetraoxapentadecan-15-amide
  参考文献：
  名称：

  [EN] NOVEL TUNABLE PHOTOACTIVATABLE SILICON RHODAMINE FLUOROPHORES
  [FR] NOUVEAUX FLUOROPHORES RHODAMINES AU SILICIUM PHOTOACTIVABLES ACCORDABLES

  摘要：

  这项发明涉及一种具有通式（100）特征的化合物，其中R1和R6为H或F，R2、R3、R4和R5可以是任何取代基，R7、R8、RN1、RN2、RN3和RN4为一个碳氢基团，R9和R10中的一个是氢，另一个是氢或与任何取代基连接的饱和碳原子，并且其在染色和活细胞荧光成像中的用途。

  公开号：

  WO2019122269A1

文献信息

• SUBSTRATES FOR COVALENT TETHERING OF PROTEINS TO FUNCTIONAL GROUPS OR SOLID SURFACES
  申请人：PROMEGA CORPORATION

  公开号：US20140322794A1

  公开（公告）日：2014-10-30

  The present invention provides haloalkane substrates, and linkers for connecting such substrates to functional elements (e.g., tags, labels, surfaces, etc.). Substrates and linkers described herein find use, for example, in labeling, detection, and immobilization of proteins, cells, and molecules. In particular, the linkers provided herein find use within substrates for dehalogenase variants that form covalent bonds with their haloalkane substrates.

  本发明提供了卤代烷基底物和连接这种底物与功能元件（例如标签、标记、表面等）的连接物。本文所描述的底物和连接物可用于蛋白质、细胞和分子的标记、检测和固定等方面。特别是，本发明提供的连接物可用于卤代烷酶变体的底物中，这些变体与其卤代烷基底物形成共价键。
• Selective Functionalisation of 5‐Methylcytosine by Organic Photoredox Catalysis
  作者：Mathew M. Simpson、Ching Ching Lam、Jonathan M. Goodman、Shankar Balasubramanian

  DOI：10.1002/anie.202304756

  日期：2023.6.26

  Selective functionalisation of the C(sp3)−H bond in the methyl group of 5-methylcytosine is achieved by xanthone-catalysed photoredox catalysis. The specific nature of the functionalisation of 5-methylcytosine on ribonucleic acid (RNA) was used to install a Halo-Tag reactive handle which enabled the chemical enrichment of 5-methylcytosine containing RNA.

  5-甲基胞嘧啶的甲基中的 C(sp 3 )−H 键的选择性官能化是通过氧杂蒽酮催化的光氧化还原催化实现的。利用核糖核酸 (RNA) 上 5-甲基胞嘧啶功能化的特殊性质来安装 Halo-Tag 反应手柄，从而能够对含有 RNA 的 5-甲基胞嘧啶进行化学富集。
• Substrates for covalent tethering of proteins to functional groups or solid surfaces
  申请人：PROMEGA CORPORATION

  公开号：US11072812B2

  公开（公告）日：2021-07-27

  The present invention provides haloalkane substrates, and linkers for connecting such substrates to functional elements (e.g., tags, labels, surfaces, etc.). Substrates and linkers described herein find use, for example, in labeling, detection, and immobilization of proteins, cells, and molecules. In particular, the linkers provided herein find use within substrates for dehalogenase variants that form covalent bonds with their haloalkane substrates.

  本发明提供了卤代烃基底以及用于将此类基底与功能元件（如标签、标记、表面等）连接的连接体。本文所述的底物和连接体可用于蛋白质、细胞和分子的标记、检测和固定等。特别是，本文提供的连接体可用于与卤代烃底物形成共价键的脱卤酶变体的底物中。
• [EN] SUBSTRATES FOR COVALENT TETHERING OF PROTEINS TO FUNCTIONAL GROUPS OR SOLID SURFACES<br/>[FR] SUBSTRATS POUR LA FIXATION COVALENTE DE PROTÉINES À DES GROUPES FONCTIONNELS OU DES SURFACES SOLIDES
  申请人：PROMEGA CORP

  公开号：WO2014151282A1

  公开（公告）日：2014-09-25

  The present invention provides haloalkane substrates, and linkers for connecting such substrates to functional elements (e.g., tags, labels, surfaces, etc.). Substrates and linkers described herein find use, for example, in labeling, detection, and immobilization of proteins, cells, and molecules. In particular, the linkers provided herein find use within substrates for dehalogenase variants that form covalent bonds with their haloalkane substrates.
• [EN] NOVEL TUNABLE PHOTOACTIVATABLE SILICON RHODAMINE FLUOROPHORES<br/>[FR] NOUVEAUX FLUOROPHORES RHODAMINES AU SILICIUM PHOTOACTIVABLES ACCORDABLES
  申请人：SPIROCHROME AG

  公开号：WO2019122269A1

  公开（公告）日：2019-06-27

  The invention relates to a compound characterized by general formula (100), wherein R1 and R6 are H or F, R2, R3, R4 and R5 can be any substituent, R7, R8, RN1, RN2, RN3 and RN4 are a hydrocarbon moiety, one of R9 and R10 is hydrogen and the other one is hydrogen or a saturated carbon atom connected to any substituent, and its use in staining and live cell fluorescence imaging.

  这项发明涉及一种具有通式（100）特征的化合物，其中R1和R6为H或F，R2、R3、R4和R5可以是任何取代基，R7、R8、RN1、RN2、RN3和RN4为一个碳氢基团，R9和R10中的一个是氢，另一个是氢或与任何取代基连接的饱和碳原子，并且其在染色和活细胞荧光成像中的用途。