6-(氯甲基)-2-甲基嘧啶-4-醇 | 35252-96-1

• 物质功能分类: 医药中间体 - 杂环化合物 - 嘧啶类化合物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 中文名称: 6-(氯甲基)-2-甲基嘧啶-4-醇
• 英文名称: 6-(chloromethyl)-2-methylpyrimidin-4-ol
• 英文别名: 4-chloromethyl-2-methyl-6-hydroxy-pyrimidine；6-(Chloromethyl)-2-methylpyrimidin-4-ol；4-(chloromethyl)-2-methyl-1H-pyrimidin-6-one
• CAS: 35252-96-1
• 化学式: C₆H₇ClN₂O
• mdl: MFCD00129130
• 分子量: 158.587
• InChiKey: BMLCQHXPAJVVJH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.3
• 重原子数：
  10
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  41.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  2

安全信息

• 危险等级：
  IRRITANT
• 海关编码：
  2933599090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-(氯甲基)-2-甲基嘧啶-4-醇 在 N,N-二异丙基乙胺 、 potassium iodide 、 三氯氧磷 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 N-((6-chloro-2-methylpyrimidin-4-yl)methyl)-N-ethyl-5,6,7,8-tetrahydroquinolin-8-amine
  参考文献：
  名称：

  Structural optimization of aminopyrimidine-based CXCR4 antagonists

  摘要：

  Structural optimization of aminopyrimidine-based CXCR4 antagonists is reported. The optimization is guided by molecular docking studies based on available CXCR4-small molecule crystal complex. The optimization identifies a number of compounds with improved receptor binding affinity and functional activity exemplified by compound 23 (inhibition of APC-conjugate clone 12G5 for CXCR4 binding in a cell based assay: IC50 = 8.8 nM; inhibition of CXCL12 induced cytosolic calcium increase: IC50 = 0.02 nM). In addition, compound 23 potently inhibits CXCR4/CXLC12 mediated chemotaxis in a matrigel invasion assay. Furthermore, compound 23 exhibits good physicochemical properties (MW 367, clogP 2.1, PSA 48, pKa 7.2) and in vitro safety profiles (marginal/moderate inhibition of CYP isozymes and hERG). These results represent significant improvement over the initial hit from scaffold hybridization and suggest that compound 23 can be used as a starting point to support lead optimization. (C) 2019 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2019.111914
• 作为产物：
  描述：

  4-氯乙酰乙酸乙酯 、 盐酸乙脒 在 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 12.0h， 以37%的产率得到6-(氯甲基)-2-甲基嘧啶-4-醇
  参考文献：
  名称：

  基于氨基喹啉模板的新型CXCR4拮抗剂的设计，合成和评估。

  摘要：

  由于趋化因子受体CXCR4参与了诸如HIV感染和癌症转移等病理状况，因此已被研究为药物靶标。在这里，我们报告基于氨基喹啉模板的新型CXCR4拮抗剂的构效关系研究。该模板在经典的四氢喹啉（THQ）环部分中没有手性中心，因此可以轻松合成。鉴定了许多有效的CXCR4拮抗剂，以化合物3为例，它们表现出与CXCR4受体的优异结合亲和力（IC50 = 57 nM），并抑制了CXCL12诱导的胞质钙增加（IC50 = 0.24 nM）。此外，化合物3在transwell入侵试验中有效抑制了CXLC12 / CXCR4介导的细胞迁移。简化的合成方法结合良好的理化性质（例如

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2020.103824

文献信息

• [EN] HETEROARYL COMPOUNDS AS CXCR4 INHIBITORS, COMPOSITION AND METHOD USING THE SAME<br/>[FR] COMPOSÉS HÉTÉROARYLÉS UTILISÉS COMME INHIBITEURS DE CXCR4, COMPOSITION ET PROCÉDÉ D'UTILISATION DE CEUX-CI
  申请人：SUZHOU YUNXUAN YIYAO KEJI YOUXIAN GONGSI

  公开号：WO2019060860A1

  公开（公告）日：2019-03-28

  The present disclosure provides heteroaryl compounds of Formula (I), processes for their preparation, pharmaceutical compositions containing them, and their use in the treatment of diseases and disorders, arising from or related to the CXCR4 pathway.

  本公开提供了Formula (I)的杂环芳基化合物，其制备方法，含有它们的药物组合物，以及它们在治疗源自或与CXCR4途径相关的疾病和障碍中的应用。
• Probing riboswitch–ligand interactions using thiamine pyrophosphate analogues
  作者：Liuhong Chen、Elena Cressina、Neil Dixon、Karl Erixon、Kwasi Agyei-Owusu、Jason Micklefield、Alison G. Smith、Chris Abell、Finian J. Leeper

  DOI：10.1039/c2ob07116a

  日期：——

  The Escherichia coli thiM riboswitch forms specific contacts with its natural ligand, thiamine pyrophosphate (TPP or thiamine diphosphate), allowing it to generate not only nanomolar binding affinity, but also a high degree of discrimination against similar small molecules. A range of synthetic TPP analogues have been used to probe each of the riboswitch–ligand interactions. The results show that the pyrimidine-sensing helix of thiM is exquisitely tuned to select for TPP by recognising the H-bonding donor and acceptors around its aminopyrimidine ring and also by forming π-stacking interactions that may be sensitive to the electronics of the ring. The central thiazolium ring of TPP appears to be more important for ligand recognition than previously thought. It may contribute to binding via long-range electrostatic interactions and/or by exerting an electron withdrawing effect on the pyrimidine ring, allowing its presence to be sensed indirectly and thereby allowing discrimination between thiamine (and its phosphate esters) and other aminopyrimidines found in vivo. The pyrophosphate moiety is essential for submicromolar binding affinity, but unexpectedly, it does not appear to be strictly necessary for modulation of gene expression.

