5'-d(pTpC)-3' | 2147-10-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - （3'->5'）-二核苷酸和类似物
• 英文名称: 5'-d(pTpC)-3'
• 英文别名: 5'-TC-3'；d(pTC)；dpTpC；dpT-dC；2'-deoxy-cytidylyl-(5'->3')-[5']thymidylic acid；5'-O-Phosphorylthimidyl-(3'->5')-desoxycytidin；5'-O-Phosphoryl-thymidylyl-(3'-5')-2'-desoxy-cytidin；5'-Phosphat-thymidylyl-(3'->5')-desoxycytidin；5'-O-Phosphorylthymidylyl-(3',5')-2'-deoxycytidin；[(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,5R)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate
• CAS: 2147-10-6
• 化学式: C₁₉H₂₇N₅O₁₄P₂
• 分子量: 611.396
• InChiKey: NNBMRGPSPZLYDL-SWTKMSQOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.9
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  269
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-d(pTpC)-3' 在 2,2'-二硫二吡啶 、 三苯基膦 、 三丁基焦磷酸铵 作用下， 以 乙醇 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.45h， 生成 pppd(TC)
  参考文献：
  名称：

  A facile and effective synthesis of dinucleotide 5′-triphosphates

  摘要：

  We report on the successful synthetic procedure for the conversion of 5 '-monophosphorylated 2 '-deoxydinucleotides into their 5 '-triphosphate derivatives in satisfactory to excellent yields. The activation of the terminal phosphate group was achieved under the Mukaiyama conditions in the presence of a nucleophilic catalyst. The reaction conditions (solvent, counter ions, activation time and reagent excess) were optimized for all dinucleotides. (c) 2007 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2007.07.002
• 作为产物：
  描述：

  在 叔丁醇 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 5'-d(pTpC)-3'
  参考文献：
  名称：

  2-Oxoalkyl caged oligonucleotides: one-electron reductive activation into emergence of ordinary hybridization property by hypoxic X-irradiation

  摘要：

  电离辐射触发带有 2-氧代烷基离去基团的笼状寡脱氧核苷酸 (ODN) 的激活，产生相应的正常未笼状链。我们设计并合成了在给定胸腺嘧啶 N(3) 位 (doxoT) 处被 2-氧代丙基笼住的 ODN，以评估其单电子还原特性。在水溶液中进行缺氧 X 射线解时，笼状 ODN 释放 2-氧代丙基，产生相应的非笼状 ODN。限制性内切酶Swa I的消化表明，在缺氧条件下预照射的笼养ODN可以与其互补链形成普通双链体。

  DOI：

  10.1039/b618810a

文献信息

• TANAKA, TOSHIKI;YAMADA, YASUKI;IKEHARA, MORIO, CHEM. AND PHARM. BULL., 35,(1987) N 7, 2726-2733
  作者：TANAKA, TOSHIKI、YAMADA, YASUKI、IKEHARA, MORIO

  DOI：——

  日期：——