cobalt(II)-factor III(8-)

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 四吡咯及其衍生物
• 英文名称: cobalt(II)-factor III(8-)
• 英文别名: cobalt(2+);3-[(2S,3S,7S,8S)-7,13,17-tris(2-carboxylatoethyl)-3,8,12,18-tetrakis(carboxylatomethyl)-3,8,10-trimethyl-2,7-dihydroporphyrin-23,24-diid-2-yl]propanoate
• 化学式: C43H38CoN4O16-8
• 分子量: 925.7
• InChiKey: RQHZZQLPDALGEQ-CYGMIEPJSA-D

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6.42
• 重原子数：
  64
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  348
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  20

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  cobalt(II)-factor III(8-) 、 氢(+1)阳离子 、 S-腺苷蛋氨酸 生成 cobalt(II)-factor IV(6-) 、 S-(5'-腺苷)-L-高半胱氨酸
  参考文献：
  名称：

  由维生素B12厌氧途径的酶合成的新型钴类皮质激素的结构表征。

  摘要：

  关于使用三甲基化中间体（前corrin 3（2））的氧化形式（因子3（3a））作为维生素B12厌氧途径酶的底物的研究，导致了三对新型钴类corrinoids的合成。产物是用鼠伤寒沙门氏菌酶CbiH，CbiF，CbiG和CbiT制成的，以几种13C标记的形式合成，并在酯化后分离为甲酯。通过详细的NMR和MS分析确定结构。每组产品均以脱羧（RMe）和非脱羧（R = CH2COOCH3）形式（在卟啉类的C-12位）获得。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2005.08.062

文献信息

• Characterization of the Enzyme CbiH60 Involved in Anaerobic Ring Contraction of the Cobalamin (Vitamin B12) Biosynthetic Pathway
  作者：Simon J. Moore、Rebekka Biedendieck、Andrew D. Lawrence、Evelyne Deery、Mark J. Howard、Stephen E.J. Rigby、Martin J. Warren

  DOI：10.1074/jbc.m112.422535

  日期：2013.1

  and the low activity of enzymes. One of the major bottlenecks in the anaerobic pathway is the ring contraction step, which has not been observed previously with a purified enzyme system. The Gram-positive aerobic bacterium Bacillus megaterium has a complete anaerobic pathway that contains an unusual ring contraction enzyme, CbiH(60), that harbors a C-terminal extension with sequence similarity to the

  由于途径中间体对氧的敏感性和酶的低活性，钴胺素（维生素 B(12)）生物合成的厌氧途径的特征仍然很少。厌氧途径的主要瓶颈之一是环收缩步骤，以前在纯化的酶系统中未观察到这一步骤。革兰氏阳性需氧细菌巨大芽孢杆菌具有完整的厌氧途径，其中包含一种不寻常的环收缩酶 CbiH(60)，该酶具有与亚硝酸盐/亚硫酸盐还原酶家族序列相似的 C 末端延伸。为了提高溶解度，该酶在宿主巨大芽孢杆菌 DSM319 中同源产生。 CbiH(60) 通过电子顺磁共振表征并显示含有[4Fe-4S]中心。使用纯化的重组 CbiH(60) 进行的分析表明，该酶可以高产率将钴-precorrin-3 和钴因子 III 转化为环收缩产物钴-precorrin-4，后者的转化依赖于 DTT 和完整的 Fe- S中心。此外，环收缩过程被证明不涉及大环中心钴离子氧化态的变化。