2-[3-(6-carbamimidoyl-1H-benzimidazol-2-yl)phenyl]-3H-benzimidazole-5-carboximidamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 2-[3-(6-carbamimidoyl-1H-benzimidazol-2-yl)phenyl]-3H-benzimidazole-5-carboximidamide
• 化学式: C₂₂H₁₈N₈
• 分子量: 394.439
• InChiKey: FZJGRZBRFWDGQC-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  157
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  间苯二甲腈 在 盐酸 、 溶剂黄146 作用下， 以 苯 为溶剂， 反应 11.5h， 生成 2-[3-(6-carbamimidoyl-1H-benzimidazol-2-yl)phenyl]-3H-benzimidazole-5-carboximidamide
  参考文献：
  名称：

  烷基和芳基连接的双（ami基苯并咪唑）和双（ami基吲哚）的结构，DNA小沟结合和碱基对特异性。

  摘要：

  已经制备了一系列具有变化的连接链的双（ami基苯并咪唑）和双（ami基吲哚），所述连接链连接芳族基团并且对碱性a基进行了各种修饰。小牛胸腺（CT）DNA和核酸均聚物[poly（dA）.poly（dT），poly（dA-dT）.poly-（dA-dT）和poly（dG-dC）.poly（dG-dC） ）]已经通过热变性（ΔTm）和粘度研究了这些化合物的结合性能。该化合物对poly（dA）.poly（dT）和poly（dA-dT）.poly（dA-dT）的亲和力大于对poly（dG-dC）.poly（dG-dC）的亲和力。粘度滴定表明该化合物不通过嵌入结合。分子模型研究和生物物理数据表明，分子与CT DNA和均聚物的小沟结合。分子形状的分析与这种核酸结合模式一致。与苯并咪唑环相连的亚甲基数量为偶数的化合物比亚甲基数量为奇数的化合物对DNA的亲和力更高。确定分子中四个定义的基团的曲率半径的分子模

  DOI：

  10.1021/jm00064a008

文献信息

• In Silico and In Vitro Evaluation of Some Amidine Derivatives as Hit Compounds towards Development of Inhibitors against Coronavirus Diseases
  作者：Ahmed H. E. Hassan、Selwan M. El-Sayed、Mizuki Yamamoto、Jin Gohda、Takehisa Matsumoto、Mikako Shirouzu、Jun-ichiro Inoue、Yasushi Kawaguchi、Reem M. A. Mansour、Abtin Anvari、Abdelbasset A. Farahat

  DOI：10.3390/v15051171

  日期：——

  Coronaviruses, including SARS-CoV-2, SARS-CoV, MERS-CoV and influenza A virus, require the host proteases to mediate viral entry into cells. Rather than targeting the continuously mutating viral proteins, targeting the conserved host-based entry mechanism could offer advantages. Nafamostat and camostat were discovered as covalent inhibitors of TMPRSS2 protease involved in viral entry. To circumvent

  冠状病毒，包括 SARS-COV-2、SARS-COV、MERS-COV 和甲型流感病毒，需要宿主蛋白酶介导病毒进入细胞。相对于针对不断突变的病毒蛋白，针对保守的基于宿主的进入机制可能会提供优势。Nafamostat 和 camostat 被发现是参与病毒进入的 TMPRSS2 蛋白酶的共价抑制剂。为了规避它们的局限性，可能需要可逆抑制剂。考虑到nafamostat结构并使用喷他脒作为起点，设计了一小组结构多样的刚性类似物并在计算机上进行了评估，以指导选择要制备用于生物学评估的化合物。根据计算机研究的结果，制备了六种化合物并进行了体外评价。在酶水平上，化合物 10-12 以低微摩尔 IC50 浓度触发潜在的 TMPRSS2 抑制，但它们在细胞测定中效果较差。同时，化合物14不会在酶水平上触发潜在的TMPRSS2抑制作用，但它显示出抑制膜融合的潜在细胞活性，其低微摩尔IC50值为10.87