N-(4-羟甲基苯并基)三氟乙酰胺 | 171723-95-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 中文名称: N-(4-羟甲基苯并基)三氟乙酰胺
• 英文名称: 2,2,2-trifluoro-N-[[4-(hydroxymethyl)phenyl]methyl]acetamide
• 英文别名: N-(4-(hydroxymethyl)benzyl)trifluoroacetamide；2,2,2-trifluoro-N-(4-(hydroxymethyl)benzyl)acetamide；N-(4-Hydroxymethylbenzyl)trifluoroacetamide
• CAS: 171723-95-8
• 化学式: C₁₀H₁₀F₃NO₂
• 分子量: 233.19
• InChiKey: BRPKWGMIAIWOJL-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  88-89°C
• 沸点：
  365.3±42.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.333±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于氯仿、二甲基亚砜、乙酸乙酯、甲醇

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.3
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  49.3
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 危险性防范说明：
  P264,P280,P302+P352,P305+P351+P338,P332+P313,P337+P313,P362
• 危险性描述：
  H315,H319
• 储存条件：
  2-8°C

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(4-羟甲基苯并基)三氟乙酰胺 在 盐酸 、 甲醇 、 sodium tetrahydroborate 、 18-冠醚-6 、 potassium tert-butylate 、 potassium carbonate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 13.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  [EN] PHOTOPROXIMITY PROFILING OF PROTEIN-PROTEIN INTERACTIONS IN CELLS
  [FR] PROFILAGE DE PHOTOPROXIMITÉ D'INTERACTIONS PROTÉINE-PROTÉINE DANS DES CELLULES

  摘要：

  描述了用于检测生物相互作用的光活性探针和探针系统。光活性探针包括同时结合光解和光反应基团的探针。光活性探针系统可以包括第一探针，其中包括光催化基团，以及第二探针，其中包括可作为光催化基团催化反应底物的基团。探针和探针系统还可以包括能够特异性结合到感兴趣生物实体上的结合伙伴的基团，以及可检测的基团或其前体。这些探针和探针系统可以检测蛋白质或细胞的时空相互作用。在某些实施方式中，这些相互作用可以在活细胞中检测到。还描述了检测生物相互作用的方法。

  公开号：

  WO2021055960A1
• 作为产物：
  描述：

  4-氨甲基苯甲酸 在 dimethyl sulfide borane 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 N-(4-羟甲基苯并基)三氟乙酰胺
  参考文献：
  名称：

  细胞中蛋白质-蛋白质相互作用的光邻近分析

  摘要：

  我们报告了一种新的光邻近蛋白质相互作用（PhotoPPI）分析方法，用于绘制体外和活细胞中蛋白质-蛋白质相互作用的图谱。该方法利用生物正交多功能化学探针，可通过模块化 SNAP-Tag/苄基鸟嘌呤共价相互作用靶向基因编码的目标蛋白 (POI)。第一代光邻近探针 PP1 响应 365 nm 光，同时裂解中心硝基藜芦基连接体和外围二氮丙啶基团，导致高反应性卡宾亲核试剂从 POI 扩散开。我们在体外演示了简单的探针加载，以及随后的模型蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）的相互作用和光依赖性近端标记。PhotoPPI 工作流程与定量 LC-MS/MS 的集成首次在活细胞中实现了氧化还原调节传感器蛋白 KEAP1 的无偏相互作用图谱。我们在基础细胞条件下验证了 KEAP1 与蛋白质 PGAM5 和 HK2 等之间已知和新颖的相互作用。相比之下，对经历代谢或氧化还原应激的细胞中的 PhotoPPI 谱进行比较证实，KEAP1

  DOI：

  10.1021/jacs.9b06528

文献信息

• Highly Activatable and Environment-Insensitive Optical Highlighters for Selective Spatiotemporal Imaging of Target Proteins
  作者：Tomonori Kobayashi、Toru Komatsu、Mako Kamiya、Cláudia Campos、Marcos González-Gaitán、Takuya Terai、Kenjiro Hanaoka、Tetsuo Nagano、Yasuteru Urano

  DOI：10.1021/ja212125w

  日期：2012.7.11

  Optical highlighters are photoactivatable fluorescent molecules that exhibit pronounced changes in their spectral properties in response to irradiation with light of a specific wavelength and intensity. Here, we present a novel design strategy for a new class of caged BODIPY (4,4-difluoro-4-bora-3a,4a-diaza-s-indacene) fluorophores, based on the use of photoremovable protecting groups (PRPGs) with

