6-氨基-5-(2-羟基乙基)-2(1H)-嘧啶酮 | 89711-99-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 中文名称: 6-氨基-5-(2-羟基乙基)-2(1H)-嘧啶酮
• 英文名称: 4-amino-5-(2-hydroxyethyl)-1H-pyrimidin-2-one
• 英文别名: 5-(2-hydroxyethyl)cytosine；6-amino-5-(2-hydroxyethyl)-1H-pyrimidin-2-one
• CAS: 89711-99-9
• 化学式: C₆H₉N₃O₂
• mdl: MFCD12545754
• 分子量: 155.156
• InChiKey: NOYYUQCJSFZZIM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.6
• 重原子数：
  11
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.333
• 拓扑面积：
  87.7
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

安全信息

• 海关编码：
  2933599090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-氨基-5-(2-羟基乙基)-2(1H)-嘧啶酮 在 吡啶 、 四氯化碳 、 三甲基氯硅烷 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 三苯基膦 、 六甲基二硅氮烷 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 5-(2-chloroethyl) 1-[2-deoxy-3,5-di-O-(p-toluoyl)-β-D-ribofuranosyl]cytosine
  参考文献：
  名称：

  5-（卤代烷基）-2'-脱氧尿苷：一种新型的有效抗病毒核苷类似物。

  摘要：

  描述了5-（2-卤乙基）-2'-脱氧尿苷，5-（3-氯丙基）-2'-脱氧尿苷和5-（2-氯乙基）-2'-脱氧胞苷的合成。在细胞培养物中确定了这些化合物对1型和2型单纯疱疹病毒的抗病毒活性。所有化合物均显示出显着的选择性抗病毒活性。最有效的衍生物5-（2-氯乙基）-2'-脱氧尿苷（CEDU）在浓度低于0.1微克/毫升时抑制HSV-1。仅在浓度高于100微克/ mL时，它对细胞增殖才产生可测量的抑制作用。体内CEDU腹膜内和口服给予的浓度低于每天5 mg / kg的小鼠，可降低HSV-1感染小鼠的死亡率。从而，

  DOI：

  10.1021/jm00149a024
• 作为产物：
  描述：

  5-hydroxyethyl-2-thiocytosine 在 双氧水 、 sodium hydroxide 作用下， 生成 6-氨基-5-(2-羟基乙基)-2(1H)-嘧啶酮
  参考文献：
  名称：

  Ansa1-胞苷的合成

  摘要：

  描述了新的 ansa1-N45-乙烯胞苷如 3-ß-D-ribofuranosyl-3,5,6,7-tetrahydro-2H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-one 的合成及存在的问题与所讨论的所需四氢-2H-吡咯并[2,3-d]嘧啶碱的闭环连接。此外还评论了新的 ansa1-胞苷缺乏生物活性。

  DOI：

  10.1080/15257770903109896

文献信息

• Real-time PCR point mutation assays for detecting HIV-1 resistance to antiviral drugs
  申请人：THE GOVERNMENT OF THE UNITED STATES OF AMERICA, as represented by the Secretary, Department of Health and Human Services

  公开号：EP2210958A2

  公开（公告）日：2010-07-28

  Disclosed are compositions including primers and probes, which are capable of interacting with the disclosed nucleic acids, such as the nucleic acids encoding the reverse transcriptase or protease of HIV as disclosed herein. Thus, provided is an oligonucleotide comprising any one of the nucleotide sequences set for in SEQ ID NOS: 1-89, and 96-104. Also provided are the oligonucleotides consisting of the nucleotides as set forth in SEQ ID NOS: 1-89, and 96-104. Each of the disclosed oligonucleotides is a probe or a primer. Also provided are mixtures of primers and probes and for use in RT-PCR and primary PCR reactions disclosed herein Provided are methods for the specific detection of several mutations in HIV. Mutations in both the reverse transcriptase and the protease of HIV can be detected using the methods described herein.

  所公开的是包括引物和探针的组合物，它们能够与所公开的核酸，如本文所公开的编码 HIV 逆转录酶或蛋白酶的核酸相互作用。因此，所提供的寡核苷酸包含 SEQ ID NOS：1-89 和 96-104 所列核苷酸序列中的任意一种。还提供了由 SEQ ID NOS：1-89 和 96-104 所述核苷酸组成的寡核苷酸。所公开的每个寡核苷酸都是探针或引物。本发明还提供了引物和探针的混合物，以及用于 RT-PCR 和初级 PCR 反应的引物和探针的混合物。 本发明提供了特异性检测 HIV 中几种突变的方法。使用本文所述方法可检测 HIV 逆转录酶和蛋白酶中的突变。
• Method for genomic profiling of DNA 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine
  申请人：SHANGHAI EPICAN GENETECH CO. LTD

  公开号：US11162139B2

  公开（公告）日：2021-11-02

  The present invention provides a method for genomic profiling of DNA 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine, comprising the following steps: (1) DNA purification and fragmentation pretreatment: the target DNA is extracted and then broken to an average of 50 nucleotides to 10,000 nucleotides in length; (2) the repair of trace amount of DNA and the ligation thereof to the adaptor: the pre-treated DNA fragments are repaired and ligated with the sequencing adaptor required for the second-generation sequencing, (3) covalently labeling 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine, (4) solid-phase enrichment of the labeled DNA fragments having cytosine with 5-position modification; (5) the PCR amplification of the solid-phase enriched DNA fragments, the PCR product is obtained and purified to obtain a library for the second-generation sequencing, after mapping the sequencing reads to the genome, the distribution map of the cytosine with 5-position modification in the DNA sample could be generated. The present invention greatly enhances the selectivity and efficiency of binding of the solid-phase surface with the DNA modified base.

  本发明提供了一种DNA 5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶基因组谱分析方法，包括以下步骤：(1) DNA 纯化和破碎预处理：提取目标 DNA，然后将其破碎为平均 50 个核苷酸至 10,000 个核苷酸的长度；(2) 修复微量 DNA 并将其与适配体连接：(3)共价标记 5-甲基胞嘧啶和 5-羟甲基胞嘧啶；(4)固相富集具有 5 位修饰胞嘧啶的标记 DNA 片段；(5) 对固相富集的 DNA 片段进行 PCR 扩增，得到 PCR 产物并纯化，得到用于第二代测序的文库，将测序读数映射到基因组后，可生成 5 位修饰胞嘧啶在 DNA 样品中的分布图。本发明大大提高了固相表面与 DNA 修饰碱基结合的选择性和效率。
• 2'-O-ACETAMIDO MODIFIED MONOMERS AND OLIGOMERS
  申请人：ISIS PHARMACEUTICALS, INC.

  公开号：EP1212339A1

  公开（公告）日：2002-06-12
• EP1212339A4
  申请人：——

  公开号：EP1212339A4

  公开（公告）日：2002-09-18
• USE OF ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDES TO INHIBIT THE EXPRESSION OF AKT-1
  申请人：Rexahn Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：EP1546180B1

  公开（公告）日：2013-07-03