2-(4-methoxybenzyl)-5-{[2-(4-methoxybenzyl)-5-nitro-2H-pyrazole-3-carbonyl]amino}-2H-pyrazole-3-carboxylic acid | 625386-16-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯酚醚
• 英文名称: 2-(4-methoxybenzyl)-5-{[2-(4-methoxybenzyl)-5-nitro-2H-pyrazole-3-carbonyl]amino}-2H-pyrazole-3-carboxylic acid
• 英文别名: 2-[(4-Methoxyphenyl)methyl]-5-[[2-[(4-methoxyphenyl)methyl]-5-nitropyrazole-3-carbonyl]amino]pyrazole-3-carboxylic acid
• CAS: 625386-16-5
• 化学式: C₂₄H₂₂N₆O₇
• 分子量: 506.475
• InChiKey: DROBLNCPAUPTJP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.2
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  166
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(4-methoxybenzyl)-5-{[2-(4-methoxybenzyl)-5-nitro-2H-pyrazole-3-carbonyl]amino}-2H-pyrazole-3-carboxylic acid 在 1-甲基-3-氯吡啶碘化物 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 (S)-2-[(S)-2-({5-[(5-Nitro-1H-pyrazole-3-carbonyl)-amino]-1H-pyrazole-3-carbonyl}-amino)-3-phenyl-propionylamino]-3-phenyl-propionic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  具有肽识别元件的新型杂环β-Sheet配体

  摘要：

  本文详细介绍了新型β-sheet配体的设计，建模和合成以及光谱表征。这些化合物的特征是由氨基吡唑羧酸与天然存在的α-氨基酸的特定组合形成的肽嵌合结构。这些杂合肽在分子建模的帮助下被设计成主要以延伸的构象存在。它们所有的氢键供体和受体都可以在底面上对齐，从而获得与β-折叠的完美互补性。因此，氨基吡唑类化合物具有刚性和高效的DAD序列，可识别整个二肽片段，而天然的α-氨基酸被设计为模仿蛋白质中的识别位点，最终导致序列选择性蛋白质识别。合成规程要么依赖于具有PMB保护基策略的溶液相肽偶联，要么依赖于使用相同保护基的基于Fmoc策略的固相肽偶联。在溶液中，通过催化还原硝基吡唑羧酸前体制备关键的结构单元。随后，是（N- 1 ）-被PMB基保护，并通过HCTU-或T3P-辅助肽与二肽片段偶联而延长，然后PyClop-辅助与另一硝基吡唑羧酸构件偶联。使用热TFA对所有PMB组进行的最终同时脱保护，完成了

  DOI：

  10.1021/jo0496603
• 作为产物：
  描述：

  5-amino-2-(4-methoxybenzyl)-2H-pyrazole-3-carboxylic acid methyl ester 在 lithium hydroxide 、 2-氯-1-甲基吡啶碘化物 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 88.0h， 生成 2-(4-methoxybenzyl)-5-{[2-(4-methoxybenzyl)-5-nitro-2H-pyrazole-3-carbonyl]amino}-2H-pyrazole-3-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  Aminopyrazole Oligomers for β-SheetStabilization of Peptides

  摘要：

  本文介绍了利用设计的人工配体稳定δ-片材的一般概念。这些配体有两个主要特征：它们含有酰化的 3-氨基吡唑，具有 DAD 氢键供体和受体模式；它们被合成为低聚物，以增加它们与δ-片构象中的肽的氢键相互作用。二聚氨基吡唑可通过 N1-Boc 保护的氨基吡唑衍生物 1 与几种二氯酸反应，然后用三氟乙酸进行标准脱保护处理而获得。对于低聚物，对新的吡唑氨基酸进行 N1-PMB 保护，然后使用 PyClop 或 Mukaiyama 试剂与肽偶联进行迭代扩展，最终得到目标化合物。随后，所有的保护基团都在最后一步用温三氟乙酸进行脱保护。对两个二聚关键化合物 3b 和 3f 进行了不同温度下的核磁共振、NOESY 实验和 X 射线晶体学研究，以阐明它们在溶液和固体状态下的构象偏好。所有方法得出的结果都是一样的：两种配体都采用具有高度预取向性的扁平构象和正确的 DAD 模式，以便与扩展构象中的肽发生最佳相互作用。用朊病毒蛋白和阿尔茨海默氏症肽 Aβ (1-40) 进行的聚合试验表明，一些二聚体和寡聚体配体在极低浓度下就能产生很好的效果。

