Fmoc-（S）-3-噻吩基甘氨酸 | 1217706-09-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: Fmoc-（S）-3-噻吩基甘氨酸
• 英文名称: (S)-2-((((9H-Fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-2-(thiophen-3-yl)acetic acid
• 英文别名: (2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-2-thiophen-3-ylacetic acid
• CAS: 1217706-09-6
• 化学式: C₂₁H₁₇NO₄S
• 分子量: 379.436
• InChiKey: RXQJSFSUCQXAJC-IBGZPJMESA-N

物化性质

• 沸点：
  621.4±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.370±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.14
• 拓扑面积：
  104
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 海关编码：
  2934999090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-苯氧基苯甲酸 、 Fmoc-（S）-3-噻吩基甘氨酸 、 FMOC-O-叔丁基-L-丝氨酸 、 Fmoc-L-异亮氨酸 、 炔丙胺 、 alkaline earth salt of/the/ methylsulfuric acid 在 sodium cyanoborohydride 、 溶剂黄146 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  使用聚焦的DNA编码库优化配体，以开发选择性的，可渗透细胞的CBX8色域抑制剂。

  摘要：

  聚梳抑制复合物1（PRC1）对于在发育过程中介导基因表达至关重要。五个色盒（CBX）同源蛋白CBX2，CBX4，CBX6，CBX7和CBX8被整合到PRC1复合物中，它们通过N端染色体结构域（ChD）介导对组蛋白H3（H3K27me3）的三甲基赖氨酸27的靶向作用。个别的CBX旁系同源物已被认为是癌症的药物靶标。然而，CBX ChD之间序列和结构的高度相似性为开发选择性CBX ChD抑制剂提供了主要障碍。在这里，我们报告针对多个同源ChD的小型，集中，DNA编码文库（DEL）的选择，以鉴定对亲本配体的修饰，从而赋予CBX8 ChD选择性和效力。这种基于DNA的药物化学方法使SW2_110A（一种选择性的，CBX8 ChD的细胞可渗透抑制剂。SW2_110A以800 nM的Kd结合CBX8 ChD，在体外对CBX8 ChD的选择性是其他所有CBX同源物的5倍。SW2_110A特异性抑制细胞中

  DOI：

  10.1021/acschembio.9b00654

文献信息

• Optimization of Ligands Using Focused DNA-Encoded Libraries To Develop a Selective, Cell-Permeable CBX8 Chromodomain Inhibitor
  作者：Sijie Wang、Kyle E. Denton、Kathryn F. Hobbs、Tyler Weaver、James M. B. McFarlane、Katelyn E. Connelly、Michael C. Gignac、Natalia Milosevich、Fraser Hof、Irina Paci、Catherine A. Musselman、Emily C. Dykhuizen、Casey J. Krusemark

  DOI：10.1021/acschembio.9b00654

  日期：2020.1.17

  obstacle in developing selective CBX ChD inhibitors. Here we report the selection of small, focused, DNA-encoded libraries (DELs) against multiple homologous ChDs to identify modifications to a parental ligand that confer both selectivity and potency for the ChD of CBX8. This on-DNA, medicinal chemistry approach enabled the development of SW2_110A, a selective, cell-permeable inhibitor of the CBX8 ChD. SW2_110A

  聚梳抑制复合物1（PRC1）对于在发育过程中介导基因表达至关重要。五个色盒（CBX）同源蛋白CBX2，CBX4，CBX6，CBX7和CBX8被整合到PRC1复合物中，它们通过N端染色体结构域（ChD）介导对组蛋白H3（H3K27me3）的三甲基赖氨酸27的靶向作用。个别的CBX旁系同源物已被认为是癌症的药物靶标。然而，CBX ChD之间序列和结构的高度相似性为开发选择性CBX ChD抑制剂提供了主要障碍。在这里，我们报告针对多个同源ChD的小型，集中，DNA编码文库（DEL）的选择，以鉴定对亲本配体的修饰，从而赋予CBX8 ChD选择性和效力。这种基于DNA的药物化学方法使SW2_110A（一种选择性的，CBX8 ChD的细胞可渗透抑制剂。SW2_110A以800 nM的Kd结合CBX8 ChD，在体外对CBX8 ChD的选择性是其他所有CBX同源物的5倍。SW2_110A特异性抑制细胞中