1-[(2S,3R,4R,5S)-3-Hydroxy-4-(tetrahydro-pyran-2-yloxy)-5-(tetrahydro-pyran-2-yloxymethyl)-tetrahydro-furan-2-yl]-1H-pyrimidine-2,4-dione | 288325-69-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-[(2S,3R,4R,5S)-3-Hydroxy-4-(tetrahydro-pyran-2-yloxy)-5-(tetrahydro-pyran-2-yloxymethyl)-tetrahydro-furan-2-yl]-1H-pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 288325-69-9
• 化学式: C₁₉H₂₈N₂O₈
• 分子量: 412.44
• InChiKey: MKSDSGIDYCYKAY-PLMPVDRUSA-N

物化性质

• 密度：
  1.38±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.25
• 重原子数：
  29.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  121.24
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[(2S,3R,4R,5S)-3-Hydroxy-4-(tetrahydro-pyran-2-yloxy)-5-(tetrahydro-pyran-2-yloxymethyl)-tetrahydro-furan-2-yl]-1H-pyrimidine-2,4-dione 在 吡啶 、 二乙胺基三氟化硫 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以64%的产率得到2'-deoxy-2'-fluoro-3',5'-di-O-tetrahydropyranyl-β-L-uridine
  参考文献：
  名称：

  2'-脱氧-2'-氟-l-尿苷核酸的合成与结构表征

  摘要：

  尽管开发了人工l- RNA/DNA 作为治疗分子，但对其化学修饰的深入研究仍然有限。在这里，我们合成了化学衍生的 2'-脱氧-2'-氟-l-尿苷结构单元并将其整合到寡核苷酸中。我们的热变性和酶消化实验揭示了它们卓越的稳定性。此外，确定了l型氟 DNA 的一种晶体结构来表征其旋向性。我们的结果揭示了通过氟修饰增加了l-螺旋稳定性，并为其未来的功能应用奠定了基础。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.1c01498
• 作为产物：
  描述：

  3,4-二氢-2H-吡喃 在 甲醇 、 对甲苯磺酸 、 sodium hydroxide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.5h， 生成 1-[(2S,3R,4R,5S)-3-Hydroxy-4-(tetrahydro-pyran-2-yloxy)-5-(tetrahydro-pyran-2-yloxymethyl)-tetrahydro-furan-2-yl]-1H-pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  [EN] NOVEL 3´-DEOXY-3´-METHYLIDENE- -L-NUCLEOSIDES
  [FR] NOUVEAUX 3´-DÉSOXY-3´-MÉTHYLIDÈNE- -L-NUCLÉOSIDES

  摘要：

  本发明包括新颖的3´-去氧-3´-甲基亚-β-L-核苷，包括这些化合物的药物组合物，以及治疗或预防病毒感染，特别是HBV和/或HIV感染的方法。根据本发明，提供了由式（I）表示的化合物，其中B从A1和A2中选择。

  公开号：

  WO2011075052A1

文献信息

• Synthesis and anti-viral activity of a series of d- and l-2′-deoxy-2′-fluororibonucleosides in the subgenomic HCV replicon system
  作者：Junxing Shi、Jinfa Du、Tianwei Ma、Krzysztof W. Pankiewicz、Steven E. Patterson、Phillip M. Tharnish、Tamara R. McBrayer、Lieven J. Stuyver、Michael J. Otto、Chung K. Chu

  DOI：10.1016/j.bmc.2004.12.011

  日期：2005.3.1

  of the N(4)-hydroxyl and the 2'-fluoro into one molecule, resulting (2'R)-d-2'-deoxy-2'-fluoro-N(4)-hydroxycytidine (23). However, this nucleoside showed neither anti-HCV activity nor toxicity. All the l-forms of the analogues were devoid of anti-HCV activity. None of the compounds showed anti-BVDV activity, suggesting that the BVDV system cannot always predict anti-HCV activity.

