小分子探针在加深我们对
生物钟的分子基础的理解中起着重要作用。我们先前发现了
咔唑衍
生物KL001(N-(3-(9 H-
咔唑-9-基)-2-羟丙基)-N-(
呋喃-2-基甲基)甲磺酰胺)作为时钟蛋白隐色
染料的稳定剂(哭)。在这里,我们描述了导致高活性衍
生物发展的KL001衍
生物的广泛的结构-活性关系分析:2-(9 H-
咔唑-9-yl)-N-(2-
氯-6-
氰基苯基)乙酰胺(KL044)。随后的3D-Q
SAR分析确定了KL001衍
生物的关键特征,并提供了其与CRY相互作用的分子
水平理解。富电子
咔唑,酰胺/羟基连接基,磺酰基和吸电子腈部分有助于提高
生物活性。与Ser394和His357的氢键相互作用以及与Trp290的更强的CH-π相互作用使KL044比KL001更好。KL044延长了昼夜节律周期,抑制了Per2活性,并在报告
基因检测中稳定了CRY,其效力比KL001高约十倍。总之,KL044是一种功