Nanomolar Binding of Peptides Containing Noncanonical Amino Acids by a Synthetic Receptor
作者:Leigh A. Logsdon、Christopher L. Schardon、Vijayakumar Ramalingam、Sharon K. Kwee、Adam R. Urbach
DOI:10.1021/ja207825y
日期:2011.10.26
Q7 with an equilibrium dissociation constant (K(d)) value of 0.95 nM in neutral phosphate buffer. Structure-activity studies revealed that three functional groups work in a positively cooperative manner to achieve this extraordinary stability (1) the N-terminal ammonium group, (2) the side chain ammonium group, and (3) the peptide backbone. Addition of the aminomethyl group to Phe substantially improved
本文描述了合成受体葫芦[7] uril (Q7) 对苯丙氨酸衍生物及其肽的分子识别。从筛选中鉴定出苯丙氨酸的 4-叔丁基和 4-氨基甲基衍生物(tBuPhe 和 AMPhe)对 Q7 的亲和力比苯丙氨酸高 20-30 倍。将这些残基放置在模型三肽 (X-Gly-Gly) 的 N 端,导致对 tBuPhe-Gly-Gly 的亲和力没有变化,但对 AMPhe-Gly-Gly 的亲和力显着增加了 500 倍,这在中性磷酸盐缓冲液中以 0.95 nM 的平衡解离常数 (K(d)) 值绑定到 Q7。构效研究表明,三个官能团以积极合作的方式工作以实现这种非凡的稳定性(1)N-末端铵基团,(2)侧链铵基团,(3) 肽骨架。将氨甲基添加到 Phe 显着提高了肽对氨基酸和 N 端对非端位置的选择性。重要的是,Q7 与 N 端 AMPhe 的结合比任何经典氨基酸残基都要紧密几个数量级。该系统的高亲和力、单位点