2-aminomethylpyrimidine-5-carboxylic acid methyl ester hydrochloride

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 2-aminomethylpyrimidine-5-carboxylic acid methyl ester hydrochloride
• 英文别名: Methyl 2-(aminomethyl)pyrimidine-5-carboxylate hydrochloride；methyl 2-(aminomethyl)pyrimidine-5-carboxylate;hydrochloride
• 化学式: C₇H₉N₃O₂*ClH
• 分子量: 203.628
• InChiKey: QHOVZTVDHVIBNK-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.14
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  78.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-aminomethylpyrimidine-5-carboxylic acid methyl ester hydrochloride 、 6-chloro-N²,N⁴-bis(4-fluorophenyl)-1,3,5-triazine-2,4-diamine 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以70 %的产率得到
  参考文献：
  名称：

  用于调节哺乳动物细胞和动物 RNA 功能的小分子适体

  摘要：

  可以通过哺乳动物细胞中 RNA 适体识别的小分子调节基因表达的合成核糖开关在生物技术和医学中具有各种潜在应用。然而，已证明在哺乳动物细胞中起作用的小分子及其同源适体的种类是有限的。目前可用的适体-配体对也需要高浓度的小分子来实现基因调控，这使得它们不太适合工业和生物医学应用。我们在体外进行针对小分子 ASP7967 选择 RNA 适体，其结构与 ASP2905 密切相关，ASP2905 是已知的钾电压门控通道亚家族 H 成员 3 (KCNH3) 抑制剂。发现所选的适体之一 (AC17–4) 在 HEK293 细胞中具有功能，它被用于设计基于适体酶的核糖开关，在 ASP2905 或 ASP7967 存在的情况下，以低至在培养基中为 5 μM。基于 aptazyme 的核糖开关成功地用于调节注射腺相关病毒 (AAV8) 载体的小鼠体内促红细胞生成素的表达，该载体使用口服给药的 ASP7967。

  DOI：

  10.1021/jacs.2c12332

文献信息

• WO2024075841A1
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• Small-Molecule Aptamer for Regulating RNA Functions in Mammalian Cells and Animals
  作者：Keisuke Fukunaga、V. Dhamodharan、Nao Miyahira、Yoko Nomura、Kamila Mustafina、Yasuaki Oosumi、Kosuke Takayama、Akira Kanai、Yohei Yokobayashi

  DOI：10.1021/jacs.2c12332

  日期：——

  Synthetic riboswitches that can regulate gene expression by a small molecule recognized by an RNA aptamer in mammalian cells have various potential applications in biotechnology and medicine. However, the variety of small molecules and their cognate aptamers that have been demonstrated to function in mammalian cells is limited. The currently available aptamer-ligand pairs also require high small molecule

  可以通过哺乳动物细胞中 RNA 适体识别的小分子调节基因表达的合成核糖开关在生物技术和医学中具有各种潜在应用。然而，已证明在哺乳动物细胞中起作用的小分子及其同源适体的种类是有限的。目前可用的适体-配体对也需要高浓度的小分子来实现基因调控，这使得它们不太适合工业和生物医学应用。我们在体外进行针对小分子 ASP7967 选择 RNA 适体，其结构与 ASP2905 密切相关，ASP2905 是已知的钾电压门控通道亚家族 H 成员 3 (KCNH3) 抑制剂。发现所选的适体之一 (AC17–4) 在 HEK293 细胞中具有功能，它被用于设计基于适体酶的核糖开关，在 ASP2905 或 ASP7967 存在的情况下，以低至在培养基中为 5 μM。基于 aptazyme 的核糖开关成功地用于调节注射腺相关病毒 (AAV8) 载体的小鼠体内促红细胞生成素的表达，该载体使用口服给药的 ASP7967。