  光学荧光笔是可光活化的荧光分子，在特定波长和强度的光照射下，其光谱特性会发生显着变化。在这里，我们提出了一种新型笼状 BODIPY（4,4-difluoro-4-bora-3a,4a-diaza-s-indacene）荧光团的新设计策略，基于使用光可去除保护基（PRPGs）与高还原电位，通过光诱导电子转移 (PeT) 作为光敏单元和荧光猝灭剂。2,6-二硝基苄基 (DNB) 笼式 BODIPY 被有效地光活化，在水溶液中的活化率超过 600 倍。然后，我们使用成熟的 SNAP 标签技术将此光活化荧光团与 SNAP（O(6)-烷基鸟嘌呤 DNA 烷基转移酶的突变体）配体相结合，以获得用于蛋白质动力学可视化的基于小分子的光学荧光笔。作为概念证明，我们展示了活细胞中具有 SNAP 标签的表皮生长因子受体 (EGFR) 融合蛋白的时空成像。我们还展示了使用组蛋白 2A 的融合蛋白与 SNAP 标签突出显示活斑马鱼胚胎中感兴趣的细胞。
• [EN] 7-PHENYLETHYLAMINO-4H-PYRIMIDO[4,5-D][1,3]OXAZIN-2-ONE COMPOUNDS AS MUTANT IDH1 AND IDH2 INHIBITORS<br/>[FR] COMPOSÉS DE 7-PHÉNYLETHYLAMINO-4H-PYRIMIDO[4,5-D][1,3]OXAZIN-2-ONE EN TANT QU'INHIBITEURS D'IDH1 ET D'IDH2 MUTANTS
  申请人：LILLY CO ELI

  公开号：WO2018111707A1

  公开（公告）日：2018-06-21

  A compound, as defined herein, or pharmaceutical composition containing the compound, for use in treating IDH1 or IDH2 mutant cancer and having the structure: (I).

  这个化合物，如本文所定义，或含有该化合物的药物组合物，用于治疗IDH1或IDH2突变癌症，其结构为：(I)。
• [EN] DYE COMPOSITIONS, METHODS OF PREPARATION, CONJUGATES THEREOF, AND METHODS OF USE<br/>[FR] COMPOSITIONS DE COLORANT, PROCÉDÉS DE PRÉPARATION, CONJUGUÉS ASSOCIÉS, ET PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：UNIV CORNELL

  公开号：WO2013109859A1

  公开（公告）日：2013-07-25

  Dye compounds of the formula (1) wherein A is a protective agent group that has a characteristic of modifying the singlet-triplet occupancy of the shown cyanine moiety, and M is a reactive crosslinking group or a group that can be converted to a reactive crosslinking group. Methods for synthesizing the dye compounds and applications for their use are also described.

  化合物的染料的公式（1），其中A是一种保护剂基团，具有修改所示青菁基团的单三态占据特性，而M是一种反应性交联基团或可转化为反应性交联基团的基团。还描述了合成染料化合物的方法以及它们的用途。
• 一种β-氯乙基亚硝基脲类化合物及其合成方法 和用途
  申请人：北京工业大学

  公开号：CN104031048B

  公开（公告）日：2016-03-09

  本发明涉及一种新型的β-氯乙基亚硝基脲类化合物及其合成方法和用途，所述β-氯乙基亚硝基脲类化合物的结构如通式(Ⅱ)所示。本发明对通式Ⅱ中的化合物进行了体外抗肿瘤筛选试验。结果表明，通式Ι中的化合物对人脑神经胶质瘤细胞SF763、SF767、SF126、SF188，人结肠癌细胞HT29和小鼠白血病细胞L1210等多种肿瘤细胞系均有明显的抑制作用，且比现有的CENU及其与O6-苄基鸟嘌呤的联合用药具有更高的肿瘤抑制活性。
• Synergic “Click” Boronate/Thiosemicarbazone System for Fast and Irreversible Bioorthogonal Conjugation in Live Cells
  作者：Burcin Akgun、Caishun Li、Yubin Hao、Gareth Lambkin、Ratmir Derda、Dennis G. Hall

  DOI：10.1021/jacs.7b08693

  日期：2017.10.11

  demonstrated using a SNAP-tag approach to install the boronic acid reagent onto the extracellular domain of the Beta-2 adrenergic receptor in HEK293T cells, followed by incubation with the optimal thiosemicarbazide-functionalized nopoldiol reagent labeled with fluorescein dye. Successful visualization by fluorescence microscopy was possible with a reagent concentration as low as 10 μM, thus confirming the potential

  使用无毒试剂的快速、高产和选择性的生物正交“点击”反应因其在活细胞中生物分子的缀合中的巨大效用而受到很高的需求。尽管为此目的开发了许多点击反应，但许多都与缺点和限制有关，这证明开发用于单标记或双标记应用的替代系统是合理的。最近的报告强调了硼酸酯形成的潜力，作为非生物硼酸和二醇之间的生物正交点击反应。硼酸酯的形成是一个快速脱水过程；然而，它在水性介质中本质上是可逆的。我们设计并优化了一个基于两种双功能试剂的协同系统，一种氨基硫脲功能化的 nopoldiol 和一种邻乙酰基芳基硼酸。两种试剂在高达 50 μM 的浓度下均显示出对 HEK293T 细胞的化学稳定性和无毒。所得硼酸盐/缩氨基硫脲加合物是中等大小的环，在低 μM 浓度下，在中性缓冲液中，在没有任何催化剂的情况下快速且不可逆地形成，核磁共振光谱测量的速率常数为 9 M-1 s-1。在竞争性硼酸存在下的对照实验显示没有交叉副产物，并证实