(±)-5-{3-[2-cyclohexyl-4-(propan-2-yloxy)-1H-benzimidazol-1-yl]prop-1-yn-1-yl}-1-(tetrahydrothien-2-yl)cytosine | 1452819-00-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: (±)-5-{3-[2-cyclohexyl-4-(propan-2-yloxy)-1H-benzimidazol-1-yl]prop-1-yn-1-yl}-1-(tetrahydrothien-2-yl)cytosine
• 英文别名: 4-Amino-5-[3-(2-cyclohexyl-4-propan-2-yloxybenzimidazol-1-yl)prop-1-ynyl]-1-(thiolan-2-yl)pyrimidin-2-one；4-amino-5-[3-(2-cyclohexyl-4-propan-2-yloxybenzimidazol-1-yl)prop-1-ynyl]-1-(thiolan-2-yl)pyrimidin-2-one
• CAS: 1452819-00-9
• 化学式: C₂₇H₃₃N₅O₂S
• 分子量: 491.657
• InChiKey: JZTSGWFRGMCISB-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  111
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-氨基-3-硝基苯酚 在 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 copper(l) iodide 、 sodium dithionite 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 sodium hydride 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 、 mineral oil 为溶剂， 反应 32.0h， 生成 (±)-5-{3-[2-cyclohexyl-4-(propan-2-yloxy)-1H-benzimidazol-1-yl]prop-1-yn-1-yl}-1-(tetrahydrothien-2-yl)cytosine
  参考文献：
  名称：

  基于咪唑和苯并咪唑的激酶 IspE 抑制剂：靶向底物结合位点和 ATP 位点的三磷酸结合环

  摘要：

  生成类异戊二烯的不依赖甲羟戊酸的生物合成途径中的酶是开发新候选药物的有吸引力的目标，特别是针对疟疾和结核病，因为它们存在于主要的人类病原体中，但不存在于人类中。在此，描述了一系列抑制剂的基于结构的设计、合成和生物学评估，这些抑制剂具有来自大肠杆菌的激酶 IspE 的中心咪唑或苯并咪唑支架，是相应的疟疾酶模型。在底物结合位点处疏水性子袋的结合偏好的优化允许达到较低微摩尔范围内的 IC50 值。使用 1,2-二取代咪唑中心核的构效关系研究表明，脂环部分比子口袋更适合

  DOI：

  10.1002/ejoc.201201467

文献信息

• Imidazole- and Benzimidazole-Based Inhibitors of the Kinase IspE: Targeting the Substrate-Binding Site and the Triphosphate-Binding Loop of the ATP Site
  作者：Paolo Mombelli、Camille Le Chapelain、Noah Munzinger、Evelyne Joliat、Boris Illarionov、W. Bernd Schweizer、Anna K. H. Hirsch、Markus Fischer、Adelbert Bacher、François Diederich

  DOI：10.1002/ejoc.201201467

  日期：2013.2

  but not in humans. Herein, the structure-based design, synthesis, and biological evaluation of a series of inhibitors featuring a central imidazole or benzimidazole scaffold for the kinase IspE from E. coli, a model for the corresponding malarial enzyme, are described. Optimization of the binding preferences of the hydrophobic sub-pocket at the substrate-binding site allowed IC50 values in the lower

  生成类异戊二烯的不依赖甲羟戊酸的生物合成途径中的酶是开发新候选药物的有吸引力的目标，特别是针对疟疾和结核病，因为它们存在于主要的人类病原体中，但不存在于人类中。在此，描述了一系列抑制剂的基于结构的设计、合成和生物学评估，这些抑制剂具有来自大肠杆菌的激酶 IspE 的中心咪唑或苯并咪唑支架，是相应的疟疾酶模型。在底物结合位点处疏水性子袋的结合偏好的优化允许达到较低微摩尔范围内的 IC50 值。使用 1,2-二取代咪唑中心核的构效关系研究表明，脂环部分比子口袋更适合