2-Oxodeca-3,5,7-trienoic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 酮酸及其衍生物
• 英文名称: 2-Oxodeca-3,5,7-trienoic acid
• 英文别名: 2-oxodeca-3,5,7-trienoic acid
• 化学式: C₁₀H₁₂O₃
• 分子量: 180.203
• InChiKey: BTDAZBZYKNUSIE-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.2
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  54.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  反式,反式-2,4-庚二烯醛 、 sodium pyruvate 在 pyruvate aldolase-dehydratase ⁽⁰⁰⁵⁾Sbi₁₅ 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 生成 2-Oxodeca-3,5,7-trienoic acid
  参考文献：
  名称：

  Sbi00515，冰城链霉菌功能未知的蛋白质，突出了乙酰乙酸脱羧酶支架的功能多功能性

  摘要：

  乙酰乙酸脱羧酶样超家族（ADCSF）是一组约4000种酶，直到最近，就催化反应而言，它们仍被认为是同质的。生物信息学分析表明，ADCSF由多达七个家族组成，这些家族的主要区别在于其活动站点架构。居住在土壤中的细菌炳城链霉菌BCW-1产生一种功能未知的ADCSF酶，与已知的乙酰乙酸脱羧酶（ADC）共有较低的序列同一性（〜20％）。该酶Sbi00515属于ADCSF的MppR样家族，因为它与来自吸水链霉菌的甘露肽霉素生物合成蛋白MppR相似。。本文中，我们提供的稳态动力学数据表明Sbi00515不会催化任何测试的α-或β-酮酸的脱羧反应。而是，我们表明Sbi00515催化丙酮酸与许多醛的缩合，然后使假定的羟醛中间体脱水。因此，Sbi00515是丙酮酸醛缩酶脱水酶，而不是乙酰乙酸酯脱羧酶。我们还确定了Sbi00515与甲酸和丙酮酸的配合物的X射线晶体结构。结构表明，Sbi00515的总体折叠几乎

  DOI：

  10.1021/acs.biochem.5b00483