L-缬氨酰-L-谷氨酰甘氨酰-L-alpha-谷氨酰-L-alpha-谷氨酰-L-丝氨酰-L-天冬氨酰胺酰-L-alpha-天冬氨酰-L-赖氨酸 | 106021-96-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: L-缬氨酰-L-谷氨酰甘氨酰-L-alpha-谷氨酰-L-alpha-谷氨酰-L-丝氨酰-L-天冬氨酰胺酰-L-alpha-天冬氨酰-L-赖氨酸
• 英文名称: VQGEESNDK
• 英文别名: Interleukin-1beta (163-171)；(2S)-6-amino-2-[[(2S)-2-[[(2S)-4-amino-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-2-amino-3-methylbutanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]acetyl]amino]-4-carboxybutanoyl]amino]-4-carboxybutanoyl]amino]-3-hydroxypropanoyl]amino]-4-oxobutanoyl]amino]-3-carboxypropanoyl]amino]hexanoic acid
• CAS: 106021-96-9
• 化学式: C₃₉H₆₄N₁₂O₁₉
• 分子量: 1005.01
• InChiKey: NIXBZDOQHRZFDR-OEWCNXHOSA-N

物化性质

• 沸点：
  1682.6±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.419±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  不溶于乙醇； DMSO 中≥100.4 mg/mL；水中≥24.75 mg/mL

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -12.6
• 重原子数：
  70
• 可旋转键数：
  36
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  540
• 氢给体数：
  17
• 氢受体数：
  21

安全信息

• WGK Germany：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  L-缬氨酰-L-谷氨酰甘氨酰-L-alpha-谷氨酰-L-alpha-谷氨酰-L-丝氨酰-L-天冬氨酰胺酰-L-alpha-天冬氨酰-L-赖氨酸 、 (N-琥珀酰亚胺基氧代羰基甲基)三(2,4,6-三甲氧苯基)溴化膦 以 乙腈 为溶剂， 反应 0.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Improving de Novo Sequencing of Peptides Using a Charged Tag and C-Terminal Digestion

  摘要：

  本文介绍了一种通过 MALDI 质谱进行肽从头测序的改进方法。该方法将电荷衍生反应与 C 端消化结合起来，对胰蛋白酶肽进行修饰。电荷衍生将一个固定的电荷基团附着在肽的 N 端，衍生步骤后的酶解去除 C 端基本氨基酸残基，如精氨酸和赖氨酸。在低能 CID 条件下（MALDI Q-TOF 质谱仪）对修饰肽进行碎裂，可得到简化但完整的肽序列离子系列。几种蛋白质消化模型的结果证明了该方法的有效性，无论是手动还是通过自动测序程序，都能正确推断出肽序列。

  DOI：

  10.1021/ac061670b

文献信息

• OIL-BODY PROTEINS AS CARRIERS OF HIGH-VALUE PEPTIDES IN PLANTS
  申请人：SemBioSys Genetics Inc.

  公开号：EP0636179B1

  公开（公告）日：2004-09-22
• Improving de Novo Sequencing of Peptides Using a Charged Tag and C-Terminal Digestion
  作者：Weibin Chen、Peter J. Lee、Henry Shion、Nicholas Ellor、John C. Gebler

  DOI：10.1021/ac061670b

  日期：2007.2.1

  An improved method for peptide de novo sequencing by MALDI mass spectrometry is presented. The method couples a charge derivatization reaction with C-terminal digestion to modify tryptic peptides. The charge derivatization attaches a fixed charge group onto the N-termini of peptides, and the enzymatic digestion after the derivatization step removes C-terminal basic amino acid residues such as arginine and lysine. The fragmentation of the modified peptide(s) under low-energy CID conditions (MALDI Q-TOF mass spectrometer) yields a simplified yet complete ion series of the peptide sequence. The validity of the method is demonstrated by the results from several model protein digests, where peptide sequences were correctly deduced either manually or through an automated sequencing program.

  本文介绍了一种通过 MALDI 质谱进行肽从头测序的改进方法。该方法将电荷衍生反应与 C 端消化结合起来，对胰蛋白酶肽进行修饰。电荷衍生将一个固定的电荷基团附着在肽的 N 端，衍生步骤后的酶解去除 C 端基本氨基酸残基，如精氨酸和赖氨酸。在低能 CID 条件下（MALDI Q-TOF 质谱仪）对修饰肽进行碎裂，可得到简化但完整的肽序列离子系列。几种蛋白质消化模型的结果证明了该方法的有效性，无论是手动还是通过自动测序程序，都能正确推断出肽序列。