N²,N⁶-bis{[4,7,10-tris(tert-butoxycarbonyl)-1,4,7,10-tetraazacyclododecan-1yl]acetyl}-L-lysine | 473894-85-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N²,N⁶-bis{[4,7,10-tris(tert-butoxycarbonyl)-1,4,7,10-tetraazacyclododecan-1yl]acetyl}-L-lysine
• 英文别名: (2S)-2,6-bis[[2-[4,7,10-tris[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]-1,4,7,10-tetrazacyclododec-1-yl]acetyl]amino]hexanoic acid
• CAS: 473894-85-8
• 化学式: C₅₆H₁₀₂N₁₀O₁₆
• 分子量: 1171.48
• InChiKey: GGFBSYHEIMSNRZ-RWYGWLOXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  82
• 可旋转键数：
  23
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.84
• 拓扑面积：
  279
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  18

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N²,N⁶-bis{[4,7,10-tris(tert-butoxycarbonyl)-1,4,7,10-tetraazacyclododecan-1yl]acetyl}-L-lysine 在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 N²,N⁶-bis(1,4,7,10-tetraazacyclodecan-1-ylacetyl)-L-lysine
  参考文献：
  名称：

  含有不同催化基团密度的催化模块的聚合人工金属蛋白酶降解肌红蛋白：肽键裂解的位点选择性

  摘要：

  单核、双核和四核人工金属蛋白酶是通过将含有 Cyclen 的 Cu(II) 络合物 (Cu(II)Cyc) 的相应催化模块连接到交联聚苯乙烯的衍生物来制备的。聚合人工金属蛋白酶通过水解有效地裂解肌红蛋白 (Mb) 的肽键。随着催化基团密度的提高，蛋白水解活性显着增加：对于单核、双核和四核催化剂，k(cat)/K(m) 的比率为 1:13:100。在双核催化剂对 Mb 的降解过程中，积累了两对中间蛋白。导致蛋白质片段形成的两个初始切割位点之一被鉴定为 Gln(91)-Ser(92)，另一个被建议为 Ala(94)-Thr(95)。基于使用 Mb 的 X 射线晶体结构进行的分子建模研究，位点选择性归因于催化模块的一个 Cu(II)Cyc 单元锚定到 Mb 的血红素羧酸盐上。蛋白质底物初始裂解的高位点选择性和催化作用的机械分析对于聚合人工酶来说是前所未有的。

  DOI：

  10.1021/ja034730t
• 作为产物：
  描述：

  L-赖氨酸甲酯 在 sodium hydroxide 、 sodium carbonate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 氯仿 、 乙腈 为溶剂， 反应 57.0h， 生成 N²,N⁶-bis{[4,7,10-tris(tert-butoxycarbonyl)-1,4,7,10-tetraazacyclododecan-1yl]acetyl}-L-lysine
  参考文献：
  名称：

  含有不同催化基团密度的催化模块的聚合人工金属蛋白酶降解肌红蛋白：肽键裂解的位点选择性

  摘要：

  单核、双核和四核人工金属蛋白酶是通过将含有 Cyclen 的 Cu(II) 络合物 (Cu(II)Cyc) 的相应催化模块连接到交联聚苯乙烯的衍生物来制备的。聚合人工金属蛋白酶通过水解有效地裂解肌红蛋白 (Mb) 的肽键。随着催化基团密度的提高，蛋白水解活性显着增加：对于单核、双核和四核催化剂，k(cat)/K(m) 的比率为 1:13:100。在双核催化剂对 Mb 的降解过程中，积累了两对中间蛋白。导致蛋白质片段形成的两个初始切割位点之一被鉴定为 Gln(91)-Ser(92)，另一个被建议为 Ala(94)-Thr(95)。基于使用 Mb 的 X 射线晶体结构进行的分子建模研究，位点选择性归因于催化模块的一个 Cu(II)Cyc 单元锚定到 Mb 的血红素羧酸盐上。蛋白质底物初始裂解的高位点选择性和催化作用的机械分析对于聚合人工酶来说是前所未有的。

  DOI：

  10.1021/ja034730t

文献信息

• Toward Protein-Cleaving Catalytic Drugs: Artificial Protease Selective for Myoglobin
  作者：Joong Won Jeon、Sang Jun Son、Chang Eun Yoo、In Seok Hong、Junghun Suh

  DOI：10.1016/s0968-0896(03)00216-5

  日期：2003.7

  A protein-cleaving catalyst highly selective for a disease-related protein can be used as a catalytic drug. As the first protein-cleaving catalyst selective for a protein substrate, a catalyst for myoglobin (Mb) was designed by attaching the Cu(II) or Co(III) complex of cyclen to a binding site searched by a combinatorial method using peptide nucleic acid monomers as building units. Various linkers were inserted between the catalytic Co(III) center and the binding site of the Mb-cleaving catalyst. Kinetic data revealed catalytic turnover of the Mb cleavage by the Cu(II) or Co(III) complex. MALDI-TOF MS revealed cleavage of the polypeptide backbone of Mb at selected positions. N-Terminal sequencing of the cleavage products identified the cleavage site and provided evidence for the hydrolytic nature of the Mb cleavage. Various chelating ligands were tested as the ligand for the Co(III) center of the Mb-cleaving catalyst. Among the nine chelating ligands examined, only cyclen and its triaza-monooxo analogue manifested catalytic activity. (C) 2003 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.
• Degradation of Myoglobin by Polymeric Artificial Metalloproteases Containing Catalytic Modules with Various Catalytic Group Densities:  Site Selectivity in Peptide Bond Cleavage
  作者：Chang Eun Yoo、Pil Seok Chae、Jung Eun Kim、Eui June Jeong、Junghun Suh

  DOI：10.1021/ja034730t

  日期：2003.11.1

  attaching respective catalytic modules containing the Cu(II) complex of cyclen (Cu(II)Cyc) to a derivative of cross-linked polystyrene. The polymeric artificial metalloproteases effectively cleaved peptide bonds of myoglobin (Mb) by hydrolysis. The proteolytic activity increased considerably as the catalytic group density was raised: the ratio of k(cat)/K(m) was 1:13:100 for the mono-, di-, and tetranuclear

  单核、双核和四核人工金属蛋白酶是通过将含有 Cyclen 的 Cu(II) 络合物 (Cu(II)Cyc) 的相应催化模块连接到交联聚苯乙烯的衍生物来制备的。聚合人工金属蛋白酶通过水解有效地裂解肌红蛋白 (Mb) 的肽键。随着催化基团密度的提高，蛋白水解活性显着增加：对于单核、双核和四核催化剂，k(cat)/K(m) 的比率为 1:13:100。在双核催化剂对 Mb 的降解过程中，积累了两对中间蛋白。导致蛋白质片段形成的两个初始切割位点之一被鉴定为 Gln(91)-Ser(92)，另一个被建议为 Ala(94)-Thr(95)。基于使用 Mb 的 X 射线晶体结构进行的分子建模研究，位点选择性归因于催化模块的一个 Cu(II)Cyc 单元锚定到 Mb 的血红素羧酸盐上。蛋白质底物初始裂解的高位点选择性和催化作用的机械分析对于聚合人工酶来说是前所未有的。