2-[2-(3-chloro-4-methoxyphenyl)ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[2-(morpholin-4-yl)propyl]-1H-benzimidazole | 1613695-08-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 2-[2-(3-chloro-4-methoxyphenyl)ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[2-(morpholin-4-yl)propyl]-1H-benzimidazole
• 英文别名: Sgccbp30；4-[1-[2-[2-(3-chloro-4-methoxyphenyl)ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)benzimidazol-1-yl]propan-2-yl]morpholine
• CAS: 1613695-08-1
• 化学式: C₂₈H₃₃ClN₄O₃
• 分子量: 509.048
• InChiKey: GEPYBHCJBORHCE-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.2
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  65.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  4-(4-fluoro-3-nitrophenyl)-3,5-dimethylisoxazole 在 sodium dithionite 、 1-丙基磷酸酐 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 36.0h， 生成 2-[2-(3-chloro-4-methoxyphenyl)ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[2-(morpholin-4-yl)propyl]-1H-benzimidazole
  参考文献：
  名称：

  CBP/p300 溴结构域小分子配体的发现和优化

  摘要：

  缺乏针对溴结构域和末端外 (BET) 亚家族之外的溴结构域的小分子抑制剂。在这里，我们描述了人类赖氨酸乙酰转移酶 CBP/p300 溴结构域模块的高效和选择性配体，由一系列 5-异恶唑基苯并咪唑开发而成。我们的出发点是片段命中，使用 Suzuki 偶联、苯并咪唑形成反应和还原胺化的平行合成将其优化为更有效和选择性更强的先导化合物。使用热稳定性测定法研究了先导化合物对其他溴结构域家族成员的选择性，结果显示对结构相关的 BET 家族成员有一些抑制作用。为了解决 BET 选择性问题，与 CREB ​​结合蛋白 (CBP) 和 BRD4 的第一个溴结构域 (BRD4(1)) 结合的先导化合物的 X 射线晶体结构用于指导更具选择性的化合物的设计。获得的晶体结构揭示了两种不同的结合模式。通过改变芳基取代模式和开发构象受限的类似物，增加了 CBP 超过 BRD4(1) 的选择性。优化后的化合物具有高效 (Kd

  DOI：

  10.1021/ja412434f

文献信息

• THERAPEUTIC COMPOUNDS AND USES THEREOF
  申请人：Constellation Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US20160158207A1

  公开（公告）日：2016-06-09

  The present invention relates to compounds of formula (I) or formula (II): and to salts thereof, wherein R 1 -R 4 of formula (I) and R 1 -R 3 of formula (II) have any of the values defined herein, and compositions and uses thereof. The compounds are useful as inhibitors of CBP and/or EP300. Also included are pharmaceutical compositions comprising a compound of formula (I) of formula (II) or a pharmaceutically acceptable salt thereof, and methods of using such compounds and salts in the treatment of various CBP and/or EP300-mediated disorders.

  本发明涉及公式（I）或公式（II）的化合物及其盐，其中公式（I）的R1-R4和公式（II）的R1-R3具有以下定义的任何值，以及其组合物和用途。这些化合物可用作CBP和/或EP300的抑制剂。还包括含有公式（I）或公式（II）的化合物或其药学上可接受的盐的制药组合物，以及使用这些化合物和盐治疗各种CBP和/或EP300介导的疾病的方法。
• Methods for measuring binding and cellular engagement of ligands with target proteins
  申请人：EUROFINS DISCOVERX CORPORATION

  公开号：US10641776B2

  公开（公告）日：2020-05-05

  Disclosed are methods for detecting and quantitatively measuring a binding property of a compound to a target macromolecule, wherein the target macromolecule is subject to denaturation and is linked to a labeling peptide, such as a short enzyme fragment. The method uses a fluid mixture comprising (i) a chimeric molecule comprising a target macromolecule linked to the labeling peptide, wherein the target macromolecule may be a chimeric protein expressed by and within an intact viable cell and (ii) a compound being measured for binding to the target macromolecule, wherein said target macromolecule is subject to denaturation. After allowing for binding of the compound (e.g. a small molecule inhibitor of the target macromolecule), one detects a signal from the labeling peptide, such as by enzyme fragment complementation. This signal indicates a differential between denatured and non-denatured target macromolecules and thereby indicates a differential between target macromolecules not bound to the compound and target macromolecules bound to the compound, respectively.

  本发明公开了用于检测和定量测量化合物与目标大分子结合特性的方法，其中目标大分子可变性并与标记肽（如短酶片段）相连。该方法使用的流体混合物包括：(i) 嵌合分子，该嵌合分子包括与标记肽连接的目标大分子，其中目标大分子可以是由完整的有活力细胞表达并在其中的嵌合蛋白；(ii) 测量与目标大分子结合的化合物，其中所述目标大分子会变性。在允许化合物（如目标大分子的小分子抑制剂）结合后，通过酶片段互补等方法检测来自标记肽的信号。该信号表明变性和非变性靶大分子之间的差异，从而分别表明未与化合物结合的靶大分子和与化合物结合的靶大分子之间的差异。
• HOMOGENOUS THERMAL SHIFT LIGAND BINDING ASSAY
  申请人：DiscoveRx Corporation

  公开号：EP3183580A1

  公开（公告）日：2017-06-28
• METHODS FOR MEASURING BINDING AND CELLULAR ENGAGEMENT OF LIGANDS WITH TARGET PROTEINS
  申请人：Eurofins DiscoverX Corporation

  公开号：EP3337905B1

  公开（公告）日：2020-09-16
• TARGETED EPIGENETIC THERAPY FOR INHERITED AORTIC ANEURYSM CONDITION
  申请人：The Johns Hopkins University

  公开号：EP3675880A1

  公开（公告）日：2020-07-08