3',5'-o-bis-tert-butyldimethylsilyl-N3-tert-butyloxycarbonyl-thymidine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3',5'-o-bis-tert-butyldimethylsilyl-N3-tert-butyloxycarbonyl-thymidine
• 英文别名: N3-tert-butoxycarbonyl-3',5'-O-bis-tert-butyldimethylsilanyl-thymidine；N3-tert-butyloxycarbonyl-3',5'-O-bis-tert-butyldimethylsilyl-thymidine；3-tert-butyloxycarbonyl-3',5'-O-bis-tert-butyldimethylsilyl-thymidine；tert-Butyl 3-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5-methyl-2,6-dioxo-2,3-dihydropyrimidine-1(6H)-carboxylate；tert-butyl 3-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-5-methyl-2,6-dioxopyrimidine-1-carboxylate
• 化学式: C₂₇H₅₀N₂O₇Si₂
• 分子量: 570.874
• InChiKey: BTROLJICVHBZGN-PWRODBHTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.8
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.81
• 拓扑面积：
  94.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3',5'-o-bis-tert-butyldimethylsilyl-N3-tert-butyloxycarbonyl-thymidine 在 磷酸三甲酯 、 四丁基氟化铵 、 1,8-双二甲氨基萘 、 sodium hydride 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  光可断裂的荧光标记化合物及用途

  摘要：

  本发明提供了一种光可断裂的荧光标记可逆终端化合物及其在DNA或RNA测序中的用途。本发明采用光可断裂基团作为抑制基团，在一定波长的照射下，抑制基团与碱基断开；该离去过程不需要特殊的催化剂或还原剂等的辅助，不会存在辅助试剂与DNA聚合酶、碱基的副反应，从而在温和的条件下实现可逆终止；此外，该离去过程对测序过程本身没有任何干扰，有利于长片段单分子测序。

  公开号：

  CN106188197A
• 作为产物：
  描述：

  二碳酸二叔丁酯 、 叔丁基二甲基氯硅烷 、 beta-胸苷 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以83%的产率得到3',5'-o-bis-tert-butyldimethylsilyl-N3-tert-butyloxycarbonyl-thymidine
  参考文献：
  名称：

  光可断裂的荧光标记化合物及用途

  摘要：

  本发明提供了一种光可断裂的荧光标记可逆终端化合物及其在DNA或RNA测序中的用途。本发明采用光可断裂基团作为抑制基团，在一定波长的照射下，抑制基团与碱基断开；该离去过程不需要特殊的催化剂或还原剂等的辅助，不会存在辅助试剂与DNA聚合酶、碱基的副反应，从而在温和的条件下实现可逆终止；此外，该离去过程对测序过程本身没有任何干扰，有利于长片段单分子测序。

  公开号：

  CN106188197A

文献信息

• 光可断裂的荧光标记化合物及用途
  申请人：深圳市瀚海基因生物科技有限公司

  公开号：CN106188197A

  公开（公告）日：2016-12-07

  本发明提供了一种光可断裂的荧光标记可逆终端化合物及其在DNA或RNA测序中的用途。本发明采用光可断裂基团作为抑制基团，在一定波长的照射下，抑制基团与碱基断开；该离去过程不需要特殊的催化剂或还原剂等的辅助，不会存在辅助试剂与DNA聚合酶、碱基的副反应，从而在温和的条件下实现可逆终止；此外，该离去过程对测序过程本身没有任何干扰，有利于长片段单分子测序。