Synthesis, Molecular Docking and Biological Characterization of Pyrazine Linked 2-Aminobenzamides as New Class I Selective Histone Deacetylase (HDAC) Inhibitors with Anti-Leukemic Activity
作者:Hany S. Ibrahim、Mohamed Abdelsalam、Yanira Zeyn、Matthes Zessin、Al-Hassan M. Mustafa、Marten A. Fischer、Patrik Zeyen、Ping Sun、Emre F. Bülbül、Anita Vecchio、Frank Erdmann、Matthias Schmidt、Dina Robaa、Cyril Barinka、Christophe Romier、Mike Schutkowski、Oliver H. Krämer、Wolfgang Sippl
DOI:10.3390/ijms23010369
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highly selective against HDAC1, 2 and 3 over the remaining HDAC subtypes from other classes. Molecular docking studies and MD simulations were performed to rationalize the in vitro data and to deduce a complete structure activity relationship (SAR) analysis of this novel series of class-I HDACi. The most potent compounds, including 19f, which blocks HDAC1, HDAC2, and HDAC3, as well as the selective HDAC1/HDAC2
I 类组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 是细胞增殖的关键调节剂,它们在癌细胞中经常失调。我们在此报告了一系列新型 I 类选择性 HDAC 抑制剂 (HDACi) 的合成,该抑制剂含有 2-氨基苯甲酰胺部分作为与中心 (哌嗪-1-基) 吡嗪或 (哌嗪-1-基) 连接的锌结合基团)嘧啶部分。一些化合物还被芳族封端基团取代。化合物在体外针对人 HDAC1、2、3 和 8 酶进行了测试,并与参考 I 类 HDACi(Entinostat (MS-275)、Mocetinostat、CI994 和 RGFP-966)进行了比较。发现最有希望的化合物对 HDAC1、2 和 3 的选择性高于其他类别的其余 HDAC 亚型。进行分子对接研究和 MD 模拟以使体外数据合理化并推导出这一新型 I 类 HDACi 系列的完整结构活性关系 (SAR) 分析。选择最有效的化合物,包括阻断 HDAC1、HDAC2 和 HDAC3