(2S)-3-methyl-N-[(2S)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-2-(1H-pyrrol-2-ylformamido)butanamide | 1060701-67-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (2S)-3-methyl-N-[(2S)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-2-(1H-pyrrol-2-ylformamido)butanamide
• 英文别名: N-[(2S)-3-methyl-1-[[(2S)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-1-oxobutan-2-yl]-1H-pyrrole-2-carboxamide
• CAS: 1060701-67-8
• 化学式: C₁₆H₂₅N₃O₃
• 分子量: 307.393
• InChiKey: QQXHCWVASSFMJS-JSGCOSHPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  91.1
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1H-pyrrole-2-carboxylic acid [(S)-1-((S)-1-hydroxymethyl-3-methylbutylcarbamoyl)-2-methylpropyl]amide 在 pyridine-SO3 complex 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 2.0h， 以71%的产率得到(2S)-3-methyl-N-[(2S)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-2-(1H-pyrrol-2-ylformamido)butanamide
  参考文献：
  名称：

  选择性钙蛋白酶抑制剂N-杂环二肽醛的合成，生物学评估和分子建模。

  摘要：

  已经合成了一系列的N-杂环二肽醛4-13，并作为绵羊钙蛋白酶1（o-CAPN1）和绵羊钙蛋白酶2（o-CAPN2）的抑制剂进行了评估。5-甲酰基-吡咯9（对o-CAPN1和o-CAPN2的IC（50）值分别为290和25nM）是最有效和最具选择性的o-CAPN2抑制剂，显示出> 11倍的选择性。已经确定了o-CAPN1和o-CAPN2的氨基酸序列。由于缺乏关于绵羊钙蛋白酶的结构信息，因此基于人钙蛋白酶1（h-CAPN1）X射线晶体结构（o-CAPN1和o-CAPN2）的活性位点裂开了计算机同源模型（PDB代码） 1ZCM）。这些模型用于合理化所观察到的化合物4-13的SAR和观察到的9的选择性。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2008.05.048

文献信息

• Synthesis, biological evaluation and molecular modelling of N-heterocyclic dipeptide aldehydes as selective calpain inhibitors
  作者：Matthew A. Jones、James D. Morton、James M. Coxon、Stephen B. McNabb、Hannah Y.-Y. Lee、Steven G. Aitken、Janna M. Mehrtens、Lucinda J.G. Robertson、Axel T. Neffe、Shigeru Miyamoto、Roy Bickerstaffe、Karl Gately、Jacqueline M. Wood、Andrew D. Abell

  DOI：10.1016/j.bmc.2008.05.048

  日期：2008.7

  A series of N-heterocyclic dipeptide aldehydes 4-13 have been synthesised and evaluated as inhibitors of ovine calpain 1 (o-CAPN1) and ovine calpain 2 (o-CAPN2). 5-Formyl-pyrrole 9 (IC(50) values of 290 and 25nM against o-CAPN1 and o-CAPN2, respectively) was the most potent and selective o-CAPN2 inhibitor, displaying >11-fold selectivity. The amino acid sequences of o-CAPN1 and o-CAPN2 have been determined

  已经合成了一系列的N-杂环二肽醛4-13，并作为绵羊钙蛋白酶1（o-CAPN1）和绵羊钙蛋白酶2（o-CAPN2）的抑制剂进行了评估。5-甲酰基-吡咯9（对o-CAPN1和o-CAPN2的IC（50）值分别为290和25nM）是最有效和最具选择性的o-CAPN2抑制剂，显示出> 11倍的选择性。已经确定了o-CAPN1和o-CAPN2的氨基酸序列。由于缺乏关于绵羊钙蛋白酶的结构信息，因此基于人钙蛋白酶1（h-CAPN1）X射线晶体结构（o-CAPN1和o-CAPN2）的活性位点裂开了计算机同源模型（PDB代码） 1ZCM）。这些模型用于合理化所观察到的化合物4-13的SAR和观察到的9的选择性。