Fragment-Based Approaches to the Development of <i>Mycobacterium tuberculosis</i> CYP121 Inhibitors
作者:Madeline E. Kavanagh、Anthony G. Coyne、Kirsty J. McLean、Guy G. James、Colin W. Levy、Leonardo B. Marino、Luiz Pedro S. de Carvalho、Daniel S. H. Chan、Sean A. Hudson、Sachin Surade、David Leys、Andrew W. Munro、Chris Abell
DOI:10.1021/acs.jmedchem.6b00007
日期:2016.4.14
efficiency of structural motifs to be assessed, the identification of more LE scaffolds for optimization and highlighted binding affinity hotspots. Structure-guided addition of a metal-binding pharmacophore onto LE retrofragment scaffolds produced low nanomolar (KD = 15 nM) CYP121 ligands. Elaboration of these compounds to target binding hotspots in the distal active site afforded compounds with excellent
必需酶 CYP121 是针对结核分枝杆菌耐药菌株的药物开发的靶点。使用级联生物物理测定法鉴定出三唑-1-基苯酚片段 1 与 CYP121 结合。1 的合成合并和优化使结合亲和力提高了 100 倍,产生了先导化合物 2 (KD = 15 μM)。将 2 解构为其组件逆向片段允许评估结构基序的组效率,识别更多用于优化的 LE 支架并突出结合亲和力热点。在 LE 逆向片段支架上结构引导添加金属结合药效团产生低纳摩尔 (KD = 15 nM) CYP121 配体。将这些化合物用于靶向远端活性位点的结合热点提供了对人类药物代谢 P450 具有优异选择性的化合物。使用 X 射线晶体学、紫外-可见光谱和天然质谱分析控制配体效力和选择性的因素,为后续药物开发提供了见解。