measured by ITC, is approximated to be 3.8 ± 0.4 mM. The crystal structure of NicF, determined at 2.4 Å using molecular replacement, shows that the enzyme belongs to the cysteine hydrolase superfamily. The structure provides insight concerning the roles of potential catalytically important residues, most notably a conserved catalytic triad (Asp29, Lys117, and Cys150) observed in the proximity of a
在好氧细菌中,
烟酸盐(
维生素B 3)氧化降解为
富马酸盐的倒数第二个反应是由
马来酸酰胺
水解酶(NicF)催化的
马来酸水解脱
氨成
马来酸。尽管已被认为是N-
杂环化合物细菌降解的模型系统,但直到最近才鉴定出编码该分解代谢途径酶的
基因簇,以允许对其机理的结构基础进行详细研究。在这里,克隆了来自支气管炎博德特氏菌RB50的Bb 1774
基因(假定标注为nicF),并从大肠杆菌中过表达和纯化了
重组酶,显示出可以有效地催化
马来酸水解成
马来酸和
铵离子。通过等温滴定量热法(ITC)对反应进行稳态动力学分析,得出k cat和K M值(pH 7.5和25°C)分别为11.7±0.2 s –1和128±6μM。观察到的K DNicF·
马来酸酯(E·P)配合物的Ic值也由ITC测量,约为3.8±0.4 mM。NicF的晶体结构通过分子置换在2.4Å下测定,表明该酶属于半胱
氨酸
水解酶超家族。该结构提供了有关潜在的催化重