5-formyl-3',5'-di-O-methyl-N-methyl-2'-desoxyuridine | 1321811-61-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-formyl-3',5'-di-O-methyl-N-methyl-2'-desoxyuridine
• CAS: 1321811-61-3
• 化学式: C₁₃H₁₈N₂O₆
• 分子量: 298.296
• InChiKey: HAIVCFQGZPMBKQ-HBNTYKKESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.69
• 重原子数：
  21.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  88.76
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N³-methyl-3′,5′-di-O-methyl-thymidine 在 二氧化氮 、 臭氧 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.67h， 生成 5-formyl-3',5'-di-O-methyl-N-methyl-2'-desoxyuridine 、 (5S,6S)-6-hydroxy-3',5'-di-O-methyl-N-methyl-5-nitrato-2'-desoxythymidine 、 (5S,6R)-6-hydroxy-3',5'-di-O-methyl-N-methyl-5-nitrato-2'-desoxythymidine
  参考文献：
  名称：

  在不存在和存在NO2•及其他自由基和非自由基氧化剂的情况下，环境自由基氧化剂NO3•对嘧啶核苷的氧化损伤

  摘要：

  分析在溶液中环境自由基氧化剂NO 3 •与全甲基化尿苷1和胸苷2的反应中形成的产物，发现在最初的NO 3 •在嘧啶环上引起氧化电子转移后，反应路径非常复杂。发现产物的形成不仅取决于核碱基的性质，而且取决于其他自由基氧化剂，即NO 2 •的存在。在1与NO 3 •的反应中，这是通过CAN光解产生的，除了形成高度氧化的核苷衍生物4作为主要产物，C–N糖苷键也确实发生了断裂，导致核糖内酯5和游离核碱基6的形成。建议的机理涉及在反应过程中原位生成NO 2 •，这会以自催化方式促进最初形成的自由基阳离子7转化为4。 当使用NO 2 •与O 3的反应生成NO 3 •时，与过甲基化尿苷1反应的最初形成的自由基阳离子7被NO 2 •迅速捕获，从而在自由基介导的乙烯基取代中生成5-硝基尿苷18反应。与此相反，在涉及胸腺嘧啶核苷2的反应中，在相似的条件下，获得了高度氧化的产物20和21作为主要化合物，这是由于加至C5-C6双键而产生的。NO

  DOI：

  10.1071/ch11446

文献信息

• Oxidative Damage of Thymidines by the Atmospheric Free-Radical Oxidant NO3•
  作者：Uta Wille、Catrin Goeschen

  DOI：10.1071/ch11102

  日期：——

  Analysis of the products formed in the reaction of nitrate radicals, NO3 •, with the N- and O-methylated and acetylated thymidines 1a and 1b revealed, for the first time, insight regarding how this important atmospheric free-radical oxidant can cause irreversible damage to DNA building blocks. Mechanistic studies indicated that the initial reaction step likely proceeds via NO3 • induced electron transfer at the pyrimidine ring, followed by deprotonation of the methyl group at C5. The oxidation ultimately leads to formation of nitrates 2, aldehydes 4 and, in the case of high [NO3 •], also to carboxylic acids 5. In addition to this, through a very minor pathway, loss of the methyl group at C5 also occurred to give the respective 2′-deoxyuridines 6. The nitrates 2 are highly labile compounds that undergo rapid hydrolysis during work-up and purification of the reaction mixtures, which could lead to serious misinterpretation of the experimental findings and reaction mechanism. Products resulting from NO3 • addition to the C5=C6 double bond in the pyrimidine ring were not observed. Also, no reaction of NO3 • with the 2′-deoxyribose moiety was detected.

  对硝酸根（NO3 -与 N-、O-甲基化和乙酰化胸腺嘧啶 1a 和 1b 反应形成的产物进行分析，首次揭示了这种重要的大气自由基氧化剂是如何对 DNA 构建模块造成不可逆损伤的。机理研究表明，最初的反应步骤可能是通过 - 诱导嘧啶环上的电子转移，然后 C5 上的甲基发生去质子化反应。氧化作用最终会形成硝酸盐 2 和醛类 4，在[ -]含量较高的情况下，还会形成羧基。 -]的情况下，还会产生羧酸 5。除此以外，通过一个非常次要的途径，C5 上的甲基也会发生脱失，从而生成相应的 2′-脱氧尿苷 6。硝酸盐 2 是高度易变的化合物，在反应混合物的加工和纯化过程中会发生快速水解，这可能导致对实验结果和反应机理的严重误解。 - 加到嘧啶环的 C5=C6 双键上所产生的产物未被观察到。此外，也没有观察到 - 与 2′-脱氧核糖分子的反应。