  大肠杆菌中的thiM核糖开关能够与其天然配体硫胺素焦磷酸（TPP或硫胺素二磷酸）形成特异性接触，不仅能够产生纳摩尔级的结合亲和力，还能对类似的小分子展现出高度选择性。一系列合成的TPP类似物被用来探究核糖开关与配体之间的相互作用。结果显示，thiM的嘧啶感知螺旋经过精妙调整，通过识别其氨基嘧啶环周围的氢键供体和受体，以及可能对环电子性质敏感的π堆积相互作用，来选择TPP。TPP的中心噻唑环在配体识别中的重要性似乎比之前认为的更高。它可能通过长程静电相互作用和/或通过对嘧啶环施加电子 withdrawing 效应来促进结合，使得其存在能够被间接感知，从而在体内区分硫胺素（及其磷酸酯）与其他氨基嘧啶。焦磷酸部分对于亚微摩尔级的结合亲和力至关重要，但出乎意料的是，它似乎并不严格需要调控基因表达。
• Heterocyclic Analogues of Modafinil as Novel, Atypical Dopamine Transporter Inhibitors
  作者：Predrag Kalaba、Nilima Y. Aher、Marija Ilić、Vladimir Dragačević、Marcus Wieder、Andras G. Miklosi、Martin Zehl、Judith Wackerlig、Alexander Roller、Tetyana Beryozkina、Bojana Radoman、Sivaprakasam R. Saroja、Wolfgang Lindner、Eduardo Perez Gonzalez、Vasiliy Bakulev、Johann Jakob Leban、Harald H. Sitte、Ernst Urban、Thierry Langer、Gert Lubec

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.7b01313

  日期：2017.11.22

  versus serotonin and norepinephrine transporters than modafinil. This was achieved by substituting the amide moiety by five- and six-membered aromatic heterocycles. In vitro studies indicated binding to the cocaine pocket on DAT, although molecular dynamics revealed binding different from that of cocaine. Moreover, no release of dopamine was observed, ruling out amphetamine-like effects. The absence of

  莫达非尼是一种促进唤醒的化合物，具有增强认知的潜力。它以适度的选择性靶向多巴胺转运蛋白（DAT），从而导致再摄取抑制和突触裂隙中多巴胺水平升高。到目前为止，已经报道了一系列莫达非尼类似物，但是还有更多的靶标类似物仍有待发现。这项研究的目的是合成和表征此类类似物，事实上，与5-羟色胺和去甲肾上腺素转运蛋白相比，与莫达非尼相比，一系列化合物对DAT的活性更高，对DAT的选择性更高。这是通过用五元和六元芳族杂环取代酰胺部分来实现的。体外研究表明与DAT上的可卡因口袋结合，尽管分子动力学显示结合与可卡因不同。此外，未观察到多巴胺释放，排除了苯丙胺样作用。代表性类似物没有神经毒性可能会鼓励对上述化合物进行进一步的临床前研究。
• Pyrimidylmethyl thiophosphorus esters useful for the control of insects,
  申请人：Hoffmann-La Roche Inc.

  公开号：US04584295A1

  公开（公告）日：1986-04-22

  Heterocyclic compounds of the formula ##STR1## wherein R.sup.1, R.sup.2, R.sup.3, R.sup.4, R.sup.5 and X are as defined hereinafter, process for their preparation, as well as pesticidal compositions containing these compounds as the active ingredient and methods for using the pesticidal compositions for the control of pests are described.

  公式为##STR1##的杂环化合物，其中R.sup.1、R.sup.2、R.sup.3、R.sup.4、R.sup.5和X的定义如下，以及它们的制备方法，以及含有这些化合物作为活性成分的杀虫剂组合物，以及使用这些杀虫剂组合物用于控制害虫的方法。
• Combating pests with 4-substituted-pyrimidin-6-yl (thiono)-phosphoric
  申请人：Bayer Aktiengesellschaft

  公开号：US04168304A1

  公开（公告）日：1979-09-18

  4-Substituted-pyrimidin-6-yl (thiono)-phosphoric (phosphonic) acid esters or ester-amides of the formula ##STR1## in which R represents hydrogen, alkyl, alkoxy, alkylthio or alkylamino, R.sup.1 represents halogen, alkoxy, alkylthio or alkylamino, R.sup.2 represents alkyl, alkoxy, alkylamino or phenyl, R.sup.3 represents alkyl and X and Y, which may be identical or different, represent oxygen or sulphur, Which possess arthropodicidal and nematicidal properties.

  该化合物的中文翻译如下：具有节肢动物杀虫和线虫杀虫性质的4-取代嘧啶-6-基(thiono)-磷酸(磷酸)酯或酯酰胺的式子如下：##STR1##其中，R代表氢、烷基、烷氧基、烷硫基或烷基氨基，R.sup.1代表卤素、烷氧基、烷硫基或烷基氨基，R.sup.2代表烷基、烷氧基、烷基氨基或苯基，R.sup.3代表烷基，X和Y可以相同也可以不同，代表氧或硫。