  DOI：

  10.1055/s-2003-41031

文献信息

• New Heterocyclic β-Sheet Ligands with Peptidic Recognition Elements
  作者：P. Rzepecki、H. Gallmeier、N. Geib、Katarina Cernovska、B. König、T. Schrader

  DOI：10.1021/jo0496603

  日期：2004.8.1

  completed the high-yield protocol, which works racemization-free. After preparing a similar key building block with an Fmoc protection at N-3, we developed a strategy suitable for automated synthesis of larger hybrid ligands on a peptide synthesizer. Attachment of the first amino acid to a polystyrene resin over the Sieber amide linker is followed by an iterative sequence consisting of Fmoc deprotection with

  本文详细介绍了新型β-sheet配体的设计，建模和合成以及光谱表征。这些化合物的特征是由氨基吡唑羧酸与天然存在的α-氨基酸的特定组合形成的肽嵌合结构。这些杂合肽在分子建模的帮助下被设计成主要以延伸的构象存在。它们所有的氢键供体和受体都可以在底面上对齐，从而获得与β-折叠的完美互补性。因此，氨基吡唑类化合物具有刚性和高效的DAD序列，可识别整个二肽片段，而天然的α-氨基酸被设计为模仿蛋白质中的识别位点，最终导致序列选择性蛋白质识别。合成规程要么依赖于具有PMB保护基策略的溶液相肽偶联，要么依赖于使用相同保护基的基于Fmoc策略的固相肽偶联。在溶液中，通过催化还原硝基吡唑羧酸前体制备关键的结构单元。随后，是（N- 1 ）-被PMB基保护，并通过HCTU-或T3P-辅助肽与二肽片段偶联而延长，然后PyClop-辅助与另一硝基吡唑羧酸构件偶联。使用热TFA对所有PMB组进行的最终同时脱保护，完成了
• Aminopyrazole Oligomers for β-SheetStabilization of Peptides
  作者：T. Schrader、P. Rzepecki、M. Wehner、O. Molt、R. Zadmard、K. Harms

  DOI：10.1055/s-2003-41031

  日期：——

  A general concept for the stabilization of β-sheetsby designed artificial ligands is introduced. The ligands have twokey features: they contain acylated 3-aminopyrazoles with a DAD hydrogenbond donor and acceptor pattern, and they were synthesized as oligomersin order to multiply their hydrogen bond interactions with peptidesin the β-sheet conformation. Dimeric aminopyrazoles wereaccessible by reaction of the N1-Boc-protectedaminopyrazole derivative 1 with severalacid dichlorides followed by a standard deprotection procedure withtrifluoroacetic acid. For the oligomers, N1-PMBprotection of new pyrazole amino acids followed by an iterativeextension protocol with peptide coupling using PyClop or Mukaiyama’sreagent led to the target compounds. All protecting groups weresubsequently removed in a final deprotection step with warm trifluoroaceticacid. Two dimeric key compounds 3b and 3f were examined by NMR at various temperatures,in NOESY experiments as well as by X-ray crystallography in orderto elucidate their conformational preference in solution and thesolid state. The emerging picture was the same for all methods: bothligands adopt a flat conformation with a high degree of pre-orientationand the correct DAD pattern for optimal interaction with peptidesin their extended conformation. Aggregation assays with the Prionprotein and the Alzheimer’s peptide Aβ (1-40)show highly promising results for some of the dimeric and oligomericligands at very low concentrations.

  本文介绍了利用设计的人工配体稳定δ-片材的一般概念。这些配体有两个主要特征：它们含有酰化的 3-氨基吡唑，具有 DAD 氢键供体和受体模式；它们被合成为低聚物，以增加它们与δ-片构象中的肽的氢键相互作用。二聚氨基吡唑可通过 N1-Boc 保护的氨基吡唑衍生物 1 与几种二氯酸反应，然后用三氟乙酸进行标准脱保护处理而获得。对于低聚物，对新的吡唑氨基酸进行 N1-PMB 保护，然后使用 PyClop 或 Mukaiyama 试剂与肽偶联进行迭代扩展，最终得到目标化合物。随后，所有的保护基团都在最后一步用温三氟乙酸进行脱保护。对两个二聚关键化合物 3b 和 3f 进行了不同温度下的核磁共振、NOESY 实验和 X 射线晶体学研究，以阐明它们在溶液和固体状态下的构象偏好。所有方法得出的结果都是一样的：两种配体都采用具有高度预取向性的扁平构象和正确的 DAD 模式，以便与扩展构象中的肽发生最佳相互作用。用朊病毒蛋白和阿尔茨海默氏症肽 Aβ (1-40) 进行的聚合试验表明，一些二聚体和寡聚体配体在极低浓度下就能产生很好的效果。