Effect of Sequence on Peptide Geometry in 5-<i>tert</i>-Butylprolyl Type VI β-Turn Mimics
作者:Liliane Halab、William D. Lubell
DOI:10.1021/ja012442w
日期:2002.3.1
content adopted type VIa beta-turn conformations as shown by their NMR and CD spectra. Although a pattern of amide proton temperature coefficient values indicative of a hairpin geometry was observed in peptides 14d and 14f, the value magnitudes did not indicate strong hydrogen bonding in water.
通过将 (2S,5R)-5-叔丁基脯氨酸 (5-(t)BuPro) 结合到一系列二肽和四肽中来检查序列对转弯几何形状的影响。(2S,5R)-5-叔丁基脯氨酸和脯氨酸分别引入 N-乙酰二肽 N'-甲基酰胺 1 和 2 的 C 端残基。这些类似物的构象分析也使用 NMR 和 CD 光谱进行作为X射线衍射检查控制脯氨酰胺的因素(本文中的术语“脯氨酰胺”是指由脯氨酰残基的吡咯烷氮和N端残基的羰基组成的叔酰胺)平衡并稳定 VI 型β-转角构象。如在 1c 的晶体结构中所见,具有芳香族残基 N-末端到脯氨酸的高顺式异构体群体被证明是由部分带正电荷的脯氨酰胺氮和芳香族 pi 系统之间的堆积相互作用引起的。通过改变 Xaa 处的氨基酸研究序列对 5-(t)BuPro-四肽 (Ac-Xaa-Yaa-5-(t)BuPro-Zaa-XMe, 13 和 14) 的脯氨酰酰胺平衡的影响、Yaa 和 Zaa 位置。获得高