  基于发现（2'R）-d-2'-deoxy-2'-氟胞苷作为有效的抗丙型肝炎病毒（HCV）剂，一系列d-和1-2'-deoxy-2'合成了具有5-和/或4-位修饰的-氟核糖核苷，并评估了其抗HCV和牛病毒性腹泻病毒（BVDV）的体外活性。合成中的关键步骤，即2'-氟基团的引入是通过用氟化氢-吡啶或氟化钾对2,2'-脱水核苷进行氟化，或用DAST对阿拉伯糖核苷进行氟化来实现的。在合成的27个类似物中，只有5-氟化合物，即（2'R）-d-2'-deoxy-2'，5-difluorocytidine（13），显示出有效的抗HCV活性和对核糖体RNA的毒性。用硫醇基取代4-氨基会导致活性降低，而4-甲硫基取代的类似物（25）会抑制核糖体RNA。由于N（4）-羟基胞嘧啶核苷（NHC）先前显示出有效的抗HCV活性，我们将N（4）-羟基和2'-氟的两个功能合并为一个分子，得到（2'R）-d -2'-脱氧-
• SYNTHESIS AND IN VITRO ANTI-HCV ACTIVITY OF β-D- and L-2′-DEOXY-2′-FLUORORIBONUCLEOSIDES
  作者：Junxing Shi、Jinfa Du、Tianwei Ma、Krzysztof Pankiewicz、Steven E. Patterson、Abdalla E. A. Hassan、Phillip M. Tharnish、Tamara R. McBrayer、Stefania Lostia、Lieven J. Stuyver、Kyoichi A. Watanabe、Chung K. Chu、Raymond F. Schinazi、Michael J. Otto

  DOI：10.1081/ncn-200059224

  日期：2005.4.1

  5-fluoro compounds, namely β-D-2′-deoxy-2′,5-difluorocytidine (5), had anti-HCV activity in the subgenomic HCV replicon cell line, and inhibitory activity against ribosomal RNA. As β-D-N4-hydroxycytidine (NHC) had previously shown potent anti-HCV activity, the two functionalities of the N4-hydroxyl and the 2′-fluoro were combined into one molecule, yielding β-D-2′-deoxy-2′-fluoro-N4-hydroxycytidine (12)

  基于 β-D-2'-deoxy-2'-fluorocytidine 作为一种有效的抗丙型肝炎病毒 (HCV) 药物的发现，一系列 β-D- 和 l-2'-deoxy-2'-fluororibonucleosides合成了在 5 和/或 4 位进行修饰的 HCV，并评估了它们对 HCV 和牛病毒性腹泻病毒 (BVDV) 的体外活性。2'-氟基团的引入是通过用氟化氢-吡啶或氟化钾对 2,2'-脱水核苷进行氟化，或用 DAST 对阿拉伯核苷进行氟化来实现的。在合成的 27 个类似物中，只有 5-氟化合物，即 β-D-2'-deoxy-2',5-difluorocytidine (5) 在亚基因组 HCV 复制子细胞系中具有抗 HCV 活性，并且对核糖体 RNA。由于 β-D-N4-羟基胞苷 (NHC) 先前已显示出有效的抗 HCV 活性，N4-羟基和 2'-氟的两个官能团结合成一个分子，产生 β
• Structure−Activity Relationships of (<i>E</i>)-5-(2-Bromovinyl)uracil and Related Pyrimidine Nucleosides as Antiviral Agents for Herpes Viruses
  作者：Yongseok Choi、Ling Li、Sue Grill、Elizabeth Gullen、Chang Soo Lee、Giuseppe Gumina、Eisaku Tsujii、Yung-Chi Cheng、Chung K. Chu

  DOI：10.1021/jm990543n

  日期：2000.6.1

  using TMSI as the coupling agent. The synthesized compounds were evaluated in cell cultures infected with the following viruses: varicella zoster virus (VZV), Epstein Barr virus (EBV), and herpes simplex virus types 1 and 2 (HSV-1 and HSV-2). Among the tested compounds, beta-L-CV-OddU (29), beta-L-BV-OddU (31), and beta-L-IV-OddU (33) exhibited potent in vitro antiviral activity against VZV with EC(50)

  合成了一系列的（E）-5-（2-溴乙烯基）尿嘧啶类似物和相关的核苷，并评估了它们的抗病毒活性。（E）-5-（2-溴乙烯基）-2'-脱氧-L-尿苷（L-BVDU，2），1-（β-L-阿拉伯呋喃糖基）-（E）-5-（2-溴乙烯基）尿嘧啶（L-BVAU，4），（E）-5-（2-溴乙烯基）-1-（2-脱氧-2-氟-β-L-呋喃呋喃糖基）尿嘧啶（L-FBVRU，8）和（E）-通过合适的5-碘尿嘧啶类似物从L-阿拉伯糖合成5-（2-溴乙烯基）-1-（2-脱氧-2-氟-β-L-阿拉伯呋喃糖基）尿嘧啶（L-FBVAU，10）。D-和L-氧杂硫杂环戊烷和-二氧戊环衍生物13、16、20、21和29-34是通过使用TMSI作为偶联剂，使氧杂硫杂环戊烷和二氧戊环中间体与甲硅烷基化的尿嘧啶类似物进行糖基化反应制备的。在感染以下病毒的细胞培养物中评估了合成的化合物：水痘带状疱疹病毒（VZV），爱泼斯坦巴尔病毒（EB